国家自然科学基金(31371252)
- 作品数：5 被引量：6H指数：2
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- 8个地理种群红条毛肤石鳖COI基因的遗传多样性分析被引量：3
- 2020年
- [目的]分析我国8个沿海潮间带红条毛肤石鳖地理种群的COI基因的遗传多样性。[方法]利用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增8个地区80个红条毛肤石鳖样品的COI基因。使用DNASP5.10.01、MEGA7.0等软件对所得序列进行分析,得到片段碱基含量、遗传距离以及遗传多样性参数等数据,并通过构建系统发育树的方式,结合遗传多样性数据分析结果。[结果]获得的COI基因片段长度为659 bp,COI基因位于线粒体编码区中,平均A、T、C、G的碱基含量分别20.4%、41.7%、14.9%和23.0%,存在明显的AT偏向,结合Acanthochitona crinita为外群系统发育树的结果来看,中国沿海地区红条毛肤石鳖种群分成2个明显的聚群,将它们定义为北方群体和南方群体,遗传距离为0.00066~0.08785。单倍型遗传多样性数据显示,多样性数值较高,但核苷酸多样性较低。[结论]红条毛肤石鳖北方群体的遗传多样性与南方群体存在差异,2个群体应该分别采取相应措施来保护遗传多样性。
- 徐浩文马铭黄玲
- 关键词：红条毛肤石鳖COI基因
- 7个地理种群小鼠TLR9基因的遗传多样性分析
- 2019年
- [目的]分析我国7个地理种群小鼠TLR9基因的遗传多样性。[方法]利用PCR技术扩增并测序7个地理种群100个小鼠样品的TLR9基因。使用MEGA7.0、DnaSP等软件对基因序列进行分析,计算遗传距离、遗传多样性,并构建系统发育树。[结果]获得的TLR9基因片段长度为1030bp,位于参与对病原体相关分子模式识别的LRR结构域的编码区,A、T、C、G的平均含量分别为22.9%、22.2%、32.8%和22.0%,各地理种群间碱基含量没有明显差异。通过计算各地理种群间遗传距离及核苷酸多样性发现,这7个地理种群小鼠TLR9基因序列较为保守,并无明显遗传分化。以褐家鼠(NM_198131)作为外群构建系统发育树,其结果与遗传多样性分析相一致。[结论]7个地理种群小鼠TLR9基因遗传多样性较低,具有极高的保守性。
- 冷冰霜于立强黄玲
- 关键词：小鼠
- 中国小家鼠细胞色素b基因序列分析被引量：1
- 2014年
- [目的]研究中国小家鼠的细胞色素b基因序列与DNA分类系统。[方法]对来自陕西汉中、新疆乌鲁木齐、云南昆明、湖北武汉和台湾等18个地区的20只小家鼠个体进行基因组DNA提取,细胞色素b基因的PCR扩增和序列测定,并分析碱基组成,构建系统进化树。[结果]20只小家鼠基因组大小均在20 000 bp以上;小家鼠细胞色素b基因序列中A、T、G、C的平均含量分别为31.6%、29.2%、12.2%和27.0%,个体间碱基组成几乎无差别;汉中、乌鲁木齐等长江以北的12个个体与M.m.musculus的系统发育关系为一支系,昆明、武汉、台湾等8个长江以南的个体与M.m.castanues的系统发育关系较近。[结论]中国小家鼠以长江为界,可分为南北2大亚种,南方为M.m.castanues亚种,北方为M.m.musculus亚种。
- 徐健靖美东黄玲
- 关键词：细胞色素B系统进化树
- 我国不同地区小鼠Y染色体Zfy1基因遗传差异分析被引量：1
- 2019年
- [目的]对我国5个地区小鼠Zfy1基因进行遗传差异分析。[方法]通过对5个地区79个雄性小鼠样品进行DNA提取,PCR扩增后进行序列测定和分析。使用MEGA6.0和DNAsp等软件对获得序列进行分析,计算遗传距离,构建系统发育树。[结果]5个地区Zfy1基因碱基组成基本一致,碱基的平均含量为A 25.1%、T 39.6%、G 20.8%、C 14.4%,呈现出明显的AT偏向。79个样品共定义为13个单倍型,各单倍型间遗传距离小,无明显差异。以大鼠(GATN01000010)为外群,小鼠(NM_009570)为参照构建系统发育树,13个单倍型均处在同一分支上,无明显分化现象。[结论]我国南北方各地区间小鼠Zfy1基因无明显分化现象,基因差异性较小,具有极高的保守性。
- 陈梦璇于立强靖美东
- 关键词：小鼠Y染色体
- 3个群体小家鼠Sry基因序列分析被引量：2
- 2017年
- [目的]研究小家鼠3个群体间Sry基因序列。[方法]对来自临沂、漠河、云梦的33只雄性小家鼠个体进行基因组DNA提取,设计引物,对其Sry基因进行扩增和序列测定,并使用分子处理软件定义单倍型,分析碱基组成,构建系统发育树。[结果]33个样品全部测序成功,经过数据分析后得到以下结果:33个样品的Sry基因片段大小均在856 bp左右。对33个序列对比分析,共定义了7个单倍型,Sry基因碱基的平均含量分别为A 27.5%、T 30.7%、G 22.5%、C 19.3%,不同个体之间碱基无明显差异,遗传距离小。以大家鼠(KC215142)为外群,小家鼠(AF068054)为参照序列构建系统发育树,7个单倍型与小家鼠共处同一分支。[结论]南北群体的小家鼠Sry基因无明显差异,基因突变率极低,具有极强的保守性。
- 王金鹏杨晓莹于立强靖美东
- 关键词：小家鼠SRY基因
