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广州市教育局科技计划项目(2004-1054)
作品数:
1
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相关作者:
王波
张纯青
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2008
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广州地区HCMV临床病毒株UL144 ORF的序列变异研究
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2008年
目的研究广州地区先天性感染的人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代分离病毒株UL144基因序列的多态性,探讨UL144基因在HCMV致病中的作用。方法对3株经多重PCR鉴定HCMVDNA为阳性的临床低传代分离株进行HCMVuL144基因全序列PCR扩增,PCR产物克隆到pMD18-T载体上再测序,将其序列与GenBank中公布的其它10株临床分离株uL144基因一起进行分析。结果本实验克隆并测序了HCMV临床低传代D3、D2和D52病毒株的UL144基因,提交GenBank,已被GenBank收录,序列号分别为DO180368、DQ180382和DQ180355。HCMV临床低传代D3、D2和D52病毒株的UL144基因均全长531bp。通过blast分析,从GenBank中找到了10株HCMV病毒株的UL144与D3、D2和D52的UL144基因具有较高的同源性,经过序列的比对,发现UL144基因DNA序列比较保守,只在4处有变异,且变异均为碱基替换,无插入或缺失,编码蛋白由176个氨基酸残基组成,氨基酸序列也比较保守,各分离株中变异率为1.1%;HCMVUL144编码蛋白翻译后修饰位点在所有分离株中均高度保守:所有分离株UL144蛋白的等电点均为8.97。结论广州地区临床低传代分离株HCMVUL144基因DNA及其编码产物的氨基酸序列是比较保守的,但仍存在一定的多态性。提示UL144基因在先天性感染中可能具有重要作用。
王波
李月琴
叶宁
胡兢晶
何震宇
田传军
张纯青
叶铁真
周天鸿
关键词:
HCMV
基因序列
基因变异
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