国家自然科学基金(30670051)
- 作品数：7 被引量：76H指数：6
- 相关作者：邵宗泽赖其良刘秀片杜雅萍孙风芹更多>>
- 相关机构：国家海洋局第三海洋研究所厦门大学更多>>
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- 相关领域：生物学环境科学与工程更多>>
- 一株来自大西洋表层海水的烷烃降解菌Gordonia sp. S14-10的分离鉴定及其降解相关特性的分析被引量：10
- 2009年
- 【目的】本研究的目的是从大西洋表层海水分离筛选新的烷烃降解菌,了解其降解基因及降解特性,为海洋石油污染的生物治理提供材料。【方法】以柴油与原油作为混合碳源从大西洋表层海水样品中富集、并分离筛选出降解能力较强的烷烃降解菌。根据16SrRNA基因和其看家基因secA1序列确定其系统进化地位。分析了烷烃降解范围、表面活性剂产生能力及其他生理生化特性;利用已报道的兼并引物进行了烷烃羟化酶基因的PCR扩增及系统进化分析。【结果】分离筛选得到1株能够降解C10(C36直链烷烃的菌株S14-10。经16SrRNA基因序列系统发育分析表明它属于戈登氏菌属(Gordonia),与GordoniaterraeT同源性为99.86%,但secA1序列相似度仅为93.69%,可能为戈登氏属的一个新种。从该菌株中扩增得到了烷烃单加氧酶alkB和P450基因片段,它们与菌株Gordoniasp.TF6相应的基因序列具有最高相似度,分别为88.76%和99.61%。该菌能够产生糖脂类生物表面活性剂,将发酵液的表面张力降低到31.6mN/m。【结论】首次从大洋环境中发现了Gordonia属的烷烃降解菌,可能为该属的一个新种。菌株S14-10至少编码两套与烷烃降解相关的单加氧酶系统,对各种直链烷烃降解范围宽,能产表面活性剂,在海洋油溢污染的生物修复中有较好的应用前景。
- 王丽萍刘昱慧邵宗泽
- 关键词：烷烃表面活性剂
- 印度洋表层海水石油降解菌的多样性分析被引量：9
- 2010年
- 【目的】为了研究印度洋石油降解菌多样性,并获得新的石油降解菌。【方法】本研究通过印度洋表层海水样品采集、以柴油与原油1：1混合物作为碳源,从中富集、分离筛选石油降解菌,并通过PCR-DGGE对13个站点富集菌群的菌群结构进行分析。【结果】通过形态观察、生理生化反应和16SrRNA分析,共得到共29个属的51株不同的细菌,它们主要是属于α亚群和γ亚群。其中,Alcanivorax属（占18%）,Novosphingobium属（占10%）和Marinobacter（占6%）Thalassospira（占6%）为主要的优势菌。通过生态多样性分析表明,Shannon-Winner指数（H）为4.57968,说明其具有较高的多样性;均匀度指数（E）为0.8664771,表示其分布比较均匀。单菌实验表明,49株具有石油降解能力其中,Sinomonas,Knoellia,Mesoflavibacter等属的细菌为首次发现有降解能力。DGGE分析表明Alcanivorax属的细菌是印度洋表层海水中的重要石油降解菌。【结论】本研究首次揭示了印度洋表层海水中石油降解菌的多样性,并获取了若干在海洋石油污染生物修复中具有应用前景的降解菌。
- 吴常亮王鑫邵宗泽
- 关键词：生物降解石油海洋细菌多样性DGGE
- 南海南沙海域沉积物中可培养微生物及其多样性分析被引量：32
- 2008年
- 【目的】为了从南沙海域中分离获得微生物菌种资源,【方法】本文通过沉积物采样、可培养菌分离及16S rRNA鉴定,【结果】从22个站点的沉积物样品中获得349株细菌,分属于87个种。发现产芽孢细菌分布最广,并在10个站点的分离株中占多数;它们是Bacillus,Halobacillus,Brevibacillus,Paenibacillus,Pontibacillus和Thalassobacillus。其中芽孢杆菌(Bacillus)无论在数量上还是种类上都最多,分别属于34种,其中有8个可能的新种。此外,γ-Proteobacteria是分离率较高的另一亚群;其中,假单胞菌(Pseudomonas),海杆菌(Marinobacter),食烷菌(Alcanivorax)属的细菌最多。统计还发现,在深度750～2000 m之间,低GC含量的细菌最丰富,而深度2000 m以下,分离株则全部为γ-Proteobacteria。【结论】南沙沉积物可培养微生物中产芽孢细菌及γ-Proteobacteria比较丰富;其中,产芽孢细菌的多样性最高,具有进一步研究开发价值。
- 孙风芹汪保江李光玉刘秀片杜雅萍赖其良邵宗泽
- 关键词：海洋细菌生物资源芽孢杆菌
- 不动杆菌生物乳化剂活性成分研究被引量：6
- 2008年
- 通过乳化活性分析、化学成分分析和相关基因的分析,对3株海洋来源的不动杆菌分离株和2种不动杆菌模式菌的生物乳化剂产生能力和活性成分进行了分析,结果表明,这些菌都能产生生物乳化剂.通过PCR检测,其中只有深海菌株wp02421编码与乳化剂Emulsan产生密切相关的酯酶基因.气质联用仪证明该菌所产的乳化剂含有脂肪酸组分,主要是正十六烷酸和正十八烷酸,表明菌株wp02421产生的乳化剂与Emulsan类似,糖脂是主要活性成分之一.此外,通过PCR检测,证明了5株不动杆菌全部编码外膜蛋白A基因(ompA).它们的氨基酸序列与Acinetobacter radioresistens KA53的乳化剂Alasan中的主要活性蛋白AlnA的同源性为71.26%～80.23%.以上结果表明,5株菌的生物乳化剂中都可能含有AlnA的乳化蛋白,而菌株wp02421同时还产类似Emulsan的糖脂.
