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国家自然科学基金(31101897)

作品数:5 被引量:16H指数:2
相关作者:李家乐牛东红沈和定冯冰冰刘达博更多>>
相关机构:上海海洋大学江苏省水产技术推广站更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市教育委员会重点学科基金更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 5篇中文期刊文章

领域

  • 5篇农业科学

主题

  • 4篇缢蛏
  • 2篇基因
  • 2篇基因表达
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白基因
  • 1篇蛋白酶
  • 1篇蛋白酶基因
  • 1篇浙闽沿海
  • 1篇丝氨酸
  • 1篇丝氨酸蛋白酶
  • 1篇丝氨酸蛋白酶...
  • 1篇天然免疫
  • 1篇铁蛋白基因
  • 1篇群体遗传结构
  • 1篇微卫星
  • 1篇线粒体
  • 1篇线粒体DNA
  • 1篇酶基因
  • 1篇免疫
  • 1篇免疫反应

机构

  • 4篇上海海洋大学
  • 1篇江苏省水产技...

作者

  • 4篇牛东红
  • 4篇李家乐
  • 1篇刘达博
  • 1篇冯冰冰
  • 1篇沈和定
  • 1篇阮海灯
  • 1篇金凯
  • 1篇王劦

传媒

  • 2篇上海海洋大学...
  • 1篇海洋渔业
  • 1篇水产学报
  • 1篇Aquacu...

