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基于K-L散度的核磁共振波谱数据尺度缩放方法被引量：4: 2014年; 在基于核磁共振(NMR)的代谢组学数据分析中,尺度缩放是关键的预处理步骤之一,其主要目的是通过调整数据的方差结构,改善后续的多变量统计分析的结果。从信息熵的角度出发,利用KullbackLeibler(K-L)散度来度量不同实验分组的生物样品的1 H NMR波谱数据的差异程度,并结合单位方差缩放法,提出一种基于K-L散度的尺度缩放方法。该方法先利用单位方差法将数据各变量的标准差调整到同一水平上,再利用K-L散度对各变量进行有监督地加权,增强重要变量、减弱无关变量。由于K-L散度是在概率分布的意义上度量数据间的差异程度,且对于高斯和非高斯分布的数据均适用,因此能更准确地度量不同实验分组样品的1 H NMR波谱数据的差异性,从而更有效地地对谱数据的重要变量进行识别和加权。人群尿液1 H NMR波谱数据的分析结果表明,基于K-L散度的尺度缩放方法能有效抑制噪声变量,同时很好地区分特征变量和非特征变量;提高主成分回归(PCR)模型的判别能力;改善偏最小二乘回归判别分析(PLS-DA)模型的解释能力、预测能力以及对特征代谢物的辨识能力。; 邓伶莉Cheng Kian-Kai沈桂平周玲刘新卓董继扬陈忠; 关键词：核磁共振波谱代谢组学

家族性甲亢患者血清和尿液的核磁共振代谢组学研究被引量：18: 2013年; 采用基于核磁共振(NMR)的代谢组学方法,研究了家族性甲亢患者、非家族性甲亢患者和健康志愿者人群的血清和尿液的代谢差异.结果表明,家族性甲亢组血清样品中的乙酰乙酸、柠檬酸及牛磺酸等代谢物的浓度显著升高,超低密度脂蛋白、低密度脂蛋白、乳酸及甘氨酸等代谢物的浓度显著降低;尿样中的肌酐和葡萄糖的浓度显著升高,琥珀酸、苯乙酰甘氨酸及马尿酸等代谢物的浓度显著降低.以上结果表明家族性甲亢患者可能存在糖和脂类代谢的紊乱、肝脏和肾脏功能的损伤以及肠道环境的破坏等.此外,家族性甲亢组血清样品中的乙酰乙酸、葡萄糖、柠檬酸及肌酐等代谢物的浓度显著升高,表明家族性甲亢人群的肾脏功能受损更为严重,由此可区分家族性与非家族性甲亢的NMR代谢轮廓.; 沈桂平戴晓侠邓伶莉危阳洋许晶晶王彩虹董继扬陈忠; 关键词：核磁共振代谢组学

电针胃经穴大鼠体液的~1H NMR代谢轮廓分析: <正>胃粘膜损伤是由于情志应激、理化因素、微生物等因素引起的胃粘膜炎症、糜烂和出血的疾病。现代研究表明多种难治性胃病首先表现为胃粘膜损伤,进一步导致胃粘膜坏死、腺体萎缩、穿孔、癌变等恶劣后果。目前临床和实验研究皆证实针灸...; 许晶晶刘晓莎刘琼杨宗保董继扬陈忠; 文献传递

代谢组学方法在妊娠期糖尿病研究中的应用被引量：6: 2014年; 妊娠期糖尿病(GDM)易造成子痫前期、羊水过多、巨大儿等多种并发症。目前在妊娠中晚期检测血糖筛查GDM,确诊患者接受治疗的时间短,母婴健康存在严重隐患。代谢组学(metabolomics)是一种定量考察生命系统受内外界刺激或基因修饰后的代谢应答规律的学科。将代谢组学的方法应用于GDM研究,有望实现GDM的早期诊断,理解GDM的致病机制,对GDM的防治和母婴预后都有重要的意义。综述代谢组学方法在GDM及相关疾病研究中的应用。; 周玲沈桂平许晶晶邓伶莉董继扬黄秀敏; 关键词：羊水血浆代谢组学

啤酒化学组分的核磁共振波谱分析: <正>啤酒是为大众所喜爱的一种饮料。除了水和酒精外,啤酒还有大量营养成分。近年来,利用食品的化学组分信息进行产地溯源和质量鉴定,已成为食品领域的一个研究热点[1-3]。本文利用1H NMR技术分析啤酒的代谢轮廓,并结合多...; 栾晓菲郑彦婕沈桂平董继扬陈忠; 文献传递

glpK和rpoC基因突变对大肠杆菌生长的调节机制: <正>自2006年开始,基因组的重新测序有效地鉴定了细菌适于新环境时所引起的基因突变[1]。然而,相关的促生长机制还没有得到很好的诠释。本文联合利用代谢组学、蛋白质组学和脂类组学的方法对适于甘油的进化菌株中的glpK和r...; Kian-Kai ChengBaek-Seok LeeTakeshi MasudaTakuro ItoKazutaka IkedaAkiyoshi HirayamaLingli DengJiyang DongKazuyuki ShimizuTomoyoshi SogaMasaru TomitaBernhard O.PalssonMartin Robert; 文献传递

五常稻花香米的~1H NMR代谢轮廓分析: <正>五常大米是国家质检总局认定的地理标志产品。稻花香是五常大米中的一个独特品种,深受广大消费者的喜爱。然而,由于缺乏有效的鉴别方法,市场上假冒五常大米的情况日益严重。据报道,五常大米的年产量仅为80万吨,而全国各地的年...; 何瑶郑彦婕罗美中杨万颖许晶晶董继扬陈忠; 文献传递

妊娠期糖尿病患者体液~1H NMR代谢轮廓分析: <正>妊娠期糖尿病(GDM)是妊娠期常见的并发症之一,对母婴的危害极大[1]。GDM的病理机制尚未清楚,其早期诊断方法也不成熟。基于NMR的代谢组学研究机体内源性小分子代谢物的组成随疾病发生和发展的变化规律,为GDM的研...; 周玲Cheng Kian-Kai沈桂平许晶晶董继扬陈忠; 文献传递

不同牛磺酸水平下鱼类血清的代谢组学研究: <正>牛磺酸是鱼类正常生长过程中所需的营养物质之一[1]。研究表明,在大比例植物蛋白源的饲料中添加牛磺酸可以显著促进鱼类的生长,但牛磺酸的作用机制尚未清楚[2,3]。本文以罗非鱼为研究对象,利用基于NMR的代谢组学方法研...; 刘新卓周铭文叶继丹沈桂平董继扬陈忠; 文献传递

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