北京市教育委员会科技发展计划面上项目(KM200710028013)
- 作品数:2 被引量:0H指数:0
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- 相关领域:生物学自动化与计算机技术更多>>
- 小立碗藓(Physcomitrella patens)植物microRNA结合靶位预测
- 2009年
- 利用857条植物miRNA序列对27546条小立碗藓mRNA序列进行搜索,预测出162个植物miRNA家族在小立碗藓中存在结合靶位。miRNA结合靶位数目和miRNA协同作用网络分析结果同时显示,miR482和miR1168在小立碗藓中结合靶位多、协同作用广,提示它们对于小立碗藓可能具有重要生物学功能。52个莱茵衣藻特有的miRNA被预测在小立碗藓中存在结合靶位,显示小立碗藓在从藻类向种子植物进化过程中处在独特演化位置。
- 陈文新李明浩孙静松蒋广龙姚建庄吴俊万平
- 关键词:小立碗藓
- 系统发育谱(Phylogenetic Profile)生成软件
- 2008年
- 系统发育谱生成软件(Phylogenetic Profile Generator,PPG)采用Microsoft Visual Basic和Perl两种语言编写,将构建系统发育谱所涉及的全部过程进行集成,用户只需提供原始的蛋白或核酸序列,软件即可生成所需的系统发育谱,并提供文本和XML两种形式的输出结果。软件具有Windows和Linux两个版本,可提供免费下载。软件下载地址:http://life.cnu.edu.cn/kexu-eyjshow.php?
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