湖北省教育科学“十一五”规划课题(2006B131) 作品数:10 被引量:25 H指数:3 相关作者: 杨纪青 袁磊 杨建强 杨莉 杨凤 更多>> 相关机构: 襄樊学院 湖北省农业机械化管理办公室 更多>> 发文基金: 湖北省教育科学“十一五”规划课题 湖北省高等学校省级教学研究项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 经济管理 政治法律 更多>>
烟草脉清病毒完整基因组上微卫星分布特性研究 2010年 借助MATLAB软件和最优完全子图算法,提取并展示NCBI数据库中烟草脉清病毒完整基因组(NC-003 378.1)上微卫星分布特性。结果表明,计算出了各种1碱-基组~6-碱基组在完整基因组序列上重复出现次数和出现位置,并展示它们的分布规律(指数函数)。烟草脉清病毒完整基因组上各种N-碱基组最大的重复出现次数,随N按指数函数数减少;各种N-碱基组重复出现次数由少到多排序的结果,重复出现次数随序号增加。该研究方法可以系统地运用到其他病毒完整基因组序列微卫星分布特性的提取和展示,从而为有效利用微卫星分布特性研究完整基因组的结构和功能、遗传和变异规律提供依据。 杨纪青关键词:完整基因组 微卫星 烟草马铃薯Y病毒完整基因组的统计特征 2011年 提取4个不同来源的烟草马铃薯Y病毒完整基因组的统计特征,并对它们进行聚类分析。在烟草马铃薯Y病毒完整基因组的碱基序列上,用每个碱基及其随后两个碱基所构成的三碱基组,排列成一个新的序列S,计算所有64种不同三碱基组在S上出现的概率,得到一个64维向量L;比较各个基因组的L向量,得到4个三碱基组(CAA、GAT、GTA、GAC),它们的概率有明显的差异。这4个三碱基组的出现概率与烟草马铃薯Y病毒基因组的遗传变异有着重要关联;4个不同来源的烟草马铃薯Y病毒完整基因组,按其遗传变异结果,形成两个大类。 杨硕 李建学Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组上微卫星分布 被引量:7 2010年 为了展示Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组上的微卫星分布特性。借助MATLAB软件、应用最优完全子图算法,提取并展示NCBI数据库中Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组(AF_188481.1)上的微卫星分布特性,计算1-碱基组至6-碱基组在完整基因组序列上重复出现的次数和位置,展示它们的分布规律(指数函数)。结果表明:Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组(AF_188481.1)上各种N-碱基组(N取1至6)最大的重复出现次数,随N按指数函数数减少;笔者提取和展示Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组序列微卫星分布特性(特别是微卫星各种N-碱基组重复出现的位置和次数)的方法,可以系统地运用到其他病毒完整基因组序列微卫星分布特性的提取和展示中,从而为有效利用微卫星分布特性研究完整基因组的结构和功能、遗传和变异规律提供完备、仔细的数据支撑。 杨纪青 杨硕 杨莉 袁磊 杨建强关键词:TOMATO LEAF CURL 完整基因组 微卫星 我国各省区煤炭生产数值分布的自组织分类 2009年 为实现煤炭生产数值分布的自组织分类,用SOM神经网络技术,以《中国工业统计年鉴》提供的我国各省区煤炭生产数据为学习和测试样本,训练和检测神经网络对我国各省区煤炭生产数值分布的自组织分类。实验显示:经过1000步的训练,SOM神经网络矩阵映射重复操作归类相同率,在剔除特异结果后达到90%以上。这一结果证实,利用SOM神经网络技术,可以对我国各省区煤炭生产数据参数组合取值分布进行客观分类。 杨纪青关键词:SOM神经网络 我国31个省区农村居民经济状况排序和聚类 被引量:2 2010年 为对我国31个省区的农村居民经济状况进行排序和聚类,借助MATLAB软件,对反映各省区农村居民经济状况的一些数据进行主成分分析和聚类分析。结果表明,综合评价得分较高的依次为:上海、北京、浙江、江苏、天津、广东、福建、山东、辽宁;综合评价得分较低的依次为:甘肃、贵州、西藏、新疆、云南。这31个省区农村居民经济状况与经济发展综合水平大致同步但不完全一致。农村居民经济状况的提升,有赖于整体经济发展水平的提高,应当统筹把握和全面协调城市与农村、工业与农业、发达地区与不发达地区、沿海地区与中西部地区的经济发展,使整个国家社会福利最大化。 唐君关键词:主成分分析 聚类分析 经济发展 马铃薯X病毒完整基因组上微卫星分布 被引量:5 2010年 本文利用自编计算机程序提取并展示马铃薯X病毒完整基因组(NC_011620.1)上微卫星分布特性。