国家重点基础研究发展计划(2007CB1090)
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
- 相关作者：李媛媛陈庆芳傅廷栋马朝芝更多>>
- 相关机构：华中农业大学潍坊学院更多>>
- 发文基金：山东省优秀中青年科学家科研奖励基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 利用SSCP技术分析甘蓝型油菜10个功能基因序列差异被引量：4
- 2012年
- 以甘蓝型油菜SI-1300和Eagle为材料,利用DNA单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)技术,对10对功能基因特异性引物进行多态性分析,每对引物均检测到1个多态性位点。随后随机挑选10个多态性片段进行测序,并利用bl2seq软件比较测序序列与基因原始序列。结果显示测序序列与所对应的基因原始序列之间相似程度平均高达98%,差异碱基数平均仅为2.3个。进一步选取5对引物比较分析两个材料间的差异扩增片段序列,发现差异扩增片段在2个材料中高度保守,平均相似度达97%;在所测序的5对引物扩增序列中,共存在39个单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphisms,SNPs)和5个插入/缺失突变(insertion-deletions,INDELs),SNP和INDEL的发生频率分别为1SNP/30bp和1INDEL/233bp。结果表明,SSCP标记能够真实代表原始功能基因,甘蓝型油菜功能基因序列在不同材料间高度保守,其遗传变异类型主要来源于SNP。
- 李媛媛陈庆芳傅廷栋马朝芝
- 关键词：甘蓝型油菜功能基因SSCP
