国家科技基础条件平台建设计划(505015) 作品数:10 被引量:62 H指数:5 相关作者: 李生斌 高雅 金天博 康龙丽 赖江华 更多>> 相关机构: 西安交通大学 西藏民族大学 四川省公安厅 更多>> 发文基金: 国家科技基础条件平台建设计划 国家自然科学基金 西安市科技计划项目 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 哲学宗教 更多>>
珞巴族群体8个X染色体短串联重复序列位点的遗传多态性 被引量:1 2007年 目的调查西藏珞巴族人群8个位于X染色体上的短串联重复序列DXS7133、XS6789、DXS6804、DXS8378、DXSl01、DXS7424、DXS7132和HPRTB的等位基因及基因型频率分布。方法用聚合酶链反应、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染的方法检测96名健康珞巴族无关个体的X染色体8个STR位点基因多态性。结果DXS7133、DXS6789、DXS6804、DXS8378、DXSl01、DXS7424、DXS7132和HPRTB分别检出5种、8种、7种、5种、8种、8种、8种和5种等位基因;基因型频率分别分布在0.0040~0.4800、0.0076~0.3214、0.0078~0.3359、0.0076~0.5606、0.0154~0.3615、0.0076~0.3214、0.0149~0.2910、0.0408~0.3980之间,此8个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。结论中国珞巴族X染色体8个短串联重复序列基因座群体遗传数据资料,可用于法庭科学个体识别、亲子鉴定、疾病相关研究及人类学研究。 康龙丽 马玉明 高放 余兵 李生斌关键词:X染色体 短串联重复序列 遗传多态性 云南彝族九个短串联重复序列位点遗传多态性 被引量:5 2006年 目的研究中国云南彝族人群的群体遗传结构。方法选择9个短串联重复序列(short tandem repeats,STR)位点(D3S1358、vWA、FGA、TH01、TPOX、CSFlPO、D5S818、D13S317、D7S820),采用STR复合扩增及荧光标记STR基因扫描技术,检测84名彝族无关个体血液样本。结果9个STR位点在84名云南彝族共检出69种等位片段,频率分布在0.0060-0.5060之间;检出164种基因型,频率分布在0.0119-0.4167之间。9个STR位点的基因型分布符合Hardy.Weinberg平衡定律(P〉0.05)。9个位点多态信息量分布在0.5804-0.8777之间,杂合度分布在0.6507~0.8002之间,个体识别力分布在0.7976-0.9558之间,除TPOX,TH01两个位点低于0.5外,其余7个位点的非父排除率分布在0.5207~0.8386之间。Neighbor joining(NJ)法构建彝族与云南地区其他11个少数民族的系统进化树显示:彝族首先与白族、普米族、德昂族、阿昌族、独龙族、怒族聚在一起,然后与傈僳族、傣族相聚,最后与景颇族、苗族、纳西族相聚。绪论获得了云南彝族9个STR位点的遗传多态数据,在人类群体遗传数据库建设、法医学亲权鉴定和个体识别研究及应用领域有重要价值。 高雅 金天博 赖江华 郑海波 李生斌关键词:彝族 基因扫描 遗传多态性 门巴族ABO血型系统基因频率的检测与分析 被引量:5 2006年 本文研究的是中国门巴族人群ABO血型系统遗传多态性与其他17个族群间的遗传关系.采用玻片法检测并分析了西藏100名门巴族人群的ABO血型分布;应用网络生物信息资源,收集了西藏昌都、林芝、拉萨、山南、日喀则、那曲藏族,青海贵南、黄南、西宁藏族,甘肃藏族,云南丽江藏族,内蒙古蒙古族,宁夏回族,陕西、河南、山东汉族等17个族群的相应资料,计算了他们间的遗传距离,并进行了聚类分析.