福建省自然科学基金(B0410007)
- 作品数：4 被引量：47H指数：2
- 相关作者：胡薇黄儒珠林思祖陈宇林来水更多>>
- 相关机构：福建师范大学福建农林大学更多>>
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- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 黑木相思基因组DNA的快速提取被引量：2
- 2009年
- 用SDS高盐介质法和1．5×CTAB法提取黑木相思幼叶及叶状柄基因组DNA，将其与2×CTAB法、3×CTAB法、改进的CTAB法进行比较，并用紫外光谱吸收、凝胶电泳、限制性内切酶消化、RAPD（Radomly Amplified Polymorphic DNA）和ISSR（Inter-Simple Sequence Repeat）等方法进行鉴定．结果表明，叶状柄多糖的质量分数较幼叶少，更易于基因组DNA的提取；SDS高盐介质法与1．5×CTAB法提取叶状柄的基因组DNA得率为180．0～697．5μg·g^-1，分子质量为48kb，D（260）／D（280）=1.750～1.955，无需经RNase处理，可直接用于限制性酶切和RAPD及ISSR分析；1．5×CTAB法所提的基因组DNA的纯度优于SDS高盐介质法．综合考虑认为，1．5×CTAB法可作为黑木相思基因组DNA快速提取的简便方法．
- 胡薇陈宇林来水林思祖陈国华(英文审校)
- 关键词：黑木相思基因组DNACTAB法
- 均匀设计优化建兰ISSR-PCR体系被引量：19
- 2007年
- 采用均匀设计,对影响建兰ISSR-PCR体系的引物、Mg2+、dNTP和TaqDNA聚合酶浓度等进行4因素5水平和4因素3水平两轮优化,建立了适合于建兰ISSR-PCR的反应体系:在20μL反应体系中,含引物0.25μmol/L、Mg2+2.5mmol/L,dNTP0.2mmol/L、TaqDNA聚合酶1.5U和模板DNA 40ng.在此基础上对扩增程序中的循环次数和退火温度,以及ISSR引物进行筛选.筛选获得的扩增程序为:94℃预变性5min;接着进行32个循环:94℃变性35s,52～56℃退火45s,72℃延伸90s;循环结束后,72℃延伸10min.同时筛选得到14个扩增稳定、多态性丰富的ISSR引物.
- 胡薇黄儒珠孙端饶春荣李锦凤
- 关键词：建兰ISSR-PCR均匀设计
- 建兰38个品种的RAPD分析被引量：24
- 2008年
- 应用RAPD标记对建兰38个品种的遗传多样性和亲缘关系进行分析。用筛选的18个10bp随机引物对其DNA进行PCR扩增,共扩增出116个位点,其中多态位点103个,多态位点比率占88·79%,表明建兰38个品种具有丰富的遗传多样性。38个品种间的遗传距离为0·0420～0·5385(均值0·2902)。基于RAPD标记的建兰38个品种的UPGMA聚类结果支持将建兰分为彩心和素心两个变种,以及素心多由彩心变异而来的传统分类观点。研究发现:引物S153-650bp位点是‘闽西鱼魫’、‘鱼魫大贡’、‘鱼魫’和‘银边鱼魫’的特异标记,引物S38-1200bp位点是‘十六罗汉’和‘鱼魫’的特异标记,引物S38-800bp位点缺失是‘马耳四季’的特异标记。
- 胡薇黄儒珠潘晓华李锦凤孙端
- 关键词：建兰聚类分析RAPD
- 均匀设计优化黑木相思ISSR-PCR体系被引量：2
- 2008年
- 采用均匀设计，对影响黑木相思ISSR-PCR体系的引物、Mg^2＋、dNTP、Taq DNA聚合酶和模板DNA浓度等进行5因素5水平和5因素3水平两轮优化，建立了适合于黑木相思ISSR-PCR的体系：在20μL反应体系中，含引物0.30μmol·L^-1，Mg^2＋ 3.00mmol·L^-1，dNTP 0.15mmol·L^-1，Taq DNA聚合酶0.75U，模板DNA 2.00ng·μL^-1。在此基础上对扩增程序中的循环次数、退火温度、退火时间进行筛选，获得的扩增程序为：94℃预变性5min；接着进行33个循环：94℃变性35s，52-61.5℃退火52s，72℃延伸90s；循环结束后，72℃延伸10min。同时筛选得到10个扩增稳定、多态性丰富的ISSR引物。
- 胡薇陈宇林来水林思祖
- 关键词：黑木相思均匀设计ISSR-PCR
