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预测[C,O,S]体系的稳定异构体被引量：2: 2008年; 采用DFT,QCISD及CCSD(T)方法对单重态和三重态的COS分子体系势能面进行了理论计算,在QCISD/6-311G(d)水平上得到4个过渡态连接的6个稳定构型.经动力学及热力学分析发现只有一个单重态线性的分子11(O—C—S)能够稳定存在.; 周中军刘慧玲黄旭日孙家锺; 关键词：密度泛函理论 COS 异构体势能面

均聚物链吸附在胶束表面上的非平衡态耗散粒子动力学被引量：4: 2011年; 利用平衡态耗散粒子动力学(DPD)方法研究了嵌段共聚物自组装形成胶束及均聚物链在其表面的吸附.采用非平衡态耗散粒子动力学(NEDPD)方法,通过加入剪切作用研究了均聚物的脱落和胶束的分裂过程.研究结果表明,在小的剪切速率下,胶束会带着均聚物滑动和滚动;在大的剪切速率下,胶束会完全破裂,组成胶束的嵌段共聚物也像均聚物一样被拉长;只有在适当的剪切速率范围内,才会有均聚物的脱落和胶束分裂的过程.通过分析给出了剪切速率大小与脱落时间的对应关系.; 李延春刘鸿黄旭日孙家锺; 关键词：剪切速率耗散粒子动力学嵌段共聚物胶束

Theoretical Mechanism Study of CH with C3H6: A detailed theoretical study is performed at the B3LYP/6-311G(d,p) and G3B3(single-point) levels as an attempt...; Chia-chung Sun; 文献传递

Exendin-4中13号残基的分子动力学模拟被引量：2: 2009年; Exendin-4作为胰腺GLP-1受体上的一种有效的激活剂,是一种含有39个氨基酸残基的多肽,其第13号氨基酸Gln突变为Tyr,使活性增强.应用分子动力学模拟方法,分别优化了突变前后,Exendin-4与蛋白的复合物结构,并对整体结构的性质、静电势、相互作用模式及能量进行了分析.阐明了Gln突变为Tyr的活性增强的内在原因,结果表明,突变的Exendin-4能够通过改变自身结构的局部柔性调整与蛋白受体相互作用,从而可以改善Exendin-4与其蛋白受体的结合能力.; 王嵩赵熹郑清川黄旭日孙家锺; 关键词：EXENDIN-4 分子动力学模拟复合物静电作用

恢复蛋白Recoverin正则模式分析的理论研究被引量：1: 2009年; 采用旋转平移块方法对Ca2+/豆蔻酰基开关进行了正则模式分析(NMA).研究结果表明,恢复蛋白(Recoverin)的T态的N-末端与C-末端易于发生刚体逆向旋转,一旦结合Ca2+,很容易发生构象变化,形成具有双向构象转变特征的I态.I态是一个中间结构,既可以发生构象回转到T态,又可以继续相对旋转到R态,使豆蔻酰基完全暴露,从而行使其信号传导生物功能.从低频振动模式分析可以看出,恢复蛋白具有构象转变这一本质属性.; 李吉来耿彩云步宇翔陈效华王军黄旭日孙家锺; 关键词：信号传导低频振动

NC3O分子体系的异构化及其结构和性能的理论研究: 2008年; 采用DFT,QCISD及CCSD(T)方法,对NC3O分子体系的异构化进行了系统的研究,得到了5个稳定的异构体,其中包括4个链状异构体和1个带有支链的平面结构异构体.这5个稳定异构体都具有较高的动力学和热力学稳定性.; 赵莹孙家锺黄旭日; 关键词：势能面异构体

二氯代丁二烯的内旋转被引量：5: 2010年; 采用DFT B3LYP方法和6-311G(d,p)基组研究了3种二氯代丁二烯分子((t,t)-1,4-DCBD,(c,c)-1,4-DCBD,2,3-DCBD)的内旋转.计算结果表明,3种分子发生内旋转的势能曲线具有相同的形状:在势能曲线上有2个能量极小点,分别为s-trans和s-gauche构型;有2个过渡态构型;s-trans构型是能量最低构型.(c,c)-1,4-DCBD的s-trans构型比(t,t-)1,4-DCBD的s-trans构型稳定,与实验结果相符合.; 肖翠平程建波李文佐宫宝安; 关键词：B3LYP

恢复蛋白EF-hand与钙离子去耦合作用的拉伸分子动力学模拟: 2009年; 恢复蛋白Recoverin是一重要的神经钙传感蛋白.为澄清EF-hand与Ca2+耦合/去耦合作用机制,采用拉伸分子动力学(SMD)方法对其进行了一系列等外力和等速度的非平衡分子动力学模拟.研究结果表明EF-2和EF-3loop区氨基酸螯合Ca2+能力大小顺序分别为Asn-76; 李吉来耿彩云步宇翔张亮张来斌黄旭日孙家锺; 关键词：信号传导

Lithium Salt of NH_2-substituted Graphene Nanoribbon with Twofold Donor-acceptor Framework: Large Nonlinear Optical Property: 2011年; Based on graphene, a new class of second-order nonlinear optical（NLO） material, the lithium salt of NH2-substituted graphene nanoribbon with the twofold donor（D）/acceptor（A） mode, was reported. Eight stable 2Li-2NH2-GNR lithium salts, especially cis lithium salts, display considerably large β0 values. The combination of NH2-substituting and cis Li-doping makes β0 greatly increased from 0（GNR） to 1.2×105―2.9×105 a.u.（cis-2Li- 2NH2-GNRs）. Our largest β0 value（2.9×105 a.u.） for cis-2Li-1,3-2NH2-AGNR is comparable to the record value of 1.7×105 a.u. for a long donor-acceptor polyene.; SUN Chia-chung

ClO自由基与CN自由基反应的密度泛函理论研究: 2009年; 应用量子化学从头算和密度泛函理论(DFT)对ClO与CN的双自由基反应进行了研究.结果表明,ClO自由基的O原子进攻CN自由基的C原子是主要的进攻方式,并形成了中间体1ClOCN.随后,中间体1发生异构化和分解反应得到热力学上可行的3种产物P4(ClNCO),P1(CO+ClN)和P3(NO+CCl).其中P4是主要产物,P1和P3是次要产物.与单态势能面上相比,三态势能面对整个反应的贡献可以忽略.; 杨宇红黄旭日孙家锺; 关键词：从头算密度泛函理论反应机理

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