霍英东青年教师基金(81030)
- 作品数:8 被引量:33H指数:4
- 相关作者:沈南陈顺乐钱捷冯学兵顾越英更多>>
- 相关机构:上海第二医科大学附属仁济医院中国科学院上海生命科学研究院华东师范大学更多>>
- 发文基金:霍英东青年教师基金国家自然科学基金上海市科学技术发展基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 白细胞介素-10启动子区单核苷酸多态性与少儿系统性红斑狼疮相关性研究被引量:4
- 2002年
- 目的 探讨白细胞介素 (IL) 10启动子区近端三个单核苷酸多态性 (SNPs) ( 10 82 / 819/ 5 2 9)与少儿系统性红斑狼疮 (SLE)发病的相关性。方法 80例少儿SLE及家系中应用SNAP SHOT技术进行基因分型 ,经Genehunter 2 0软件统计分析三个SNPs基因型和单倍型 (ATA、ACC、GCC)与少儿SLE发病的相关性。同时分析单倍型 (ATA、ACC、GCC)与患儿某些临床表现之间的联系。结果 各基因型和单倍型与少儿SLE发病以及各单倍型与患儿的临床表现均无显著相关性。比较各单倍型分布频率发现 ,患儿GCC分布频率明显高于SLE成人期发病群体 ,而ATA分布频率则明显低于SLE成人期发病群体 ,ACC的分布频率在各群体中较为一致。此外 ,患儿和父母各单倍型分布频率差异未见有显著性。
- 金燕梁沈南顾越英
- 关键词:白细胞介素-10单核苷酸多态性系统性红斑狼疮儿童
- 中国人群16号染色体q12区存在系统性红斑狼疮易感基因被引量:17
- 2003年
- 目的 明确 16号染色体与中国人系统性红斑狼疮 (systemic lupus erythematosus,SL E)相关性 ,并对其进行易感基因定位以期发现疾病候选基因。方法 以 16号染色体遗传距离 5 7.79~ 6 5 .1c M的 5对微卫星标记 ,对 15 7个 SL E患者家系 DNA进行扩增 ,产物经 377DNA测序仪电泳 ,所得数据由Genescan软件收集 ,并以 ETDT及 Genehunter软件进行统计处理。在阳性位点处寻找疾病候选基因以实时 PCR进行基因表达研究。结果 D16 S4 0 9及 D16 S5 17与 SL E存在传递不平衡 ,其中尤以 D16 S5 17最为显著 (P<0 .0 0 0 1)。D16 S5 17中 ,2 71bp等位基因优先传递给患病子代 ,2 77bp等位基因则优先传递给正常子代。对候选基因的研究显示 OAZ(OL F1/ EBF- associated zinc finger protein)基因表达显著高于正常对照。结论 中国人群 16 q12区 (5 8.4 6 c M)与 SL E发病相关联。OAZ是该区域可能的疾病基因 。
- 冯学兵沈南陈顺乐钱捷吴慧鲍春德王元
- 关键词:系统性红斑狼疮16号染色体微卫星
- 系统性红斑狼疮患者16号染色体候选基因表达研究被引量:4
- 2003年
- 目的研究已发现16号染色体存在系统性红斑狼疮(SLE)易感位点,结合基因芯片结果,选择16号染色体OAZ、CARD15、DNAJA2、IL-4R4个基因作为候选基因进行表达研究。方法SLE患者42例(以SLEDAI进行活动性评分),正常人对照36例,抽提静脉全血RNA,逆转录为cDNA,加入相应的Taqman引物、探针在ABIPrism7900型高通量荧光定量PCR仪上进行荧光实时定量PCR,采用看家基因GAPDH进行标化。结果SLE患者OAZ基因表达水平为正常人对照的2.22倍,CARD15为2.51倍,均显著高于正常人对照(P<0.01);DNAJA2为1.19倍,与正常人比较差异无显著性;IL-4R为0.47倍,显著低于正常人对照(P<0.01)。结论SLE患者16号染色体存在疾病相关基因,OAZ、CARD15表达增高,IL-4R表达降低,这些基因参与了不同的调控通路,需要进行结构与功能相关性的研究以进一步明确。
