国家教育部博士点基金(20100062120002)
- 作品数：10 被引量：39H指数：5
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- 水稻干尖线虫X-box结合蛋白基因克隆及功能被引量：5
- 2014年
- 水稻干尖线虫不仅危害水稻等草本农作物,还侵染印度榕等乔本植物,对农林植物危害严重。为开发新的生物防治技术、鉴定具有生防潜力的基因,克隆了水稻干尖线虫X-box结合蛋白基因Ab-xbp-1。通过RNAi技术验证苏云金芽孢杆菌处理过程中Ab-xbp-1基因在水稻干尖线虫先天免疫激活过程中所起的作用。结果表明:Ab-xbp-1基因沉默后水稻干尖线虫免疫力下降,这一结果说明该基因具有生物防治潜力。
- 刘立宏王峰李丹蕾王步勇刘晓晗陈俏丽
- 关键词：水稻干尖线虫基因沉默苏云金芽孢杆菌
- 松材线虫Rbx1基因克隆及蛋白质结构分析被引量：2
- 2013年
- 为鉴定潜在的松材线虫防治靶标基因,应用SL法克隆到松材线虫Rbx1,并完成Rbx1蛋白质结构分析。松材线虫Rbx1与泛素途径多个蛋白发生互作。通过Rbx1与E2的分子对接研究,共发现Rbx1与E2分子间存在3个氢键,Rbx1含有1个E2契合"口袋"。分子动力学模拟表明,Rbx1的氮末端是其功能区域。松材线虫Rbx1是潜在的防治靶标基因,以该区域为靶位点设计抑制子或可达到防治该线虫的目的。
- 王步勇王峰刘立宏马玲胡庆东梁为玉高威
- 关键词：松材线虫分子动力学模拟
- 基于转录组的水稻干尖线虫锌指蛋白基因克隆及功能分析被引量：2
- 2015年
- 为了寻找线虫生殖相关基因,为开发线虫生殖抑制药剂提供理论基础,通过分析水稻干尖线虫转录组文库高通量测序数据,对Unigene进行KEGG路径分析,筛选出一个孕酮介导的卵母细胞形成代谢路径(progesterone-mediated oocyte maturation),并筛选出该路径的主要调控基因——锌指蛋白基因。通过同源序列比对发现水稻干尖线虫锌指蛋白氨基酸序列中含有核酸结合保守结构域NLS,进一步通过三维结构分析及分子对接验证该蛋白可与DNA分子结合。结果表明,水稻干尖线虫锌指蛋白可与其调控基因的启动子结合从而完成对孕酮介导的卵母细胞形成代谢路径的调控。通过本研究得出最终结论,水稻干尖线虫锌指蛋白具有生物防治价值,值得深入研究。
- 刘晓晗王峰李丹蕾董爱荣陈俏丽王博文零雅茗江珊段颜祯张玉洲
- 关键词：水稻干尖线虫锌指蛋白
- 栽培方式对黑木耳铅镉汞砷含量的影响被引量：5
- 2012年
- 为了探索木段法和菌袋法栽培对黑木耳重金属含量的影响,寻找科学栽培方法。通过采用单因素方差分析和多重比较的方法,对塔河县、绿春县和伊春市野生、木段法栽培和菌袋法栽培黑木耳样品的铅、镉、汞和砷含量进行差异显著性分析。结果表明:45个黑木耳样品铅含量0.15～0.57mg/kg;镉含量0.019～0.116mg/kg;汞含量0～0.56mg/kg;砷含量0.22～2.1mg/kg。野生黑木耳之间镉、汞和砷含量差异极显著。不同栽培方法之间铅、镉差异极显著,汞差异显著,砷差异不显著。由此得出,木段法栽培黑木耳重金属含量低于野生黑木耳及菌袋法栽培黑木耳;木段法栽培黑木耳重金属含量更容易控制,是较好的栽培方法。
- 李丹蕾董爱荣王峰金惺惺
- 关键词：黑木耳木段
- 水稻抗干尖线虫基因OC-XⅡ的克隆及表达研究
- 2015年
