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国家自然科学基金(30870591)

作品数:3 被引量:4H指数:2
相关作者:王建平王桂秀赵娟更多>>
相关机构:中国科学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划中国科学院知识创新工程更多>>
相关领域:生物学理学更多>>

文献类型

  • 9篇会议论文
  • 3篇期刊文章

领域

  • 7篇理学
  • 6篇生物学

主题

  • 6篇光谱
  • 6篇红外
  • 5篇红外光
  • 5篇红外光谱
  • 4篇动力学
  • 4篇动力学模拟
  • 4篇分子
  • 4篇分子动力学
  • 4篇分子动力学模...
  • 2篇蛋白
  • 2篇淀粉样
  • 2篇淀粉样Β蛋白
  • 2篇振动
  • 2篇自洽场
  • 2篇酰胺
  • 2篇构象
  • 2篇二肽
  • 2篇非天然氨基酸
  • 2篇Β蛋白
  • 2篇

机构

  • 10篇中国科学院

作者

  • 10篇王建平
  • 3篇赵娟
  • 2篇孟阔
  • 2篇韩晨
  • 2篇郭扬眉
  • 2篇蔡开聪
  • 1篇王桂秀
  • 1篇于鹏云

传媒

  • 1篇Chines...
  • 1篇Scienc...
  • 1篇中国科学:化...

年份

  • 1篇2014
  • 2篇2011
  • 8篇2010
  • 1篇2009
3 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
β-二肽的红外光谱研究
用β-homoalanine dipeptide为模型分子,利用量子化学计算和Morse势拟合的方法,研究了酰胺-Ⅰ带的谐性及非谐性振动特性与分子构象的关系。研究发现,两个模式的频率与结构的相关图不同,但每个模式的非谐性...
赵娟王建平
关键词:红外MORSE势
文献传递
Aβ体片段分子动力学模拟研究
阿尔茨海默病是老年人常见的神经系统变性疾病,是痴呆中最常见的一种类型。目前认为淀粉样β-蛋白质(AmyloidβProtein,Aβ体)的异常沉积是阿尔茨海默病主要发病机制之一。Aβ片段是一种含有11个氨基酸残基的蛋白质...
郭扬眉蔡开聪王建平
关键词:分子动力学模拟
文献传递
Anharmonic vibrations of nucleobases: Structural basis of one-and two-dimensional infrared spectra for canonical and mismatched base pairs
2011年
Canonical Watson-Crick base pairs and four representative mismatched base pairs have been studied by quantum chemical computations. Detailed anharmonic vibrational analysis was carried out to reveal some vibrational signatures characteristic of structural aspects of the base monomers and dimers, which were well manifested in simulated 1D IR and 2D IR spectra. The degree of delocalization of the selected normal modes, represented by the potential energy distribution, was found to vary sig-nificantly from isolated bases to H-bonded dimers, and was accompanied by changes in anharmonicities of these modes. Examples are given for the generally accepted carbonyl stretching mode of base pairs appearing in the 6-m wavelength region of IR spectra.
WANG GuiXiuZHAO JuanWANG JianPing
Aβ体片段的IR光谱与分子动力学模拟研究
淀粉样β-蛋白质(AmyloidβProtein,Aβ体),是一种产生在人脑中的非正常聚集体,Aβ体以多肽链间的β折叠形成纤维状沉积物与阿尔茨海默氏病的发生有关。我们拟通过研究蛋白质自身的骨架振动模式酰胺-Ⅰ带的傅里叶变...
郭扬眉蔡开聪王建平
关键词:FTIR分子动力学模拟
文献传递
甘氨酸较高振动激发态的特征
红外光谱是研究肽分子结构动力学的一个重要手段。本文利用振动自洽场方法结合密度泛函电子结构理论计算了甘氨酸振动模式的基频、倍频和二倍频的红外光谱特征。同时,我们计算了从基态到第一、第二和第三激发态的振动跃迁偶极矩,分析了高...
孟阔王建平
关键词:红外光谱
文献传递
NH伸缩振动与β-二肽的构象关系研究
<正>振动光谱如红外光谱被广泛用于生物分子的结构研究。酰胺-A带的振动特性在α-peptide中与结构的关系研究已有报道,而关于其在β-peptide中的研究尚未见报道。本文以β-homoalanine dipeptid...
赵娟王建平
关键词:红外MORSE势
文献传递
含羧基侧链氨基酸衍生物的红外光谱与分子动力学模拟研究
天冬氨酸(Aspartic acid,Asp)和谷氨酸(Glutamic acid,Glu)为酸性氨基酸,它们的侧链均含有羧基(COOH)。在生理条件下,Asp和Glu侧链均为去质子化状态(COO~-),即侧链带一个负电...
于鹏云王建平
关键词:红外光谱分子动力学模拟
文献传递
多肽酰胺基团模型分子的非谐性振动特征
<正>N-methylacetamide(NMA)是多肽分子结构中最基本的构成单元—酰胺基团(-CONH-)的模型分子。酰胺-A,-Ⅰ和-Ⅱ带是其标志性振动模式,也是生物物理化学家关注的焦点。这些振动模式的非谐性常数是多...
孟阔王建平
文献传递
核酸碱基的非谐性振动:正规及错配碱基对的一维和二维红外光谱及其结构基础被引量:2
2011年
用量子化学计算研究了正规Watson-Crick碱基对和四例典型的错配碱基对.对碱基单体和二聚体进行了详细的非谐性频率分析,以揭示其结构方面的一些振动特征.研究发现这些振动特征能在模拟的一维和二维红外光谱中很好地表现出来.利用势能分布研究了所选简正模式的离域化程度,发现从孤立的碱基单体到参与氢键的二聚体,模式的离域化程度变化很大;同时,这些模式的非谐性常数也发生了相应的改变.以人们通常认为的位于红外光谱中6-μm波长区域的羰基伸缩模式为例进行了探讨.
王桂秀赵娟王建平
关键词:量子化学计算红外
非天然氨基酸与生物水相互作用的从头算分子动力学模拟
<正>生物分子周围的第一层溶剂水,通常被称为"生物水"分子。生物分子与生物水之间的动态相互作用,对生物分子的结构与功能至关重要。从头算分子动力学(ab initio molecular dynamics)是将第一性原理与...
韩晨王建平
关键词:非天然氨基酸
文献传递
共2页<12>
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