黑龙江省研究生创新科研项目(YJSCX2012-209HLJ)
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 相关作者：吕亚娜贾婿陈丽娜冯陈晨何月涵更多>>
- 相关机构：哈尔滨医科大学更多>>
- 发文基金：黑龙江省研究生创新科研项目国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 基于整合网络和联合策略预测心肌梗死的新致病基因被引量：1
- 2013年
- 目的:基于整合网络和联合策略预测心肌梗死的新致病基因。方法:从系统生物学的角度,提出基于蛋白质亚细胞定位信息,构建区域化的蛋白质互作的整合网络;通过疾病风险基因与已知致病基因的功能一致性程度和互作相关性的强度联合筛选的新策略,预测心肌梗死的新致病基因。结果:预测出10个心肌梗死的新致病基因(CCL19、CCL25、COMP、CCL11、CCL7、F2、KLKB1、HTR6、ADRB1、BDKRB2),其中8个基因(CCL19、CCL25、CCL11、CCL7、F2、KLKB1、ADRB1、BDKRB2)经文献证实与心肌梗死的发生发展有着密切的联系;另外2个基因(COMP、HTR6)尚需实验验证。结论:基于整合网络和联合策略预测出10个心肌梗死的新致病基因,此方法为探索复疾病的致病基因提供了新的思路,有助于阐明复杂疾病的致病机理。
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- 关键词：心肌梗死蛋白质互作网络
- 基于人类信号网络和表达谱数据研究静脉血栓复发机制
- 2015年
- 目的:静脉血栓是一种高复发风险和高致死率的疾病,其形成和复发的分子机制尚不明确。基于人类信号网络和基因表达谱数据可针对静脉血栓经华法令抗凝治疗后的复发机制进行研究。方法:结合表达谱数据和人类信号网络,设计差异模块筛选策略,通过功能分析、差异表达分析和已知血栓相关基因及药物靶基因的互作关联研究,获得与静脉血栓复发相关的显著差异模块。结果:最终获得8个与静脉血栓复发密切相关的显著差异模块,评估了华法令治疗静脉血栓的效能,提出了联合用药的3种可能途径。结论:应用本文提出的整合筛选策略,能识别与静脉血栓复发相关的模块,探究静脉血栓复发的分子机制和评估华法令的治疗效能。还提供了潜在的联合用药途径,这对治愈血栓、防治血栓复发及复发机制的研究具有重要意义。
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- 关键词：静脉血栓华法令
- 基于共表达网络挖掘肺癌相关模块被引量：1
- 2013年
- 目的:识别肺癌疾病相关功能模块,对了解肺癌疾病的发病机制至关重要。方法:本文提出一个挖掘疾病相关功能模块的整合方法。采用包括正常和肺癌样本的微阵列数据,首先,应用rank-based方法构建基因共表达网络;其次,通过Qcut挖掘基因共表达模块;然后基于肺癌差异表达基因及基因模块功能一致性的联合测度,最终筛选出疾病相关功能模块。结果:研究发现,我们的方法获得7个显著疾病相关功能模块,经文献证实都与肺癌的发生发展有着密切的联系。进一步分析发现不仅能获得与传统方法功能一致的模块,而且还发现了传统方法没有获得的病毒层面的两个模块(模块351和352)。结论:我们的方法能够有效地发现新的功能模块,为探索癌症致病机理提供新的视角及依据。
- 吕亚娜何月涵苗正强贾婿冯陈晨陈丽娜
- 关键词：基因表达肺癌
