国家自然科学基金(30771855)
- 作品数：3 被引量：10H指数：1
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- 相关机构：军事医学科学院西安市疾病预防控制中心户县疾病预防控制中心更多>>
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- 西安地区汉坦病毒L及S部分片段的编码序列分析
- 2010年
- 应用巢氏PCR法从陕西西安地区间接免疫荧光抗原初检为阳性的黑线姬鼠标本中扩增汉坦病毒的L和S片段部分序列。序列分析显示：不同标本来源的汉坦病毒均为汉滩型病毒，彼此之间L和S部分片段序列同源性较高，与贵州地区优势汉滩型病毒S2／L4群毒株同源性最高，分别为95．0％～97．0％和97．7％～99．3％，但与该地区已报道的汉坦病毒同源性较低。系统发育树显示：所有来自西安的病毒株处在同一个进化分支上，但可分成两个较小的分支。证实目前检测到的西安地区流行的汉坦病毒株与贵州地区汉滩型病毒株亲缘关系最近，而与当地既往流行毒株的差异较大，究竟是西安地区汉坦病毒流行株发生了变化还是当地同时流行多种毒株还有待于进一步研究证实。
- 曹智伟左曙青马超峰陈志军曹务春
- 关键词：汉坦病毒同源性
- 西安地区2009年鼠类携带汉坦病毒的基因特征研究被引量：10
- 2011年
- 目的研究西安地区2009年捕获鼠类种类和携带汉坦病毒情况,分析汉坦病毒的基因特征。方法在西安地区近年来肾综合征出血热高发的户县、长安两区县以夹夜法捕鼠,记录鼠种和生存环境。无菌解剖后取鼠肺提取总RNA,扩增汉坦病毒M片段基因进行病毒分型,选取部分阳性标本进行病毒S片段和L片段序列测定和进化分析。结果 2009年两区县捕获鼠类共400只,其中黑线姬鼠244只,占61%,褐家鼠89只,占22.25%,小家鼠43只,占10.75%,其他鼠种24只,占6%;共检出汉坦病毒核酸阳性鼠肺86只,分型以汉滩型为主,占79.07%;病毒L片段与贵州代表株同源性为95%97%,S片段与贵州代表株同源性为97.7%99.3%。结论 2009年西安地区汉坦病毒宿主以黑线姬鼠、褐家鼠、小家鼠为主,汉坦病毒核酸阳性率较高;所携带病毒以汉滩型为主,病毒进化分析与贵州代表株高度同源。
- 李恒新马超锋左署青曹智伟蔡正华卢晓玲曹务春
- 关键词：鼠种汉坦病毒基因分型
- 自然感染的宿主动物和病人体内汉城型汉坦病毒S片段末端序列多样性研究
- 2013年
- 在汉城型汉坦病毒（Seoulvirus，SEOV）长期感染的Vero—E6细胞过程中发现，病毒在持续感染过程中存在RNA3’末端序列缺失现象，可能对病毒的持续感染有重要作用。而自然感染的宿主动物或病人体内病毒RNA末端序列的变异情况并不清楚。本文从SEOV感染的病例血块以及SEOV检测阳性的褐家鼠肺组织中提取RNA，测定病毒s片段末端序列，并进行RNA二级结构模拟。结果发现，自然感染的宿主动物褐家鼠体内的SEOVS片段5’末端、3’末端及双末端均可出现序列缺失，而感染病例体内的病毒仅在一个克隆检测到3’末端序列缺失。与长期感染的Vero．E6细胞感染模型中仅存在较短的3’末端序列缺失现象不同，宿主动物的克隆既有较短的3’末端序列缺失，也有5’末端和双末端序列缺失，另外还有典型的大片段序列缺失。不同序列缺失类型的RNA序列二级结构模型存在显著差异。自然感染的宿主动物和病人体内的SEOVS片段序列末端存在序列缺失多样性，但前者的多样化程度更高。因此我们认为这些序列缺失可能受宿主因素影响，并与病毒对宿主的持续感染相关。
- 彭毅左曙青江佳富杨红曹务春
- 关键词：准种基因缺失