结果表明西藏门巴族ABO血型系统的表型频率为O>B>A>AB(-A=0.2128,-B=0.2523,-O=0.4681,AB=0.0638),基因频率r>q>p(r=0.6770,q=0.1742,p=0.1488),符合我国ABO血型系统分布规律;遗传距离分析显示,门巴族与珞巴族距离较近(0.0851),其次为云南丽江藏族(0.0943)和西藏、青海其他地区藏族,最后是中国其他少数民族的汉、回、蒙古族.聚类分析与遗传距离分析结果基本一致.说明门巴族在遗传上与藏族的关系近于其他少数民族. 袁东亚 康龙丽 李生斌 邓天吉 阎春城关键词:门巴族 血型 基因频率 藏族X染色体10个STR位点的遗传多态性 被引量:19 2006年 目的研究西藏藏族X染色体上的10个短串联重复序列(DXS7423,DXS8378,DXS6799,DXS7424,DXS7130,DXS7132,DXS6789,DXSl01,DXS6804,DXS7133)的基因及基因型频率分布。方法随机抽取101名西藏藏族无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果。结果DXS7423,DXS8378,DXS6799,DXS7424,DXS7130,DXS7132,DXS6789,DXS101,DXS6804,DXS7133分别检出5种、5种、5种、9种、7种、7种、11种、9种、5种和4种等位基因;基因频率分别分布在0.0172~0.5610、0.0179~0.5595、0.0122~0.5614、0.0122—0.4024、0.0172—0.4828、0.0116~0.4035、0.0119~0.2857、0.0119-0.3774、0.0351-0.0.3929、0.0116~0.6786之间,此10个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。结论此10个X染色体STR位点有较高的个体识别率,在个体识别和女孩亲权鉴定中有较高应用价值.对疾病相关研究有重要意义。 高雅 金天博 余兵 杜宏 李生斌关键词:X染色体 短串联重复序列 遗传多态性 藏族 STR位点 内蒙古鄂温克族与其他14个民族的群体遗传关系 被引量:6 2006年 目的:研究内蒙古鄂温克族9个STR位点的群体遗传结构及其与其他14个民族之间的群体遗传学关系。方法:选择9个S豫位点(D3S1358,vWA,FGA,TH01,TPOX,CSF1PO,D5S818,D13S317,D7S820),采用复合扩增及荧光标记基因扫描技术,检测90名鄂温克族无关个体血液样本。对所得基因频率进行主成分分析。结果:9个STR位点在90名鄂温克族群体检出64种等位基因,频率分布为0.0056~0.4722;检出158种基因型,频率分布为0.0111~0.3000。9个STR位点的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P〉0.05)。主成分分析结果显示:满一通古斯语族的鄂温克族与蒙古语族、突厥语族距离较近,满一通古斯语族的鄂伦春族、突厥语族的裕固族和语系未定的朝鲜族明显离散。结论:获得内蒙古鄂温克族9个STR位点的群体遗传结构;阿尔泰语系相同语族的民族相对较为集中,分子遗传结构接近的民族其语言也相似。 高雅 金天博 李生斌关键词:鄂温克族 短串联重复序列 遗传多态性 主成分分析 西藏珞巴族15个STR位点遗传多态性研究 被引量:6 2006年 目的选择具有高度遗传多态性与稳定性的15个STR位点,进行西藏珞巴族、拉萨藏族、昌都藏族与亚洲其他人群的遗传关系分析。方法收集西藏珞巴族、拉萨和昌都藏族无关个体血样,利用AmpF/STR Identifiler试剂对样本DNA进行多重PCR扩增,产物在ABI 3100遗传分析仪上进行毛细管电泳和基因扫描及分型,并结合文献资料与中国其他21个民族群体、亚洲6个人群进行比较,绘制遗传树,分析西藏各民族与其他亚洲人群间的遗传关系。结果八个汉族群体首先聚类,广西五个民族首先聚类,两者共同与西藏珞巴族、拉萨藏族和昌都藏族聚类后,再与中华其他民族聚类,最后与亚洲6个人群及中国维吾尔族聚类。结论研究结果与各人群地理分布和历史基本一致,为研究珞巴族和藏族的起源、迁移、形成和发展提供遗传学依据。 