广西省自然科学基金(0990182)
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
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- 发文基金：中国博士后科学基金南宁市科学研究与技术开发计划项目广西省自然科学基金更多>>
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- 甘蔗MAP激酶基因SoMAPK4克隆与生物信息学分析被引量：4
- 2012年
- 【目的】克隆甘蔗MAP激酶家族新基因的全长序列,为了解甘蔗抗逆胁迫机制提供依据。【方法】以新台糖22为材料,提取甘蔗幼叶总RNA并反转录为cDNA;利用已知物种MAP激酶基因核苷酸序列保守区设计引物,采用5'和3'端RACE技术克隆新基因全长,并进行生物信息学分析。【结果】克隆获得的甘蔗新基因与玉米ZmMAPK4同源性很高,达92.6%,将该基因命名为SoMAPK4(登录号JQ062930),基因全长1499bp,其中开放阅读框(ORF)为1128bp,5'非翻译区(UTR)为218bp,3'非翻译区(UTR)为213bp。生物信息学分析结果表明,SoMAPK4基因编码一个含376个氨基酸的蛋白质,分子量约43.5kDa,等电点为5.51,含有11个保守的蛋白激酶亚区和MAP激酶的磷酸化位点TEY基序。【结论】克隆获得甘蔗MAP激酶新基因SoMAPK4,该基因可能参与多种胁迫反应的信号传递,是研究甘蔗非生物胁迫和生物胁迫过程中信号传递的一个关键因素。
- 李粲滕峥刘开雨桑洪玉卢双楠方位宽梁朝旭刘晓静何姗珊刘芳邱永福李鸣李容柏
- 关键词：甘蔗MAP基因克隆生物信息学
