国家高技术研究发展计划(2011AAl0A101)
- 作品数：3 被引量：42H指数：3
- 相关作者：张涛郑家奎曹应江杨莉蒋开锋更多>>
- 相关机构：四川省农业科学院重庆大学中国农业科学院作物科学研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划四川省财政基因工程专项资金项目四川省财政基因工程青年基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 水稻早衰叶突变体PLS2的遗传分析与基因定位被引量：10
- 2014年
- 叶片早衰引起叶绿素和其他大分子被降解,叶片光合能力降低。这个过程常伴随着活性氧(ROS)的积累,以及细胞中抗氧化酶(SOD、CAT和APX)活性的降低,衰老相关基因(SAG)表达量上调,最终导致整个植株过早成熟,产量降低。因此,研究水稻早衰遗传机制和基因功能对于水稻的遗传改良具有重要的作用和意义。PLS2是通过航天育种工程经空间辐射诱变得来的突变体,在孕穗期表现早衰。与野生型相比,PLS2的光合能力降低,株高变矮,节间和穗长缩短,分蘖数和有效分蘖数减少,穗粒数和结实率明显下降,千粒重降低,穗发育不良,灌浆不充分;叶片的CAT活性显著降低、H2O2积累、死亡细胞增加,叶绿体结构变差,叶绿体中淀粉和嗜锇颗粒增多。黑暗处理加速突变体叶片衰老,叶绿体超微结构球状化。利用PLS2/蜀恢527和PLS2/02428的隐性定位群体,将pls2定位在第3染色体标记RM14704(8 674 283 bp)与SL-I-5(8 758 394 bp)之间,物理距离84.11 kb,区间内包括14个基因,测序发现在LOC_Os03g15840第9个外显子第41位的C被替换为T,导致精氨酸(R)替换为半胱氨酸(C),LOC_Os3g15840编码水稻中的一个糖基转移酶(glycosyltransferases,GTs),可能是pls2的候选基因。为下一步调控基因的克隆和功能研究奠定了基础。
- 张涛孙玉莹郑建敏程治军蒋开锋杨莉曹应江游书梅万建民郑家奎
- 关键词：叶片衰老叶绿体图位克隆糖基转移酶
- 利用产量功能基因标记分析三系杂交水稻亲本的遗传多样性被引量：11
- 2014年
- 【目的】利用功能基因标记分析三系杂交稻亲本的遗传多样性。【方法】利用44个根据文献共同报道的QTL位点或者已经被精细定位或已克隆的与水稻产量性状基因紧密连锁的功能基因标记,以及29个覆盖水稻12条染色体的在三系杂交水稻亲本间多态性高、带型清晰、重复性好的SSR标记分析76个三系杂交水稻亲本的遗传多样性。按POPGEN32分析软件要求将PCR扩增产物的凝胶电泳结果数字化,将数字化的矩阵数据转换为基因型数据,在POPGEN32软件下计算等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、多态性位点百分率(P)、Nei’s遗传多样性指数(He),用于评价所有亲本材料的基因多样性;计算遗传分化系数(Fst)、Nei遗传距离(D),进行遗传结构和遗传关系检测。利用NTSYS-pc2.10e软件计算品种间遗传相似系数(GS),并根据GS按非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,绘制品种间遗传聚类树状图。【结果】44个功能基因标记中有37个标记具有多态性,多态性位点百分率(P)84.09%,共检测到86个等位基因位点,平均每个位点2.32个,变化范围2—4个;其中有效等位基因(Ne)62.95个,占73.2%,Nei’s遗传多样性指数(He)变幅为0.049—0.831,平均值0.585。76份材料间的遗传相似系数(GS)变幅为0.323—0.973,平均值0.650。聚类分析表明在遗传相似系数0.618处分为保持系和恢复系两类。保持系和恢复系间的遗传分化系数(Fst)为0.151,属高度遗传分化,Nei遗传距离(GD)0.185,类群内遗传距离相对较小,类群间遗传距离相对较大。29个SSR标记共检测到72个等位基因位点,平均每个位点2.48个,变化范围2—4个;聚类分析表明未能将保持系和恢复系分为两类,部分保持系聚类在了恢复系群,部分恢复系聚类在了保持系群。【结论】相对于普通分子标记,功能基因标记具有较高的DNA多态性检测效率,用于类群划分和种质资源的多样性分析等方面更具准
- 张涛杨蛟蒋开锋曹应江杨莉杨乾华万先齐游书梅罗婧高磊李昭祥郑家奎
- 关键词：水稻功能基因聚类分析
- 水稻产量相关性状QTL定位被引量：22
- 2013年
- 以来自泸恢99×日本晴F8代重组自交系的188个家系及双亲为研究材料,用在亲本间有多态性的207个DNA标记对群体进行基因型分析,构建了全长为2397cM,标记间平均距离为12.29cM,覆盖水稻基因组12条染色体的连锁图。于2011年正季分别在德阳和泸州两地种植于四川农业科学院水稻高粱研究所实验农场,考查了单株有效穗数、每穗颖花数、每穗实粒数、结实率、千粒重、单株产量、穗长和株高7个性状。用基于混合线性模型的QTL Network 2.0软件进行QTL定位、上位性分析及其与环境的互作分析。7个性状共检测到22个加性主效应QTL,位于除第6、11、12染色体外的9条染色体上,除每穗颖花数、每穗实粒数、结实率未检测到上位性效应外,其他5个性状共检测到7对上位性互作;另外只发现两个QTL与环境发生明显互作。所有加性×加性上位性互作的效应及贡献率均较小,未发现上位性互作效应与环境的显著互作。
- 赵建国蒋开锋杨莉杨乾华万先齐曹应江游书梅罗婧张涛郑家奎
- 关键词：上位性效应
