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Endonuclease-rolling circle amplification-based method for sensitive analysis of DNA-binding protein被引量：4: 2009年; A sensitive approach for the qualitative detection of DNA-binding protein on the microarray was developed. DNA complexes in which a partial duplex region is formed from a biotin-primer and a circle single strand DNA （ssDNA） were spotted on a microarray. The endonuclease recognition site （ERS） and the DNA-binding sites （DBS） were arranged side by side within the duplex region. The working principle of the detection system is described as follows： when the DNA-binding protein capture the DBS, the endonuclease could not attach to the ERS, and the immobilized primer in the DNA complex could be extended along the circle ssDNA by rolling circle amplification （RCA）. When no protein protects the DBS, the ERS could be attacked by the endonuclease and subsequently no rolling circle amplification occurs. Thereby we can detect the sequence specific DNA-binding activity with high-sensitivity due to the signal amplification of RCA.; Min Li LiDong Rui ZhouHong ZhaoJin Ke WangZu Hong Lu; 关键词：MICROARRAY

2型糖尿病小鼠食道菌群的结构分析被引量：9: 2011年; 人体内庞大的微生物群体对人体有着巨大的影响.越来越多的数据表明,肠道菌群与肥胖症、糖尿病等代谢性疾病的发生密切相关.食道菌群结构对研究胃肠道及整个消化系统菌群结构至关重要.针对10只2型糖尿病模型小鼠及10只正常对照小鼠食道样本,进行变性梯度凝胶电泳(DGGE)和克隆测序分析食道菌群结构.结果发现,实验组小鼠与对照组小鼠食道菌群多样性指数与丰富度指数存在显著差异,均匀度指数无显著差异.说明正常小鼠较2型糖尿病小鼠食道菌群种类及数量较大,优势菌种类及相对含量相似.测序结果显示,正常小鼠食道内含乳杆菌属细菌,而患病小鼠食道内不含乳杆菌属细菌或含量极低.提示乳杆菌属细菌与2型糖尿病密切相关,实验结果对研究糖尿病发病机理及并发症治疗有重要意义.; 胡芳魏婷婷杜彩贺周东蕊张仁敏张红琳陆祖宏; 关键词：2型糖尿病

2型糖尿病人口腔高温G蛋白(HTPG)生物信息学分析被引量：1: 2012年; 利用一系列生物信息学软件分析了2型糖尿病患者口腔微生物(放线共生放线杆菌)中的高温G蛋白的氨基酸组成、等电点、结构域、特征位点、二级结构等蛋白质性质。结果表明:高温G蛋白分子式为:C3167H4975N849O975S14,属于稳定蛋白;二级结构主要是以α-螺旋为主。初步预测了高温G蛋白的理化性质并初步确定了其二级结构。; 张红琳周昕吴向华周红霞; 关键词：生物信息学放线共生放线杆菌

2型糖尿病BKS-DB小鼠的小肠菌群结构差异性分析被引量：4: 2012年; 研究肠道中的微生物群落与糖尿病之间的关系,对于预防治疗糖尿病具有十分重要的意义.以10只2型糖尿病小鼠和10只健康小鼠为对象,通过PCR-DGGE(polymerase chain reaction-denaturing gradient geleletrophoresis)分子技术分析小鼠小肠菌群结构.实验结果显示,实验组小鼠与对照组小鼠在多样性指数、丰富度指数及优势度指数上存在差异,对照组小鼠小肠内容物的菌群种类及数量明显高于实验组小鼠;而两组小鼠的小肠内容物的优势菌种类及相对含量却相似.特异性条带测序结果显示,正常小鼠小肠内含有乳杆菌,而实验组小鼠小肠内含量很低,甚至检测不到.该结果提示了乳杆菌和2型糖尿病之间的关系.; 韦婷胡芳张红琳魏婷婷杜彩贺周东蕊章爱娣陆祖宏; 关键词：2型糖尿病

乳腺癌中mRNA结合蛋白IMP3表达差异的研究: 2011年; IMP3(胰岛素生长因子Ⅱ的mRNA的结合蛋白3)是一个新发现的癌胚胎的RNA结合蛋白,研究发现其参与细胞生长和细胞迁移在胚胎发育的早期阶段.该研究利用实时定量逆转录PCR对IMP3在乳腺癌的诊断和治疗中的应用潜力进行了研究和评估.检测了不同类型乳腺癌样本中IMP3的表达情况,定量PCR结果分析中应用2-ΔΔCT方法进行了归一化比较.研究结果表明,IMP3基因表达与乳腺癌病人肿瘤的大小及淋巴转移存在明显的相关性(P<0.01).不同的临床阶段和病理分期与IMP3的表达水平之间也存在一定的相关性,表明差异不显著(P>0.05).该研究表明IMP3作为一种新的肿瘤相关因子,其表达水平与乳腺癌也存在一定的相关性,显示了其作为一种潜在的肿瘤标志物的可能性.; 杜艳王英赵华葛芹玉; 关键词：IMP3 乳腺癌实时定量PCR