年份

  • 1篇2022
  • 1篇2020
  • 1篇2013
  • 1篇2012
  • 1篇2011
5 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
浙闽沿海缢蛏群体遗传结构的微卫星和线粒体COⅠ序列分析被引量:12
2011年
我国缢蛏养殖规模不断扩大,而缢蛏主产区苗种的遗传结构却缺乏系统的分析研究。利用微卫星标记和线粒体COⅠ序列分析了我国浙闽沿海8个缢蛏群体的遗传多样性和遗传分化水平。基于微卫星标记的遗传多样性分析结果显示,群体的平均有效等位基因数(Ne)为6.2~9.0,期望杂合度(He)为0.806~0.875;基于线粒体COⅠ标记的遗传多样性结果显示,单倍型多态性(Hd)为0.942~1.000,核苷酸多样性指数(P)为0.005 6~0.011 5。基于微卫星标记的群体间遗传分化值(FST)为0.001 4~0.063 8,除NH和SM群体外,其他群体间均具有显著性差异;基于线粒体COⅠ标记的群体间遗传分化值(FST)为0.000 9~0.368 0,部分群体间具有显著性差异。基于微卫星标记和线粒体COⅠ标记的聚类结果表明,位于同一海湾内的群体首先聚类在一起,但是浙江和福建沿海8群体并不符合地理距离隔离模式的聚类方式,而呈现出浙江群体和福建群体的交叉聚类。由此可见,我国缢蛏主产区浙闽沿海群体仍具有较高的遗传多样性水平,但是异地群体间产生了基因交流,并形成了新的地方性种群。
牛东红冯冰冰刘达博沈和定李家乐
关键词:缢蛏微卫星线粒体DNA
中国和越南两个缢蛏种群天然免疫GST基因的特征及比较被引量:1
2020年
因为遭受细菌病原体侵害,缢蛏(Sinonovacula constricta)在孵化和自然坐床过程中损失严重。谷胱甘肽S转移酶(GSTs)是一种可以在第二解毒阶段催化外源代谢的酶。它可以作为评估水生环境中有机和无机污染物指示剂或生物标记。然而,目前对双壳贝类GST基因功能的研究甚少。报告了暴露于霍乱弧菌下GST家族的一个基因的克隆和表达以及mRNA的组织分布与时序表达。首先鉴别了Sc-GST cDNA全长序列。该序列含1052 bp核苷酸序列,包括700 bp的5′端非编码区(UTR)和3′端非编码区,开放式阅读框架含678 bp核苷酸序列编码了225个氨基酸的多肽。其后,对暴露在细菌下的缢蛏中GST基因进行鉴定并分析其表达图谱。用实时定量PCR评估细菌暴露下来自中国和越南的两个缢蛏种群血淋巴中GST基因的表达,并进行了比较。揭示了GST基因主要在缢蛏的免疫组织如血细胞、外套膜、鳃和肝中表达,并对鳗弧菌感染具有高反应性。特别需要指出的是,与中国缢蛏相比,越南缢蛏中的Sc-GST mRNA的表达水平在12 h后显著升高,直至实验结束。这可能是因为注入的细菌来自中国,中国种群在一定程度上已经适应这一来源的疾病。研究表明,Sc-GST基因在缢蛏成贝免疫反应调节中发挥重要作用并可以在基因水平上对不同的种群进行比较。
阮海灯牛东红牛东红李家乐
关键词:缢蛏GSTS免疫反应MRNA表达
缢蛏丝氨酸蛋白酶基因的序列特征及其表达分析被引量:2
2013年
含有clip结构域的丝氨酸蛋白酶是一类新的丝氨酸蛋白酶家族,可能参与非特异性免疫防御功能。从缢蛏(Sinonovacula constricta)cDNA文库中筛选出一条丝氨酸蛋白酶同源EST序列,然后通过5'RACE扩增、测序,拼接得到全长为1 228 bp的cDNA序列,包括66 bp的5'非翻译区和160 bp的3'非翻译区,以及1 002 bp的开放阅读框。阅读框共编码333个氨基酸,含有17个氨基酸的信号肽序列,并含有发卡结构域(clip domain)和胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶结构域(Tryp_SPc domain)。在clip结构域中包含6个半胱氨酸残基形成的3个二硫键,在Tryp_SPc结构域中包含His-Asp-Ser催化三联体(HDS)。该缢蛏丝氨酸蛋白酶基因被命名为ScSP。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析表明,ScSP在缢蛏的外套膜、水管、鳃、斧足、性腺、肝胰腺6个组织中均有表达,尤其在肝胰腺中表达显著高于其他组织,其次为性腺组织,而水管,外套膜和鳃中表达量最低。缢蛏经鳗弧菌(Vibrio anguillarum)诱导感染后4 h和8 h,肝胰腺中的ScSP基因表达量显著上调。缢蛏丝氨酸蛋白酶的序列特征与表达分析揭示了ScSP是含有clip结构域的丝氨酸蛋白酶基因,参与了非特异性免疫防御,为进一步研究该基因的结构和功能奠定了基础。
金凯牛东红王劦李家乐
关键词:缢蛏丝氨酸蛋白酶基因表达
Classification and morphology of circulating haemocytes in the razor clam Sinonovacula constricta
2022年
The razor clam Sinonovacula constricta is widely distributed in the intertidal zones and estuarine waters along the coast of western Pacific Ocean and is extensively cultured.Even though haemocytes are known to play an important role in the immune mechanisms of bivalves,these cells are poorly studied in S.constricta.We researched the morphology and immunological activities of haemocytes in S.constricta using light and electron microscopy and flow cytometry.Three major subpopulations of haemocytes were identified in the haemolymph:granulocytes,semigranulocytes,and hyalinocytes.These subpopulations were divided using flow cytometry,but not satisfactorily.Therefore,the flow cytometry findings were combined with the light and electron microscopy findings,as well as Percoll density-gradient centrifugation findings,to classify and distinguish between the cell types more effectively.The combined findings showed that granulocytes was larger cells,while semigranulocytes was smaller and more abundant.Further,granulocytes had numerous granules in the cytoplasm,semigranulocytes contained fewer and smaller granules,and hyalinocytes was smaller and less abundant with no or a few granules.Both granulocytes and semigranulocytes had greater phagocytotic activity and a higher lysosomal content than hyalinocytes.The results declared that granulocytes and semigranulocytes were the main haemocytes involved in the cellular defence mechanism in S.constricta.
Dang Hai NguyenDonghong NiuZhiyi ChenMaoxiao PengNga Thi TranJiale Li
关键词:HAEMOCYTES
缢蛏铁蛋白基因的分子特性及其表达分析被引量:2
2012年
从缢蛏(Sinonovacula constricta)cDNA文库中筛选出一条铁蛋白同源序列,直接扩增质粒获得全长cDNA序列,共1 106 bp,包括128 bp的5'非翻译区和309 bp的3'非翻译区,以及669 bp的开放阅读框。阅读框共编码222个氨基酸,N端含有17个氨基酸的信号肽序列,推算的分子量约为25.47 ku,理论等电点为5.48。氨基酸序列分析结果表明,该基因含有保守的铁氧化酶活性中心的7个氨基酸残基,但是不具有糖基化位点(NQS)和5'非编码区铁蛋白的铁反应元件(iron response element,IRE),属于H型铁蛋白基因,该基因被命名为ScFERs。系统进化显示,基本上同一个物种的不同亚型铁蛋白首先聚在一起,然后和其他物种的铁蛋白聚在一起。缢蛏ScFERs首先与日本花棘石鳖(Liolophura japonica)LjFERs聚在一起,然后与缢蛏另一种ScFER以及文蛤(Meretrix meretrix)MmFERs聚在一起。荧光定量PCR检测结果显示ScFERs基因在肝胰腺中高度表达,肝胰腺与其它组织间的表达量存在着极显著差异。经鳗弧菌(Vibrioanguillarum)和副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)诱导后,ScFERs基因表达水平呈显著上调。为进一步研究缢蛏铁蛋白基因的结构和功能奠定了基础。
牛东红冯冰冰李家乐
关键词:缢蛏铁蛋白基因基因表达
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