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惠州市重症手足口病病原谱及EV71型VP1区基因特征分析被引量：1: 2014年; 目的分析惠州市手足口病重症病例的病原谱构成，了解惠州市肠道病毒71型分离株的VPl区基因特征．为科学防治手足口病提供科学依据。方法采集300例重症手足口病（HFMD）患者标本，采用实时荧光RT-PCR检测肠道病毒核酸，并对肠道病毒7l型（EV71）和柯萨奇病毒A16型（CoxA16）进行分型检测；选择8株EV71分离株进行VPl区基因全长序列测定，测序结果利用DNASTAR软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较。并用Mega5．0软件构建亲缘性进化树。结果通过实时荧光RT-PCR特异性检测，EV71阳性结果154份，阳性率为51．33％；CoxAl6阳性结果38份，阳性率为12．67％。测序结果表明，8株EV71之间的VPl基因核苷酸同源性为96．9％～99．2％。氨基酸同源性为99．3％～100％。VPI区基因遗传进化分析表明。8株EV71分离株与c4基因亚型的代表株处于同一分支，均属于C4基因亚型的C4a进化分支。结论惠州市手足口病疫情主要病原EV71病毒均属于C4a基因亚型，与2004年以来的中国大陆EV71病毒流行的基因型一致，未产生明显的抗原漂移及变异。; 方巧云琚雄飞许岸高; 关键词：手足口病 VP1基因

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广东省惠州市科技计划项目(2012Y095)