- 冯学兵沈南陈顺乐钱捷吴慧
- 关键词:系统性红斑狼疮16号染色体易感位点免疫性疾病细胞增殖调控
- 早期B细胞因子相关锌指蛋白基因的变异与中国人群狼疮肾炎发病的相关性研究被引量:3
- 2005年
- 目的研究早期B细胞因子相关锌指蛋白(OAZ)基因内部的单核苷酸多态性(SNP)与中国人狼疮肾炎发病的相关性。方法选择OAZ基因内部阳性微卫星D16S517附近的8个SNP标记在184例系统性红斑狼疮(SLE)患者(83例狼疮肾炎患者和101例非狼疮肾炎患者)和286名正常人中进行等位基因分型,以Helixtree软件分析SNP分布情况。结果发现中国汉族人群中(1)SNPrs1344531等位基因(T)频率在SLE患者组(47.0%)和正常对照组(38.1%)中差异存在统计学意义(P=0.008);CC基因型的频率在SLE患者组(25.5%)显著低于正常对照组(38.1%,P=0.005)。(2)SNPrs1344531等位基因(T)频率在狼疮肾炎患者组(53.0%)和正常对照组(38.1%)中差异存在统计学意义(P=0.001);CC基因型的频率在狼疮肾炎患者组(22.9%)显著低于正常对照组(38.1%,P=0.013),TT基因型的频率在狼疮肾炎患者组(28.9%)显著高于正常对照组(14.3%,P=0.003)。(3)rs1420676rs1344531(CT)(P=0.001),rs3803665rs1420676rs1344531(CCT)(P=0.004),rs2292155rs3803665rs1420676rs1344531(CCCT)(P=0.002)等单倍型频率在狼疮肾炎患者组中较高。而rs1344531rs2080353(CA)(P=0.005),rs1344531rs2080353rs933564(CAG)(P=0.006)等单倍型的频率在狼疮肾炎患者组中较低。结论OAZ基因的变异可能在狼疮肾炎发病中发挥作用。
- 梁栋梁栋梁栋黄秀琴沈南毛寒倩汤建平冯学兵黄新芳汤建平陈晓翔陈顺乐顾越英
- 关键词:狼疮肾炎锌指蛋白基因发病等位基因分型C基因型单倍型频率
- 中国人群系统性红斑狼疮患者OAZ基因多态性研究被引量:3
- 2004年
- 目的 研究 OL F1/EBF相关锌指蛋白 (OL F1/EBF associated zinc finger protein,OAZ)基因单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism,SNP)与系统性红斑狼疮 (systemic lupus erythematosus,SL E)的关联性。方法 选择经过验证、杂合度较高的 SNP对 2 4 4个 SL E家系进行等位基因分型 ,以Genehunter软件分析单个位点及单倍型传递情况。检测 OAZ基因表达水平 ,比较患者中不同单倍型对基因表达的影响。结果 未发现单个 OAZ SNP位点在 SL E患病子代中优势传递。单倍型分析显示 ,由rs1344 5 31- rs2 0 80 35 3- rs9335 6 4 - rs1345 4 31构成的单倍型 T- A- G- G与疾病连锁性较弱 (P=0 .0 4 ) ,而Rs9335 6 4 - D16 s5 17构成的单倍型 G- 2 71bp、Rs2 0 80 35 3- rs9335 6 4 - D16 s5 17构成的单倍型 A- G- 2 71bp优势传递给患者 (P=0 .0 0 0 0 0 0和 0 .0 0 0 0 0 2 )。 Rs2 0 80 35 3- rs9335 6 4 - D16 s5 17- rs1345 4 31构成的单倍型 A- G-2 71bp- G也优势传递给患者 (P=0 .0 0 84 ) ,且该单倍型与基因表达水平相关。结论 SL E患者中存在特定的 OAZ基因单倍型 ,OAZ可能提示了狼疮发病的新通路。