借助MATLAB软件和借用最优完全子图算法,分析NCBI数据库中该基因组(NC_011620.1)微卫星分布特性。结果表明,计算出所有各种N-碱基组(N取1至6)在完整基因组序列上重复出现次数和出现位置,展示它们的分布规律(指数函数),马铃薯X病毒完整基因组(NC_011620.1)上各种N-碱基组最大的重复出现次数随N按指数函数数减少;且呈现出重复出现次数由少到多排序,重复出现次数随序号增加;本文使用的方法,可以系统地应用到其它病毒完整基因组序列微卫星分布特性分析,从而为有效利用微卫星分布特性研究完整基因组的结构和功能、遗传和变异规律提供完整的数据支撑。 杨纪青 袁磊 杨凤关键词:马铃薯X病毒 完整基因组 微卫星 美国商品出口的实证分析与演化模型 被引量:1 2008年 该文根据美国商品出口1946-2004年的统计资料,借助于计量经济学方法,建立了美国商品出口演化模型,并得出如下结论:美国商品出口基本沿着其逻辑斯蒂路径正常演化,美国商品出口目前正高速增长,尚远离其相变点,将继续高速增长30年,至2040年以后渐渐接近其饱和水平329万亿美元。 杨纪青 杨硕 付平关键词:经济统计数据 实证分析 经济演化模型 经济预测 烟草丛顶病毒完整基因组上微卫星分布 被引量:3 2011年 为了提取并展示NCBI数据库中烟草丛顶病毒完整基因组(NC-004366.1)上微卫星分布特性,采用MATLAB软件和最优完全子图算法自编了计算机程序进行。结果表明,烟草丛顶病毒完整基因组上n-碱基组(n=1~6)最大的重复出现次数随n增加而按指数函数减少。 杨纪青 袁磊 陈洪萍关键词:完整基因组 微卫星 新农村建设中经济人利他行为对社会福利的影响 被引量:2 2010年 借助MATLAB软件利用自编程序,构造一个简明模型来仿真演示新农村建设中经济人利他行为对社会福利的影响。结果表明,在无强制机制约束条件下,无利他奖励机制的群体,利他倾向大的成员,其后期可配置资源和发展水平少于较自私成员;在无强制机制约束条件下,有事后奖励机制但无事后奖励预期的群体,利他倾向大的成员,其后期可配置资源和发展水平多于较自私成员;社会福利由于利他行为产生的利他社会效益,利他者获得的合作剩余和利他行为带来的荣誉义务效用而更大。由于新农村建设增加社会福利和发展农村生产力的一个有效途径是提升农民的理性模式和需求结构,为此可从群体和个人2个方面建立和完善利他行为奖励机制。 杨纪青 杨硕 华丽 袁磊 杨健强关键词:新农村建设 利他行为 经济人 社会福利 Study on Microsatellite Distribution in Complete Genomes of Tobacco Vein Clearing Virus 被引量:7 2010年 MATLAB software and optimal complete subgraph algorithm were used to extract and reveal the microsatellite distribution features in the complete genomes of the tobacco vein clearing virus (NC-003 378.1) from the NCBI database.The results showed that the repetitions number and their location of the N-base group has been extracted and displayed.The largest repetitions of N-base group in the complete genomes of the tobacco vein clearing virus was decreased as the exponential function with the increasing of N.The method used in this study could be applied to the extraction and revealing of the microsatellite distribution features in the complete genomes of other viruses,thereby provided a basis for the research of the structure and the law of function,inheritance and variation by the using of the microsatellite distribution features. 杨纪青