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国家高技术研究发展计划(2006AA10Z188)

作品数:17 被引量:166H指数:8
相关作者:王天宇黎裕宋燕春石云素刘颖慧更多>>
相关机构:中国农业科学院作物科学研究所河北北方学院广西大学更多>>
发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 17篇中文期刊文章

领域

  • 14篇农业科学
  • 7篇生物学

主题

  • 12篇玉米
  • 5篇胁迫
  • 5篇克隆
  • 5篇基因
  • 4篇逆境
  • 3篇启动子
  • 3篇干旱
  • 2篇性状
  • 2篇生物信息
  • 2篇生物信息学
  • 2篇生物信息学分...
  • 2篇逆境胁迫
  • 2篇旱胁迫
  • 2篇干旱胁迫
  • 2篇干旱诱导
  • 2篇QTL
  • 2篇表达基因
  • 1篇单倍型
  • 1篇单核
  • 1篇单核苷酸

机构

  • 16篇中国农业科学...
  • 6篇河北北方学院
  • 2篇广西农业科学...
  • 2篇广西大学
  • 2篇河南省农业科...
  • 2篇四川农业大学
  • 1篇河北农业大学
  • 1篇东北农业大学
  • 1篇河北科技师范...
  • 1篇河南农业大学
  • 1篇西南大学
  • 1篇扬州大学
  • 1篇新疆农业科学...

作者

  • 16篇黎裕
  • 16篇王天宇
  • 12篇石云素
  • 12篇宋燕春
  • 7篇刘颖慧
  • 4篇张登峰
  • 4篇李会勇
  • 2篇于永涛
  • 2篇荣廷昭
  • 2篇赵曦
  • 2篇张成伟
  • 2篇王荣焕
  • 2篇吴子恺
  • 2篇程伟东
  • 2篇谭贤杰
  • 2篇张中保
  • 2篇毛毅辉
  • 1篇卢敏
  • 1篇杜金友
  • 1篇朱春利

传媒

  • 6篇作物学报
  • 3篇玉米科学
  • 3篇植物遗传资源...
  • 1篇河北农业大学...
  • 1篇中国农业科学
  • 1篇遗传
  • 1篇Agricu...
  • 1篇植物学报

