广东省科技计划工业攻关项目(2008A030203004)
- 作品数：5 被引量：46H指数：3
- 相关作者：王广华戴世鲲李翔谢练武郭雅涛更多>>
- 相关机构：中国科学院中国科学院研究生院广东省微生物研究所更多>>
- 发文基金：广东省科技计划工业攻关项目国家重点基础研究发展计划广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程更多>>
- 宏基因组学技术的研究与挑战被引量：21
- 2011年
- 宏基因组学研究作为研究微生物种群生态分布、群体遗传特征和基因相互作用的新兴学科领域,在很大程度上促进了环境微生物资源,特别是未培养微生物资源的开发利用,在土壤、海洋、人体医学、药物等各个领域的应用中取得了突破性的进展,为发现新的生物活性物质提供了新的有效途径。就宏基因组学研究进展进行综述,并重点介绍了宏基因组学研究中的机遇及挑战。
- 周丹燕戴世鲲王广华李翔
- 关键词：宏基因组学宏基因组文库
- 南海北部巴士海峡深海沉积物中细菌多样性分析被引量：11
- 2010年
- 从南海北部巴士海峡深海沉积物中提取到高质量的总DNA,通过TA克隆构建了含有23个可操作分类单元(OTU)的16S rRNA基因文库,选择各OTU中代表性克隆子进行测序与系统发育分析,结果表明,南海北部巴士海峡深海沉积物中细菌在系统进化树中至少分属于9个类群:其中放线菌Actinobacteria,变形细菌Proteobacteria,和浮霉菌Planctomycetes为优势种;其他细菌如疣微菌Verrucomicrobia,鞘脂杆菌Sphingobacteria,硝化螺旋菌门(Nitrospira),绿弯菌Chloroflexi,厚壁菌Firmicute,酸杆菌Acidobacteria等为非优势种群;另外有两个克隆子属于未知种群。在所获得的23个代表克隆子序列中,有11个序列与已知细菌的同源性≤95%,占到了所有序列的48%,这一结果说明在南海北部巴士海峡海区具有非常丰富的微生物多样性,这一海区蕴含着大量未知的微生物资源,因而值得进行进一步的研究探索。
- 孙慧敏戴世鲲王广华谢练武李翔
- 关键词：深海沉积物细菌多样性
- 溴代阻燃剂污染底泥与未污染底泥中细菌群落结构之比较分析被引量：2
- 2011年
- 【目的】通过免培养的分子生物学方法,比较受溴代阻燃剂污染严重的河流底泥和与未污染水库底泥中细菌多样性差异,解析二者间细菌群落结构,为污染河流的治理与生物修复提供相关的理论依据。【方法】从中国贵屿溴代阻燃剂污染区练江底泥样品和未污染水库底泥样品中分别提取微生物总DNA,用细菌通用引物27F和1500R扩增16S rRNA基因,构建16S rRNA基因文库。用HhaⅠ和HinfⅠ2种限制性内切酶对克隆子进行扩增产物rDNA的限制性酶切分析(ARDRA),挑取不同的操作分类单元OUT中的克隆进行测序并构建系统发育树,比较代表克隆子的基本分类类群和生物多样性构成。【结果】未污染水库底泥中细菌群落组成主要包括变形细菌门(Proteobacteria)的α、β、γ和δ4个亚门、浮霉菌门(Planctomycetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和厚壁菌门(Firmicutes)。优势菌是酸杆菌,占文库克隆的30.2%。污染河流底泥中细菌群落组成包括变形细菌门(Proteobacteria)的α、β、δ和ε4个亚门、浮霉菌门(Planctomycetes)、绿菌门或拟杆菌门(Chlorobi orBacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、待定菌群candidatedivision OP01、candidate division OP08和candidate division WS3的相似菌。优势菌是ε-变形细菌和绿弯菌,占文库克隆的44.9%。【结论】受溴代阻燃剂污染河流底泥中的细菌群落具有较高水平的多样性,与未污染底泥有显著区别,主要体现在ε-变形细菌和绿弯菌在细菌群落中具有优势地位。这种优势种群的改变可能与污染物的过度富集具有一定的相关性,对于我们进一步探索和了解溴代阻燃剂的微生物修复具有一定的指导意义。
- 赵恒芝戴世鲲孙伟王广华郭雅涛郭俊许枚英吴后波李翔
- 关键词：溴代阻燃剂细菌群落结构RRNA基因ARDRA
- 微生物降解多溴联苯醚研究进展被引量：9
- 2012年
- 多溴联苯醚(PBDEs)广泛用于电子电器设备、自动控制设备、建筑材料和纺织品等商品化产品中。作为工业阻燃剂,它是一类环境中广泛存在的全球性有机污染物。由于其结构稳定,难以降解,具有环境持久性、迁移性、生物富集性及对生物和人体具有毒害效应等特性,对其微生物降解的研究已成为当前生命科学的新兴热点。文章详细地探讨了国内国外微生物厌氧,有氧降解PBDEs以及其降解基因的最新研究进展,并针对目前的研究状况对今后PBDEs的微生物降解研究方向进行了展望。
- 郭雅涛吴后波王广华戴世鲲赵恒芝孙国萍许玫英李翔
- 关键词：好氧降解厌氧降解
- 链霉菌聚酮类次生代谢产物及其生物合成基因簇被引量：3
- 2009年
- 聚酮类抗生素在工业、农业和医药方面都具有重要的商业价值,至今通过美国FDA认证的聚酮类药物超过40个。随着分子生物学的发展,人们开展了抗生素合成基因簇的研究,并以此为基础发展了组合生物学,形成天然产物化学与分子生物学相结合的跨学科研究领域。本文以链霉菌为对象,对链霉菌产生的聚酮类抗生素的药物应用、聚酮合成酶(PKS)的研究及聚酮类药物的开发策略与前景作了相关介绍。
- 陈敏捷王广华戴世鲲谢练武李翔
- 关键词：链霉菌POLYKETIDE