PCR-DGGE法在慢性胃炎病人舌苔菌群结构研究中的应用被引量：20: 2011年; 在早间未刷牙和进食的情况下,刮取胃炎病人与正常人舌苔,去除杂质,分离菌体,采用酚/氯仿法抽提细菌基因组DNA,并对其中16S rDNA V3可变区进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)测定.用Bionumerics软件对DGGE分子指纹图谱进行舌苔菌群结构相似性分析.实验结果表明,采用该方法成功地扩增出16S rDNA V3区片段,为230 bp.DGGE分子指纹图谱结果表明,正常人的舌苔菌群最高相似性为0.74,胃炎病人的舌苔菌群的最高相似性为0.52,正常人的舌苔菌群与胃炎病人的舌苔菌群相似性最高为0.38,即胃炎病人舌苔菌群结构发生了变化.; 张红琳田凯旋周东蕊杜彩贺张仁敏陆祖宏; 关键词：胃炎舌苔菌群结构

高通量DNA测序技术及其应用进展被引量：27: 2010年; 文章阐述了高通量测序技术的最新进展,重点介绍了新一代高通量测序技术的发展现状及存在问题,并对其目前在生命科学领域特别是生物医学中的应用进行了简单总结,同时通过单分子测序技术的发展现状对高通量测序技术的进一步发展方向进行了展望.; 于聘飞王英葛芹玉; 关键词：高通量测序技术生物医学

抑制素基因免疫京白鸡后在心脏组织中的表达: 2011年; [目的]探讨基因免疫的安全性。[方法]抑制素基因免疫京白鸡后,取其心脏组织制备石蜡切片,再利用免疫组化方法检测心脏组织切片中是否有抑制素基因残留(即是否有阳性点的存在)。[结果]在心脏组织切片中,试验组和对照组均无阳性点。[结论]抑制素免疫后京白鸡的心脏组织中无外源抑制素表达,说明抑制素基因免疫是安全的。; 许方方吴宇张红琳; 关键词：免疫组化安全性基因免疫

PCR-DGGE指纹图谱技术分析2型糖尿病模型小鼠胃微生物菌群结构被引量：6: 2012年; 糖尿病患者多出现胃肠道功能紊乱,如急性胃炎、胃溃疡,以及胃动力低下,胃排空延迟、胃内细菌过度滋长等,进一步导致肠道疾病。研究糖尿病胃内容物菌群结构变化对研究糖尿病发病机理及并发症治疗具有重要意义。该项研究采用变性梯度凝胶电泳技术,对10只2型糖尿病模型小鼠及10只正常对照小鼠进行胃内容物和粘膜样本菌群结构研究。结果表明,实验组小鼠与对照组小鼠胃内容物和粘膜菌群条带数、多样性指数、丰富度指数、均匀度指数与优势度指数均无显著差异,且相似度系数差异不明显。而特异条带测序结果显示正常小鼠胃内含乳杆菌,实验组小鼠胃内乳杆菌含量很低甚至检测不到。提示胃内乳杆菌与2型糖尿病密切相关。; 杜彩贺胡芳魏婷婷张仁敏张红琳周东蕊陆祖宏; 关键词：2型糖尿病小鼠

中国雷公藤制剂治疗系统性红斑狼疮疗效的Meta分析被引量：11: 2012年; 应用Cochrne协作网和保存系统评价的专用分析软件RevMan4.2进行Meta分析,对1982年至今我国公开发表的运用雷公藤制剂辅助或联合其他药物治疗系统性红斑狼疮的文献进行临床疗效的综合评价分析.结果表明,符合并纳入该次Meta分析的文献共有九篇,经卡方检验OR=0.26(95%CI为0.16～0.40),OR值大于零,且"漏斗图"图形基本对称并偏向对照组,表明雷公藤制剂治疗系统性红斑狼疮有较为明显的效果.; 唐宁周红霞周东蕊; 关键词：雷公藤系统性红斑狼疮疗效 META分析

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