- 抗性验证试验表明籼稻大白谷抗水稻干尖线虫侵染。为进一步探究此抗性与病程相关蛋白——半胱氨酸蛋白酶抑制剂(Cystatin)的相关性,基于水稻基因组数据克隆籼稻大白谷Cystatin家族的OC-XII基因,分别进行OC-XII、JaponicaOC-XII和Indica-OC-XII蛋白质三维结构构建,并与水稻干尖线虫组织蛋白酶B(Cathepsin B)进行分子对接以验证OC-XII基因编码蛋白对Cathepsin B的抑制功能。通过荧光定量qPCR验证OC-XII基因在线虫侵染前后的表达特性,OC-XII蛋白可以与水稻干尖线虫Cathepsin B蛋白质特异结合,线虫侵染后OC-XII基因在浸染12h^2d期间表达量持续上调,侵染3d后下调。表明OC-XII基因在大白谷抗水稻干尖线虫侵染过程中发挥功能,具有对植物寄生线虫进行生物防治的潜力,有必要对其进行深入研究。
- 王峰陈俏丽李丹蕾零雅茗王博文张瑞芝贾岩岩李永航裴雨滢逯昕明
- 关键词：半胱氨酸蛋白酶抑制剂水稻干尖线虫组织蛋白酶B
- 松材线虫Bx-sHSP16A基因克隆及蛋白质结构研究被引量：2
- 2013年
- 分子伴侣小热激蛋白(sHSPs)是线虫度过高温环境的关键因子。为开发直接针对松材线虫的防治技术提供理论依据,对松材线虫小热激蛋白Bx-sHSP16A基因进行了研究。采用SL法进行基因全长克隆,STRING9.0进行蛋白质互作网络分析,NAMD2.9进行分子动力学模拟。本研究克隆到松材线虫小热激蛋白基因Bx-sHSP16A。Bx-sHSP16A具α-crystallin保守结构域"F-polar-R-polar-aromatic-x-L-P"序列和"I/L-x-I"序列,初步判断具备分子伴侣功能。Bx-sHSP16A与多个蛋白发生互作,深入研究这些蛋白有助于了解Bx-sHSP16A在应激反应路径中的作用。Bx-sHSP16A二聚体中A亚基的"I/L-x-I"序列可以嵌入B亚基的去水合位点,契合后氢键稳定,说明Bx-sHSP16A可以形成多聚体。在应激反应过程中,去水合位点与多聚体聚合相关,Bx-sHSP16A以多聚体形式发挥分子伴侣功能。
- 刘立宏王峰王步勇马玲杨洋崔伟婵
- 关键词：松材线虫多聚体
- C14族R2R3-MYB基因调控杨树抗锈菌过敏性反应被引量：5
- 2016年
- 由落叶松-杨栅锈菌引起的杨树叶锈病分布广泛,危害严重。为探究杨树C14族R2R3-MYB基因在杨树抗锈菌过敏性反应中的调控作用,对接种了落叶松-杨栅锈菌E4强致病性生理小种的2种杨树叶片进行症状观察、感病指数判定并对2种杨树C14族共6条R2R3-MYB基因表达量变化情况进行分析。接种7 dpi后,弱感病性树种杂交杨叶片产生的夏孢子堆数量显著少于感病树种欧美杨。杂交杨叶片4 dpi开始出现过敏性反应症状,欧美杨未观察到类似症状。表明过敏性反应可有效阻止锈菌夏孢子堆形成,降低杨树感病性。杂交杨与欧美杨R2R3-MYB基因表达量变化趋势相反,预测杨树C14族R2R3-MYB基因为杨树与病原互作过程中调控过敏性反应的正向调控因子。本研究为进一步系统研究杨树R2R3-MYB基因与过敏性反应的调控机理及杨树抗病育种工作提供理论依据。
- 牛春阳王峰李丹蕾陈俏丽张瑞芝
- 关键词：欧美杨落叶松-杨栅锈菌
- 水稻干尖线虫氨基肽酶基因克隆及功能初步分析被引量：3
- 2015年
