国家自然科学基金(30840030)
- 作品数：5 被引量：28H指数：3
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- MACF1相互作用蛋白的生物信息学研究被引量：2
- 2010年
- 微管微丝交联因子1(microtubule actin cross-linking factor 1,MACF1)是一种细胞骨架交联蛋白,可结合微管及微丝等细胞骨架组分,在协调细胞的发育及维持组织的完整性中具有重要作用。本文对与MACF1相互作用蛋白质的物化属性、亚细胞定位和分子功能进行鉴定,构建蛋白质相互作用网络。共预测出5个MACF1相互作用蛋白的亚细胞定位,网络分析结果提示MACF1可能通过竞争结合机制与SKIL、ATF7IP发生相互作用参与TGF-β信号的传递的调控,进而影响成纤维细胞表型变化;还可能与神经元细胞表面的受体分子发生作用,参与囊泡运输,促进神经元细胞粘附。
- 刘佳田宗成骞爱荣商澎
- 关键词：生物信息学GENEONTOLOGY蛋白质相互作用网络
- 细胞骨架染色中不同固定方法的探讨被引量：9
- 2010年
- 探讨不同细胞固定方法对细胞骨架染色的影响,以期发现适合于微丝与微管细胞骨架染色的固定方法。本文分别采用0.5%戊二醛、95%乙醇、4%甲醛及无水冷丙酮等四种固定液对人骨肉瘤细胞MG-63进行固定,然后分别对微丝和微管进行染色、封片,采用激光共聚焦扫描显微镜观察细胞微丝及微管骨架的形态。同时采用图像分析方法对细胞骨架微丝、微管荧光图像进行定量分析。结果表明,0.5%戊二醛固定的细胞,微丝呈清晰的束状纤维,微管呈有规律的束状纤维;95%乙醇固定的细胞,微丝纤维连贯性差,微管纤维非常清晰;4%甲醛固定的细胞,微丝纤维之间比较模糊,微管纤维呈圆弧状,联贯性较差;无水冷丙酮固定的细胞,微丝明显皱缩,呈模糊状,微管清晰可见,连贯性较好。因此,不同固定液固定的原理不同,要根据实验目的,选择合适的固定方法。
- 张维骞爱荣高翔胡丽芳瓮媛媛韩晶商澎
- 关键词：细胞骨架人骨肉瘤细胞
- Vinculin在细胞响应力学刺激中的作用被引量：6
- 2009年
- Vinculin是一种细胞骨架蛋白兼粘着斑组成蛋白,主要分布于细胞-细胞连接处及细胞-细胞外基质(extracellular matrix,ECM)粘着斑部位.Vinculin通过与多种粘着斑蛋白、细胞骨架蛋白及细胞骨架F-肌动蛋白相结合并相互作用,参与细胞的力-化学信号转导,在细胞粘附、伸展、运动、增殖、存活等过程中起重要作用.本文结合本课题组研究工作,在介绍vinculin分子结构的基础上,对其在细胞力-化学信号转导中的作用做一综述.
- 胡丽芳骞爱荣商澎
- 关键词：VINCULIN粘着斑细胞骨架信号转导
- 基于免疫荧光图像的微管蛋白半定量分析被引量：9
- 2009年
- 目的:建立一种基于免疫荧光图像的快速、简便、半定量分析微管蛋白的方法.方法:小鼠成骨样细胞MC3T3分别在正常及三维回转条件培养48h后,免疫荧光细胞化学技术标记对照组和回转组的成骨细胞微管骨架,激光共聚焦显微镜采集荧光图像;采用三种不同的专业图像分析软件SimplePCI,Imagepro-Plus6.0(IPP)及ImageJ定量分析三维回转培养条件对小鼠成骨样细胞MC3T3-E1微管细胞骨架的影响;用Western Blot检测α-微管蛋白表达量;用ImageJ软件确定MC3T3-E1细胞微管骨架的分形维数.结果:对采集到的细胞骨架荧光染色图像做定量分析发现,与对照组相比,经过48h三维回转培养,MC3T3-E1细胞图像的荧光强度明显降低(P<0.01);Western Blot结果表明,经过48h三维回转培养,MC3T3-E1细胞α-微管蛋白表达量表达量明显下降;Im-ageJ软件分析结果表明,经过48h三维回转培养,MC3T3-E1细胞微管的分形维数也明显低于对照组(P<0.05).结论:图像分析软件的结果和实验结果一致,表明基于免疫荧光图像的分析方法是可行的,为细胞形态学的定量研究提供了新思路和手段.
- 韩晶骞爱荣胡丽芳王哲于丹张蓉商澎
- 关键词：微管细胞骨架分形维数
- MACF1的生物信息学分析及细胞定位被引量：3
- 2009年
- 目的:了解微管微丝交联因子1(MACF1)的结构与功能.方法:采用生物信息学软件对MACF1结构、功能及亚细胞定位进行分析,并利用分子模拟软件对MACF1空间结构进行了模拟,同时采用免疫荧光显微术及共聚焦激光扫描显微术(CLSM)对生物信息学分析的部分结果进行了验证.结果:MACF1由5430氨基酸组成,Mr约为620×103,主要定位于胞质及细胞骨架.MACF1结构中包含1个ABD、37个血影蛋白重复单元、1个SH3结构域、2个EF手臂钙结合位点结构域、1个生长捕获特异蛋白2结构域等基序,并包含4个序列谱及5个序列模式.MACF1的德温特入藏号为Q9UPN3,MACF1包括4个亚型即MACF1/2/3/5,主要功能可能是将微丝、微管与其它骨架蛋白交联.同源模建结果表明,MACF1与α-辅肌动蛋白的ABD结构域一级序列的同源性为50.2%.免疫荧光显微术及CLSM结果表明,MACF1主要分布与细胞质,且与微丝、微管骨架部分共定位.结论:MACF1是一种大分子量的骨架交联蛋白,主要定位于细胞质,且与微丝、微管骨架部分共定位,MACF1结构功能可能与α辅肌动蛋白有一定的相似性.
- 骞爱荣张博胡丽芳张维瓮媛媛高翔商澎
- 关键词：生物信息学同源模建
