中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(ITBB110202)
- 作品数：15 被引量：70H指数：5
- 相关作者：刘菊华金志强徐碧玉贾彩红张建斌更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院海南大学更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项“十二五”国家科技计划农村领域国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 香蕉MaCAM基因克隆及表达分析被引量：5
- 2012年
- 从香蕉根的cDNA文库中获得了一段香蕉钙调蛋白基因的片段,采用RACE技术获得其全长,命名为MaCAM。该基因全长845bp,编码149个氨基酸。生物信息学分析表明,该蛋白属稳定蛋白,其等电点为4.12,有2个保守的EFh功能结构域。与已知植物的钙调蛋白基因相比,一致性达90%以上。其中与粳稻、油棕、胡萝卜、甘蔗的CAM编码的氨基酸序列的一致性分别为99.33%、96.71%、98.00%、98.66%。系统进化树比对分析显示,香蕉与甘蔗的亲缘关系最为密切。器官特异性分析表明,MaCAM在香蕉的根、球茎、叶片、花和果实中均有所表达,在根中表达量最高,花中次之,而在叶片中的表达量最低。
- 于小萌徐碧玉刘菊华贾彩红张建斌王甲水金志强
- 关键词：香蕉荧光定量PCR
- 香蕉泛素结合酶基因的克隆及其功能初步分析被引量：2
- 2013年
- 根据香蕉根系均一化全长cDNA文库筛选出一个香蕉泛素结合酶基因的片段通过RACE技术克隆该基因,命名为mauce2。生物信息学分析表明,该基因全长为929 bp,有一个完整的ORF编码148个氨基酸,蛋白分子量为16 505.1 ku,理论等电点为8.41,是一个碱性氨基酸。与江南卷柏、大豆、苹果、拟南芥的同源性为97.97%、97.30%、96.62%、95.95%。器官特异性表达分析表明,该基因在各器官中均有表达,在花中表达量最高,根次之,叶中表达量最低。
- 李羽佳金志强刘菊华贾彩红张建斌王甲水许奕徐碧玉
- 关键词：香蕉克隆实时定量PCR
- MADS-box基因酵母双杂交系统的构建及鉴定
- 2011年
- 为研究香蕉中MADS-box基因相互作用的分子机理,筛选该基因表达产物在体内相互作用的靶蛋白,分别构建诱饵质粒载体和香蕉果实采后2 d的cDNA文库,采用共转化法转入酵母细胞中,经过初步筛选鉴定,证明已成功构建了MADS-box基因的酵母双杂交系统。该结果为发现MADS-box基因表达产物在体内相互作用的靶蛋白奠定了基础。
- 刘菊华徐碧玉张静张建斌贾彩红金志强
- 关键词：酵母双杂交
- 香蕉延长因子1A(MaEF1A)基因的分离及特征分析
- 2011年
- 采用筛选香蕉果实采后cDNA文库的方法,首次获得了一条长为1 341 bp的cDNA序列,命名为MaEF1A。生物信息学分析结果表明,它与麝香百合延长因子1A 3的mRNA有84%的同源性,与烟草延长因子1A的mRNA有83%的同源性,推测它可能为编码香蕉延长因子1A(elongation factor-1 alpha,EF1A)的基因。该基因包含了一个完整的ORF,肽链序列中含有GTP-EFTU、GTP-EFTU-02和GTP-EFTU-03 3个保守结构域。采用RT-PCR的方法对该基因在香蕉不同组织以及果实采后不同时期的表达特征进行了初步的研究。结果表明,该基因在香蕉不同组织以及果实采后各个时期都是差异表达的。该基因在香蕉根和花中的表达量最高,茎叶最低。在香蕉果实采后的表达量开始是呈逐渐升高的趋势,到香蕉果实采后第20天,该基因的表达量达到高峰,随后该基因的表达量就逐渐下降。这一变化过程与香蕉果实采后乙烯释放量的变化进程是一致的。
- 刘菊华徐碧玉陈敦忠张静张建斌贾彩红金志强
- 关键词：香蕉CDNA文库RT-PCR
- 香蕉品质相关功能基因组学的研究进展被引量：2
- 2012年
- 香蕉是重要的热带水果之一,是热区人民脱贫致富的主要经济来源。香蕉品质一直是人们关注的焦点。文章综述了近年来香蕉果实品质如成熟、软化、糖代谢及香气相关功能基因分离和鉴定等方面的最新研究进展,将有助于从源头上对香蕉进行创新性的探索与研究,支撑香蕉品质改良和新品种培育。
- 刘菊华徐碧玉张静王甲水贾彩红张建斌金志强
- 关键词：香蕉功能基因
- 香蕉谷胱甘肽过氧化物酶基因MaGPX的克隆和表达分析被引量：20
- 2012年