年份

  • 3篇2011
  • 8篇2010
  • 2篇2009
  • 3篇2008
  • 1篇2007
17 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
玉米ZmCIPK31基因原核表达及启动子序列分析
2010年
与钙传感器类钙调磷酸酶B蛋白(calcineurin B-like protein,CBL)互作的蛋白CIPK(CBL-interacting protein kinase)在植物特定的生长发育和应答胁迫过程中起重要作用。对前期研究得到的玉米ZmCIPK31基因构建原核表达重组载体,进行原核表达分析,转化重组质粒的大肠杆菌BL21菌株能够诱导出期望的目的蛋白。蛋白可溶性分析表明,它是可溶性的蛋白,通过淀粉树脂柱对其进行纯化,为下一步激酶活性分析提供了有活性的目的蛋白。同时,克隆了ZmCIPK31基因起始密码子ATG上游包括2189bp的启动子区段,顺式作用元件预测分析表明此区段不仅具有TATA-box和CAAT-box等启动子共有序列,还具有光应答、胁迫应答、发育相关、激素相关及其他功能未知的调控结构域。聚乙二醇(PEG)胁迫下,ZmCIPK31基因的诱导表达进一步表明其能够应答胁迫,且在地上部和根中的表达模式不同。
张成伟刘颖慧石云素宋燕春王天宇黎裕
关键词:原核表达启动子聚乙二醇玉米
植物中CBL-CIPK途径转导特异Ca^(2+)信号的分子机制被引量:13
2010年
Ca2+作为植物中普遍存在的第二信使,其信号传感器CBL(calcineurin B-like protein)及与CBL互作的蛋白CIPK(CBL-interacting protein kinase)所构成的CBL-CIPK信号转导途径在转导特异Ca2+信号过程中起重要的作用。由于植物同时受多种复杂环境因素影响,因此必须同时对各种复杂因素作出响应并转导并存的信号。CBL和CIPK在结构、表达以及功能上的特异性构成了CBL-CIPK途径能够转导特异Ca2+信号的分子基础。本文在介绍CBL、CIPK的基础上,着重对其组合成的CBL-CIPK途径转导特异Ca2+信号的分子机制进行综述。
张成伟王天宇黎裕
关键词:CBLCIPK
Haplotypic Structure and Allelic Variation of rab17,an ABA-Responsive Gene,in a Mini Core Set of Chinese Diversified Maize Inbred Lines被引量:1
2010年
Drought stress is one of the most important factors limiting maize production. Rab17 is an ABA-responsive gene and associated with drought tolerance. In order to identify haplotypic structure and mine allelic variants at tab17 locus, nucleotide diversity and linkage disequilibrium (LD) structure of rab17 were evaluated among a mini core set of Chinese diversified maize inbred lines. Totally, 19 SNP and 18 insertion/deletions (InDels) were identified, among which 81% were in non-coding regions and 19% in coding regions. The results showed that a high level of diversity appeared within 1 kb upstream of the rabl 7 locus, and declined quickly downstream of the gene region. Rapid decay of linkage disequilibrium of rabl 7 region with distance within 1 kb was detected. Functional markers which can be developed based on haplotype 14 are expected to have contribution to molecular breeding for drought tolerance.
YU Yong-taoWANG Rong-huanSHI Yun-suSONG Yan-chunWANG Tian-yuLI Yu
关键词:MAIZE
玉米PDI基因cDNA的克隆及生物信息学分析被引量:5
2008年
利用RT-PCR技术,从玉米花丝中克隆得到了玉米蛋白质二硫键异构酶(PDI)基因cDNA编码序列(GenBank登录号为EF532321)。生物信息学技术分析表明:该序列开放阅读框为1 542个碱基,编码513个氨基酸,组成的蛋白质分子式C2577H3980N648O771S11,分子量为56.7 kDa,等电点pI为5.01。基因进化树分析表明玉米中的PDI基因与水稻中的PDI基因具有较近的亲缘关系。亚细胞定位预测分析表明,该基因编码的蛋白定位于细胞的内质网。
王秀堂黄亚群李会勇石云素宋燕春黎裕王天宇
关键词:玉米蛋白质二硫键异构酶克隆生物信息学