- 李晴邵宗泽
- 关键词：不动杆菌酯酶外膜蛋白A
- 海洋烷烃降解菌Alcanivorax sp．A-11-3的分离鉴定及其降解酶基因研究被引量：14
- 2008年
- 从马六岬海峡的表层海水中分离到一株石油降解菌A-1l-3．经16SrDNA Blast结果表明其与Alcanivorax borkumensisSK2具有最高相似性为96％，该菌可能是食烷菌属的一个新种．该菌具有很强的石油降解能力．结果表明，A—11—3对烷烃的降解范围较宽，能以C8～C36的烷烃为唯一碳源和能源生长；在7d内该菌对柴油的降解率达到49．5％．此外，还从菌株中克隆到了大小为426bp的烷烃羟化酶基因alkB片段和843bp的P450烷烃羟化酶基因的部分序列．序列分析表明，alkB片段编码的氨基酸序列与4．60rkumensis SK2^T的AlkB1和AlkB2的同源性分别为57．75％和40．14％；该菌的P450与SK2菌株的P450具有最高同源性，为87％．研究结果对于海洋石油降解微生物生态研究及石油污染生物修复技术开发有参考价值．
- 吴业辉邵宗泽
- 关键词：石油降解菌
- 红灯食烷菌(Alcanivorax hongdengensis)黄素结合单加氧酶(AlmA)的基因克隆及其烷烃诱导表达被引量：9
- 2010年
- 【目的】研究海洋烷烃降解菌新种模式菌株Alcanivorax hongdengensis A-11-3降解长链烷烃的分子机制。【方法】PCR克隆编码黄素结合单加氧酶的基因序列,利用生物信息学软件对序列进行分析,运用RT-PCR和实时荧光定量PCR技术分析基因在不同烷烃诱导下的表达水平。【结果】从菌株A-11-3中克隆获得了两个黄素结合单加氧酶基因片段(almA1和almA2)。它们编码的氨基酸序列与菌株Acinetobacter sp.DSM17874的AlmA同源性分别为58.6%和53.2%。实时荧光定量PCR分析表明,almA1基因只在长链烷烃(C28-C32)的诱导下上调表达,而almA2基因中能在更宽范围的长链烷烃(C24-C34)和支链烷烃诱导下上调表达。两者均在C9-C22的烷烃诱导下没有上调表达。【结论】黄素结合单加氧酶可能是A-11-3降解长链烷烃和支链烷烃的关键酶。
- 王万鹏邵宗泽
- 关键词：长链烷烃生物降解
- 一株印度洋深海食烷菌(Alcanivorax sp．P40)的烷烃羟化酶基因的克隆被引量：5
- 2008年
- 以印度洋深层海水,用柴油和石油作为混合碳源经富集培养、分离获得一株具有很强的柴油降解能力的菌株P40.菌株P40革兰氏染色阴性,接触酶和氧化酶为阳性,能还原硝酸盐,不能还原亚硝酸盐.16S rDNA B lastn结果表明其与Alcanivorax dieseloleiB-5T(柴油食烷菌)及A.dieseloleiNO1A具有最高相似性,均为99.8%.菌株P40的gyrB序列与A.dieseloleiNO1A同源性也高达99.2%,而与A.dieseloleiB-5T只有86.9%.此外,从菌株P40中克隆到两个烷烃羟化酶alkB基因片断,分别命名为P40a-lkB1和P40a-lkB2.其中P40a-lkB1与报道的A.dieseloleiB-5T中的alkB同源性较高,达96.3%,而与同为深海来源的菌株NO1A的alkB的同源性更是达100%,P40a-lkB2则与A.borkum ensisSK2T(泊库岛食烷菌)的alkB1同源性最高,但仅为65%.
- 赖其良袁军邵宗泽
- 关键词：ALKBGYRB