- 冯学兵沈南罗玮琼张俪慧钱捷孙莉陈顺乐
- 关键词:系统性红斑狼疮锌指蛋白
- 系统性红斑狼疮患者16q12精细定位研究被引量:7
- 2004年
- 目的预初研究提示16q12区与系统性红斑狼疮(SLE)存在关联,本研究旨在对该区域精细定位,以明确16号染色体与中国人SLE相关性.方法在16号染色体57.79~69.05 cM(47 218~52 919 kb)范围内选择8对微卫星标记(D16S540、D16S3044、D16S409、D16S517、D16S3136、D16S416、D16S419和D16S3034),扩增288个SLE患者家系DNA,产物经377DNA测序仪电泳,所得数据由Genescan软件收集进行基因分型,以ETDT及Genehunter进行连锁不平衡分析.结果D16S409及D16S517与SLE存在传递不平衡(P=0.0048和P<0.000 01).D16S517中,271 bp等位基因优先传递给患病子代(P<0.000 01),277 bp等位基因则优先传递给正常子代(P<0.001).结论研究结果证实人类SLE在16号染色体上存在疾病易感基因,中国人群16q12区(58.46 cM,49 Mb附近)与SLE发病相关联.
- 冯学兵沈南罗纬琼张俪慧钱捷陈顺乐
- 关键词:系统性红斑狼疮基因分型
- 系统性红斑狼疮候选基因OAZ中单核苷酸多态性的系统筛选及相关分析被引量:1
- 2007年
- 目的研究OLFl/EBF相关锌指蛋白基因(OAZ)上的单核苷酸多态性(SNP)与中国人群系统性红斑狼疮(SLE)发病的相关性。方法利用243个中国SLE患者核心家系DNA.依据http://www.hapmap.org/数据库中的信息,选取了OAZ基因上的35个SNP位点进行等位基因分型,以Haploview、Genehunter和Fbat生物信息学软件分析其与中国人SLE发病的相关性。结果对等位基因分型结果进行家系传递不平衡检验(TDT),提示rsl420683,rs6500240显示传递不平衡,rsl420683等位基因G优势传递给患者,传递:不传递=86:50,P=0.002;rs6500240等位基因C优势传递给患者,传递:不传递=88:56,P=0.008。结论OAZ基因上的SNP位点rs1420683和rs6500240与SLE发病相关.未发现这两个位点的突变影响转录因子的结合,并且相互之间并没有存在强的连锁关系,可能与邻近的某个影响蛋白结构或表达的功能性SNP存在连锁不平衡,需要进一步研究证实。
- 陈静黄新芳唐元家钱晓霞倪旭鸣钱捷陈顺乐沈南
- 关键词:红斑狼疮多态性单核苷酸
- 儿童系统性红斑狼疮中白细胞介素-10启动子区单核苷酸多态性对自身表达水平的影响被引量:6
- 2003年
- 目的 探讨白细胞介素 (IL) 10启动子区近端SNPs( 10 82 / 819/ 5 92 )多态性对IL 10mRNA表达水平影响 ,从而明确该多态性对儿童系统性红斑狼疮 (SLE)发病的影响。方法 6 5例儿童SLE及家系中应用TaqmanPCR技术定量检测患儿及父母IL 10mRNA基础表达水平 ,结合此前曾对该样本进行的IL 10启动子区近端单核苷酸多态性研究结果 ,分析各单倍型尤其是GCC和ATA对IL 10mRNA表达水平影响。从另一个角度研判IL 10启动子区近端SNPs多态性与儿童SLE发病有无内在联系。结果 患儿中单倍型 10 82 G 819 C (GCC)显示与IL 10高分泌有关。结论 儿童SLE中单倍型GCC可能与IL 10高分泌有关 ,但不具备独立的调控作用 ,极有可能组合另一SLE易感基因共同调节IL 10高分泌从而影响儿童SLE发病。
- 金燕梁沈南顾越英
- 关键词:儿童系统性红斑狼疮白细胞介素-10单核苷酸多态性