袁东亚 康龙丽 赵健民 李生斌关键词:珞巴族 民族起源 进化树 DXS8378基因座等位基因分型标准物的制备及其遗传多态性 2008年 目的采用分子克隆技术制备X染色体DXS8378位点等位基因分型标准物,了解该STR位点在中国云南傈僳、普米、德昂三个群体的遗传多态性及其法医学应用价值。方法用PCR扩增和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,分离各等位基因片段,回收纯化后进行二次扩增,分别插入到pGEM(-T Easy质粒载体中,DNA测序证实插入片段的大小和结构,等位基因片段按国际标准进行命名后,经转化、扩大培养、扩增及再鉴定后制备出该位点的等位基因分型标准物,进行群体遗传学研究。结果得到DXS8378位点分型标准物,应用此分型标准物研究中国云南傈僳、普米、德昂族人群中基因型分布频率。结论该法制备的STR位点等位基因分型标准物适用于法医学鉴定实践,具有较高的应用价值,适合于群体遗传学的分析。 沈靓 魏曙光 王科 李正堃 赖江华关键词:短串联重复序列 重组质粒 遗传多态性 利用3个STR位点多态性研究云南19个不同民族的遗传学关系 被引量:4 2005年 目的选择具有高度遗传多态性与稳定性的9个STR位点,进行云南省19个不同民族的种族、民族间的遗传关系分析。方法主要进行了以下方面的研究:Hardy-Weinberg平衡吻合度检验、计算各群体间遗传距离、对各群体进行聚类分析、绘制遗传树等。结果各民族群体各位点基因型频率分布观察值与期望值符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。元江哈尼族与红河哈尼族、潞西阿昌族与潞西德昂族首先聚类,然后它们再次聚类;澄江回族与昆明汉族首先聚类后然后与景洪基诺族、贡山怒族聚类;罗平布依族与新平傣族、潞西景颇族与勐海布朗族,丽江傈僳族与澜沧拉祜族、澜沧佤族,红河拉祜族与剑川白族、丽江普米族各自先聚类,然后聚为一个大类;最后与贡山独龙族聚类。结论研究结果与各人群地理分布基本一致。且在对种族、民族间的遗传关系进行分析时,只有选择相同的、具有高度遗传多态性的DNA遗传标记,才可以相互比较、分析。 高雅 金天博 李生斌关键词:云南民族 STR 进化树 云南白族、傣族、彝族X染色体STR基因座的遗传多态性及其与中国5个主要民族的遗传关系 被引量:1 2009年 应用复合PCR及基因扫描技术,对云南白族、傣族、彝族人群X染色体3个STR基因座DXS6804、DXS6799、DXS7132的遗传多态性进行研究。白族89个样本中共检出18个等位基因,38个基因型,等位基因频率分布在0.0200~0.6400之间,基因型频率分布在0.0256~0.3333之间;傣族100个样本中共检出17个等位基因,24个基因型,等位基因频率分布在0.0135~0.7500之间,基因型频率分布在0.0385~0.5769之间;彝族88个样本中共检出20个等位基因,35个基因型,等位基因频率分布在0.0125~0.5875之间,基因型频率分布在0.0250~0.3500之间。群体遗传多态性指标及法医学应用指标统计结果显示,3个基因座在云南3个少数民族人群中均具有高度多态性。聚类分析和系统进化关系分析发现,彝族、白族、傣族与藏族之间的遗传关系较近。 魏曙光 杨丽 郑海波 沈靓 赖江华关键词:短串联重复序列 遗传多态性 STR遗传多态性研究中样本数量对等位基因检出数量的影响 被引量:19 2008年 以30个不同民族9个常染色体STR基因座(D3S1358,vWA,FGA,TH01,TPOX,CSF1PO,D13S317,D5S818,D7S820)的群体遗传研究数据资料为例,探讨群体遗传学研究中常染色体STR基因座等位基因检出数量与样本量之间的关系,即样本量对等位基因检出数量的影响。结果显示,在一定范围之内,样本量的大小与所观测到的不同基因座等位基因检出数量之间存在正相关关系。当超过一定范围时,样本量的继续增加不再明显影响等位基因的检出数量。杂合度较低的位点随样本量的变化波动较大,杂合度较高的位点随样本量的变化波动较小。 高雅 李生斌关键词:STR 样本量 等位基因