- 谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPXs)是机体内广泛存在的一种重要的过氧化物分解酶,是植物体清除活性氧的一种主要酶,与植物抗逆性密切相关。本研究中从香蕉根中克隆了一个编码谷胱甘肽过氧化物酶的cDNA,命名为MaGPX(GenBank登录号为:JX094345)。序列分析结果表明,该基因全长989bp,存在一个完整的开放阅读框504bp,编码168个氨基酸。氨基酸序列分析表明其具有GPX家族典型的保守结构域。与其他植物的谷胱甘肽过氧化物酶基因相比,具有较高的相似性。与水稻、谷子、小麦、大麦、玉米和甜橙编码的氨基酸序列的同源性分别为85.12%、84.82%、83.93%、83.33%、82.14%和80.36%。利用荧光定量PCR技术分析了该基因在香蕉不同器官中的表达特异性及不同胁迫条件下的表达特性,结果表明,MaGPX在香蕉的根、球茎、叶片、花和果实中均有所表达,其中在花和根中表达量较高,而在叶片中的表达量最低。在盐、涝害、干旱和枯萎病胁迫下MaGPX表达量升高,表明该基因表达具有器官差异性和受胁迫的诱导。本研究为进一步研究MaGPX的生物学功能及其应用奠定了基础。
- 张丽丽徐碧玉刘菊华贾彩红张建斌王甲水金志强
- 关键词：香蕉谷胱甘肽过氧化物酶非生物胁迫生物胁迫荧光定量PCR
- 染色质免疫共沉淀超声波破碎条件的研究被引量：2
- 2012年
- 意在找出拟南芥幼苗适宜的染色质免疫共沉淀(ChIP)超声波破碎的条件,为后期抗体的沉淀提供适当大小的片段。以拟南芥(Columbia ecotype)幼苗为材料,用1%浓度甲醛的缓冲液交联DNA和蛋白质,利用超声波将其染色质随机断裂成适当大小的片段。结果表明,适用于拟南芥幼苗的最佳ChIP试验条件为:用1%甲醛溶液交联DNA和蛋白质的复合物;用65%功率,每次工作20s,间隔4min,8次破碎该复合物,可以得到400～800bp大小的片段,用于后续的试验。经本实验的研究得到了拟南芥幼苗染色质免疫共沉淀超声波破碎的最佳条件,为后续实验奠定了基础。
- 张丽丽徐碧玉刘菊华贾彩红张建斌王甲水金志强
- 关键词：拟南芥
- 香蕉基因组测序及胁迫相关功能基因研究进展被引量：4
- 2012年
- 香蕉是重要的热带水果之一,是世界第四大粮食作物。香蕉抗性相关的功能基因组学研究一直是香蕉研究的热点和核心。综述了近年来香蕉基因组测序、胁迫相关功能基因分离和鉴定等方面的最新研究进展,将有助于从源头上对香蕉进行创新性的研究,为香蕉遗传改良和新品种培育提供一定的理论依据。
- 刘菊华徐碧玉张建平贾彩红王甲水张建斌金志强
- 关键词：香蕉基因组测序胁迫功能基因
- 香蕉茉莉酸合成关键酶基因MaOPR的克隆和表达分析被引量：3
- 2013年
- 从‘巴西’香蕉(Musaacuminata L.AAAgroup‘Brazilian’)根的cDNA文库中获得了一段12-氧-植物二烯酸还原酶OPR(12-oxo-phytodienoic acid reductase)基因的片段,RACE扩增获得全长,命名为MaOPR。该基因全长1512bp,存在一个完整的开放阅读框1287bp,编码429个氨基酸。生物信息学分析表明,该蛋白属稳定蛋白,等电点为8.11,具有一个活性位点,一个基质结合位点,一个黄素单核苷酸结合位点。序列预测分析该蛋白亚细胞定位为细胞质,其不属于跨膜蛋白且不存在信号肽。通过和已知植物的12-氧-植物二烯酸还原酶基因相比,同源性达到66%以上。其中与苜蓿、谷子、粳稻、紫云英的OPR编码的氨基酸序列的同源性均为71%。器官特异性分析表明,MaOPR在香蕉的根、茎、叶片、花和果实中均有所表达,其中在茎和果实中表达量较高。通过对其在ABA抑制剂、乙烯、枯萎病胁迫下的表达结果分析显示,该基因响应以上3种胁迫。
- 许奕徐碧玉宋顺刘菊华张建斌贾彩红金志强
- 关键词：香蕉荧光定量PCR
- 荔枝Asr基因的分离及功能分析被引量：4
- 2013年
- 从荔枝中克隆了1个ABA、衰老、成熟诱导基因的全长,命名为LcAsr,利用生物信息学对其进行分析,同时将LcAsr基因转入拟南芥(哥伦比亚型)中,对其中1个命名为35S::LcAsrD的株系进行了干旱处理。结果表明:该基因全长为1 177 bp,包含1个编码153个氨基酸的开放阅读框以及上下游分别含85、146个碱基的完整序列;LcAsr在荔枝各器官中组成型表达,其中在花中表达量最高,在果肉中表达量最低,在未覆盖保鲜膜的采后24 h的荔枝果实中表达量最大,在覆盖保鲜膜的果实中表达水平维持稳定;LcAsr蛋白定位于细胞核中;获得了4个转基因株系,其中35S::LcAsrD株系表现出较强的抗干旱胁迫能力。说明LcAsr作为缺水的保护性分子发挥着重要作用。本研究有助于了解采后荔枝果实失水的分子机理。
- 张静董凤英王家保刘菊华许奕徐碧玉金志强
- 关键词：基因表达水分胁迫
