国家自然科学基金(61072129)
- 作品数：16 被引量：74H指数：3
- 相关作者：蔡禄赵宏宇李珺赵秀娟赵玥更多>>
- 相关机构：内蒙古科技大学内蒙古大学包头医学院第一附属医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金教育部“春晖计划”更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生更多>>
- 氯化钠胁迫下的蒙古黄芪基因组MSAP分析被引量：3
- 2011年
- 利用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术研究高盐胁迫过程中蒙古黄芪(Astragalus membranaceus)基因组DNA甲基化变化。结果表明,扩增22对引物共检测出不同盐浓度间甲基化位点179个。总体趋势是高盐引起蒙古黄芪基因CCGG序列发生DNA去甲基化现象。
- 赵秀娟韩雅楠蔡禄
- 关键词：蒙古黄芪DNA甲基化MSAP
- 盐胁迫对植物生理生化特性的影响被引量：32
- 2011年
- 综述了盐胁迫对植物生理生化若干指标影响的研究进展,包括植物的丙二醛含量、游离脯氨酸含量、超氧化物歧化酶活性、过氧化物酶活性、过氧化氢酶活性以及可溶性蛋白质6项指标。旨在为总结植物的耐盐机制提供科学依据。
- 赵秀娟韩雅楠蔡禄
- 关键词：盐胁迫植物生理生化特性
- 酿酒酵母核小体定位理论模型的体外实验验证被引量：3
- 2014年
- 核小体定位对真核生物基因表达调控发挥着重要作用。前期基于核小体核心及连接区域的k-mer频次分布偏好性,构建了位置权重矩阵算法,并在酿酒酵母基因组内较好地预测了核小体占据率。利用该理论模型,以1 bp碱基为步长、147 bp碱基为窗口,用该算法计算了酵母1号、3号、14号染色体上核小体形成能力强、中、弱各3条长度为147 bp的DNA序列,将这些片段克隆到重组质粒中,大量扩增回收9条标记biotin分子的目的序列。同时分别表达纯化了组蛋白H2A、H2B、H3和H4,复性后装配形成组蛋白八聚体结构。利用盐透析方法将9条DNA序列在体外组装形成核小体结构,经biotin标记检测后计算了反应过程的吉布斯自由能,对比了9条目的序列形成核小体的亲和力大小。研究发现,9条序列中有5条序列与理论预测完全符合,4条序列与理论预测不完全一致。实验结果与该算法预测的核小体定位结果基本一致,表明该理论模型能够有效预测酿酒酵母基因组核小体占据水平。
- 王成爱赵宏宇邢永强邵灵利蔡禄
- 关键词：酿酒酵母核小体定位位置权重矩阵体外实验
- 果蝇基因组中回文序列的分布被引量：3
- 2011年
- 回文序列(palindrome)是与基因表达调控、DNA复制和重组密切相关的重要DNA模体。例如,回文序列常存在于基因表达顺式作用元件中,参与基因表达调控;回文序列也可作为限制性内切酶的识别位点或结构信号,诱导重组的发生,而重组作为选择的途径,反过来可能会调节回文序列在染色体上的分布。在全基因组范围内研究回文序列的分布及其与染色体重组的关系,对从分子水平上理解基因表达调控机制及基因组进化有重要意义。本文对果蝇基因组回文序列在染色体上的分布进行了系统的分析,发现果蝇基因组对回文序列的使用是非随机的,回文序列在染色体上的分布受到重组率、基因分布和GC含量等因素的影响。回文序列丰度、回文密度与重组率的关系,以及回文序列GC含量与重组率的关系在常染色体和X染色体上的巨大反差,预示着常染色体和X染色体在功能及进化上的某些根本性差异可能与回文序列有关。
- 刘国庆包通拉嘎邢永强李宏蔡禄
- 关键词：回文序列自然选择基因表达调控
- 基于位置权重矩阵计算酵母核小体定位的体外实验研究
- 核小体定位对真核生物基因表达调控发挥着重要作用。本课题组前期基于核小体核心及连接区域的k-mer频次分布偏好性,构建了位置权重矩阵算法,并在酿酒酵母基因组内较好的预测了核小体占据率。本研究利用该理论模型,以1bp碱基为步...