关联分析在玉米遗传学研究中的应用被引量:12
2008年
关联分析为优异基因和等位基因的发掘提供了新的思路和途径。分析了关联分析在玉米遗传学中的应用过程,并总结各研究所得到的结论。随着分子生物学和基因组学的飞速发展,关联分析方法的应用必将对玉米的遗传改良和种质创新发挥重要作用。
赵曦王荣焕于永涛王天宇黎裕
关键词:玉米
关联分析及其在植物遗传学研究中的应用被引量:35
2011年
植物的很多重要经济性状均属于复杂性状。基于连锁分析的QTL作图是研究复杂性状的有效手段,但其尚存在一定的局限性。随着现代生物学的发展,一种基于连锁不平衡的新剖分复杂性状方法——关联分析法,开始应用于植物遗传学研究。与QTL作图法相比,应用关联分析法具有不需要构建特殊的群体,可同时对多个等位基因进行分析,定位QTL精度可达到单基因水平等优势。该文介绍了关联分析方法学的基础和特性,简述了其在植物遗传学研究中的进展情况,并对其未来发展和在植物遗传学研究中的应用进行了展望。
谭贤杰吴子恺程伟东王天宇黎裕
关键词:单倍型QTL
玉米泛素延伸蛋白基因ZmERD16的克隆、序列特征和表达分析被引量:9
2010年
在前期研究中发现一个玉米苗期早期应答干旱的EST序列与拟南芥泛素延伸蛋白ERD16序列同源性很高。本研究根据拟南芥AtERD16序列,应用同源克隆技术分离出玉米泛素延伸蛋白基因,命名为ZmERD16。ZmERD16的开放阅读框为390bp,编码129个氨基酸,等电点pI为9.94,分子量为14.7582kD。ZmERD16蛋白包含1个泛素单体蛋白,其后融合了53个氨基酸的核糖体多肽,属于泛素延伸蛋白亚族。ZmERD16具有4个外显子3个内含子的基因组结构,其启动子区域具有多个干旱、病害、水杨酸、乙烯、真菌等胁迫响应应答元件。蛋白结构预测显示ZmERD16无跨膜结构,定位于细胞质和细胞核中。利用实时荧光定量PCR对ZmERD16的组织表达特异性和在不同胁迫条件下的表达谱分析表明,ZmERD16在各组织中均表达,其表达量受盐、脱水、PEG、低温、高温、茉莉酸甲酯和水杨酸等多种胁迫信号诱导。推测ZmERD16可能参与玉米的多种胁迫信号传导和逆境应答进程。
陆月赏刘颖慧张登峰石云素宋燕春王天宇杨德光黎裕
关键词:玉米克隆逆境胁迫
玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析被引量:6
2011年
Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率。为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95份自交系的ZmRCA1进行测序,获得长约1 680 bp的基因组序列。多态分析表明,在1 680 bp的区间内共发现22个SNP和8个InDel,其中5个SNP和1个InDel变异产生氨基酸序列改变;频率在0.1以上的13个多态性位点共形成27种单倍型,利用6个多态性位点就可以分辨约90%的单倍型。ZmRCA1基因具有高度序列保守性,基因DNA序列相似性为97.9%,而氨基酸序列的相似性则达99.8%;中性检验表明,ZmRCA1基因符合中性进化模型假设,没有发生纯化选择。
谭贤杰宋燕春石云素程伟东吴子恺王天宇黎裕
基于元分析和生物信息学分析的玉米抗旱相关性状QTL一致性区间定位被引量:13
2010年
定位玉米基因组中一致的抗旱性区段是玉米抗旱分子育种的重要基础。本研究对至今发表的在干旱条件下定位的相关性状QTL信息搜集整理,以IBM2 2008 Neighbors为参考图谱,利用overview分析和元分析方法进行Meta-QTL(MQTL)检测,共发掘79个MQTL,生物信息学分析结果显示,有43个区间内包含抗旱相关基因信息,占检出MQTL总数的54.43%。基于MaizeGDB网站的Genome Browser中的遗传图谱与物理图谱的整合信息,进行MQTL物理距离的估算,根据maizesequence网站的玉米基因组序列信息,进行初步的抗旱基因预测表明,这些区段中包含丰富的MYB、bZIP以及DREB转录因子序列信息以及大量的LEA基因家族成员。
栗文娟刘志斋石云素宋燕春王天宇徐辰武黎裕
关键词:玉米抗旱性生物信息学方法
玉米液泡ATP酶亚基A基因的克隆及表达分析被引量:3
2008年
V-ATPase在植物应对非生物胁迫中起着十分重要的作用,对其关键亚基基因的克隆及分析有助于阐释其在逆境下的调节及响应机制。本文利用RACE技术从玉米自交系CN165花期水分胁迫下的总RNA中克隆出液泡ATP酶亚基A基因,命名为ZmVHA-A。该基因cDNA全长2414bp,含5′-UTR(293bp)、3′-UTR(257bp)及编码区(1863bp),编码620个氨基酸。序列比对及结构域预测结果表明,ZmVHA-A基因编码的氨基酸序列与亲缘关系比较接近的禾本科作物如水稻、小麦和大麦的氨基酸序列同源性分别达92.7%、89.8%和89.8%,且在编码蛋白的氨基酸序列上有两个与核苷酸的磷酸基团相互作用的保守结构域"GAFGCGKT"和"PSVNWLISYS",可见该亚基是相对保守的。Northern杂交分析结果表明,ZmVHA-A基因在花丝中被水分胁迫诱导表达且在苗期对盐胁迫、冷处理和ABA处理具有不同的表达响应方式,因此认为VHA-A基因是一个比较保守的功能亚基,并且通过转录表达调节参与了V-ATPase对逆境胁迫的适应。
毛毅辉李会勇王天宇荣廷昭石云素宋燕春刘颖慧黎裕
关键词:RACE胁迫玉米
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