- 为防治水稻干尖线虫病提供理论支持,研究了水稻干尖线虫氨基肽酶基因特征,并对其编码蛋白结构与功能进行分析。基于水稻干尖线虫转录组测序,并通过RACE技术,从水稻干尖线虫中克隆得到了一氨基肽酶基因AbAmpep。生物信息学进行基因分析,原位杂交实验进行表达定位分析。该基因CDS序列全长为2 787 bp,含有2个开放阅读框(ORF)。最长开放阅读框(ORF)大小2 661 bp,可编码886个氨基酸,蛋白分子量为101.74 k Da,理论等电点(PI)为5.78。编码蛋白氨基酸序列中具有2个Zn2+结合位点和1个Pep N保守结构域,有特征信号序列TISHELAHFW,属于谷氨酸锌蛋白(Glu Zincin)超家族。Ab-Ampep氨基酸序列同挑选的其他9种动物的氨基肽酶氨基酸序列进行多重序列分析,发现功能区域的氨基酸序列较为保守,Ab-Ampep与猪蛔虫(Ascaris suum)的氨基肽酶P(ERG83308.1)蛋白相似度最高为50%。系统进化树分析表明,Ab-Ampep与猪蛔虫(A.suum)的氨基肽酶P(ERG83308.1)蛋白在同一分支上,亲缘关系最近。蛋白质结构分析显示,α-螺旋为Ab-Ampep主要结构元件,能够形成金属离子Zn2+结合位点。原位杂交实验显示,经反义链探针处理的线虫在其生殖部位有颜色加深的杂交信号,该基因的表达位置主要在水稻干尖线虫的生殖部位。通过对水稻干尖线虫氨基肽酶基因研究,利用分子技术改造氨基肽酶或寻找氨基肽酶抑制剂,抑制氨基肽酶的表达,影响线虫生长发育,为防治水稻干尖线虫病提供新思路。
- 王步勇王峰李丹蕾马玲陈俏丽王博文
- 关键词：水稻干尖线虫基因克隆生物信息学分析原位杂交
- ‘大白谷’CC-NBS-LRR蛋白编码基因抗干尖线虫侵染时空表达研究被引量：5
- 2015年
- 为深入探究‘大白谷’(Oryza sativa L.ssp.Indica)感病的分子机理,以及抗病基因在发病过程中所起的作用,克隆了‘大白谷’CC-NBS-LRR蛋白编码基因Os11g RGA8,对Os11g RGA8基因进行了生物信息学分析,并对其在水稻抗干尖线虫侵染过程中的功能进行了研究。Os11g RGA8基因位于11号染色体,其编码蛋白含有733个氨基酸,等电点为5.99,相对分子质量为84355.07。序列分析表明该氨基酸序列含有RX-CC、AAA_22、NBS和LRR_4这4个结构域,Os11g RGA8基因编码抗病蛋白属于CC-NBSLRR抗病蛋白家族。Q-PCR结果显示,接种水稻干尖线虫SAMN02420038的籼型常规稻‘大白谷’,与CK组‘大白谷’相比,Os11g RGA8基因表达量表现为上调,且24 h内上调增幅较缓,48 h时上调增幅突然上涨,72 h时上调增幅又出现下降,表明该基因参与‘大白谷’天然免疫反应过程,在水稻干尖线虫侵染过程中起到一定抗性作用。
- 陈俏丽王峰李丹蕾孔畅仪牛春阳张瑞芝王博文刘爽史欣悦张荣
- 关键词：水稻干尖线虫
- 小兴安岭代表性菌物系统进化初步研究被引量：15
- 2012年
- 为探索小兴安岭菌物系统进化关系并验证可应用于该地菌物的分子钟校正时间标准,采集小兴安岭凉水国家级自然保护区代表性菌物25种,对ITS1、5.8S和ITS2 rDNA区域进行PCR扩增、测序。同源序列多重比对后分析序列特征。以核酸进化的最适模型构建最大似然树、最大简约树和邻接树,自展检验重复1 000次估计可靠性。根据分子钟推测菌物分化发生时间。25种ITS序列平均碱基组成为T=28.66%、C=24.11%、A=26.19%和G=21.03%,总体转换/颠换差R=1.274。Tajima检验支持最大似然树和邻接树的系统发育关系。对于长期进化而言,无ITS核苷酸序列以绝对恒定的速率变化,分子钟不具有通用性。构建不受分子钟约束的最大似然树,根据枝长估计红毛盘菌与其他菌物分化发生在500 Ma,灰光柄菇与其他菌物分化发生在约130 Ma,多孔菌在内的其他菌物起源于约100～120 Ma。
- 王峰王志英李丹蕾董爱荣刘雪峰
- 关键词：菌物系统进化分子钟