- 王成爱赵宏宇邢永强蔡禄
- 关键词：位置权重矩阵酿酒酵母核小体定位体外组装
- 文献传递
- 丝裂霉素C对含重复序列质粒的大肠杆菌致死率的模型化
- 2011年
- 目的探索丝裂霉素C对含重复序列质粒的大肠杆菌致死作用的规律。方法采用均匀设计试验方法设计丝裂霉素C的处理时间和药物浓度,统计存活菌数,计算菌体致死率。结果得到了丝裂霉素C的浓度和作用时间与菌体致死率间的线性回归方程,建立丝裂霉素C作用的响应面。结论丝裂霉素C的浓度和作用时间与菌体致死率呈线性正相关。
- 赵宏宇蔡禄赵秀娟王晶妍
- 关键词：丝裂霉素C均匀设计大肠杆菌致死率
- 酿酒酵母ARS305侧翼序列对其自主复制活性的影响
- 2013年
- 利用PCR技术扩增了酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)Ⅲ号染色体上以ARS(Autonomously replicating sequence,ARS)305为核心的不同长度侧翼序列,并将其构建到酵母整合型载体pRS405中获得了重组质粒PA500、PA1000、PA2000,然后通过电转化法转入酿酒酵母细胞中,测定了不同ARS305片段对酵母转化效率及质粒在酵母中稳定性。结果表明,并非侧翼序列越长ARS活性越高,重组质粒PA1000具有比PA2000更高转化频率和转化稳定性,推测ARS两侧序列存在一些顺式和反式的调控机制影响ARS自主复制功能。
- 李珺张启声王馨赵秀娟蔡禄
- 关键词：重组质粒
- 5-溴脱氧尿嘧啶核苷标记酵母基因组DNA的方法被引量：2
- 2012年
- 胸腺嘧啶类似物5-溴脱氧尿嘧啶核苷(BrdU)标记技术是一种研究DNA复制、修复等生命过程的有效手段。由于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中缺少胸腺嘧啶核苷酸补救途径,胞外BrdU不能有效的渗入到基因组中,使该技术在酿酒酵母中的应用受到极大制约。通过在基因组中引入单纯疱疹病毒胞苷激酶(HSV-TK)和人类平衡核苷转运蛋白(hENT1)基因,工作建立了BrdU标记酵母基因组DNA的方法。在生长对数中期加入0.2mg/ml BrdU,离体检测法检测发现,标记3h的荧光信号较1h、5h时强;胞内检测法结果显示,标记3h时55.3%的基因组DNA中能够渗入BrdU。该工作为酿酒酵母DNA复制、修复等方面提供了直接有效的研究方法。
- 赵宏宇赵玥王建英李珺蔡禄
- 关键词：5-溴脱氧尿嘧啶核苷酿酒酵母DNA复制
- 组蛋白八聚体的装配及荧光标记检测体外组装核小体的效率
- 2017年
- 基于影响核小体定位的DNA序列TA 10-bp周期性和R5Y5序列模体,设计6条对组蛋白亲和性不同的DNA序列,将其克隆到重组质粒中,分别命名为CS1~CS6。通过PCR扩增的方法,在引物上标记Cy3荧光信号分子,获得大量标有Cy3的目的序列;同时,从大肠杆菌中表达纯化了H2A、H2B、H3、H4共4种组蛋白,经复性装配成组蛋白八聚体,利用盐透析法将目的 DNA序列与组蛋白八聚体组装成核小体结构;经荧光信号检测,分析6条目的序列形成核小体的能力。结果发现,CS2、CS3形成核小体的能力较强,该结果与Trifonov EN提出的核小体在该模体上的精确定位基本吻合,该试验方法的建立对核小体结构及相关表观遗传学领域的研究具有一定的意义。
- 刘媛张凤慧赵宏宇蔡禄
- 关键词：核小体组蛋白荧光标记体外组装
- 一种从酵母细胞中提取组蛋白的方法被引量：1
- 2011年
- 为了制备体外酵母DNA序列组装核小体所需的组蛋白,利用酸抽提方法从未经饥饿处理和经过不同时间饥饿处理的酿酒酵母细胞中分离组蛋白,经SDS-PAGE电泳分析和Bradford法测定蛋白浓度,发现抽提物中含有组蛋白H1、H2A、H2B、H3和H4,电泳条带位置正确、纯度较高,正常细胞的抽提物中蛋白总量达到158μg/mL。试验结果表明该方法可以提取出较高质量的酿酒酵母组蛋白。
- 赵玥赵宏宇蔡禄
- 关键词：酿酒酵母核小体定位体外组装
