国家科技支撑计划(2006BAD01A08) 作品数:25 被引量:172 H指数:8 相关作者: 王立贤 颜华 张启翔 王立刚 李勇 更多>> 相关机构: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 北京林业大学 新疆畜牧科学院 更多>> 发文基金: 国家科技支撑计划 国家高技术研究发展计划 引进国际先进农业科技计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 建筑科学 更多>>
母猪VEGF基因mRNA全序列的克隆与分析 被引量:2 2008年 本研究运用多种分子生物学方法对母猪胎盘VEGF mRNA全序列进行克隆和分析,结果发现:母猪胎盘VEGFmRNA全长约3500 bp,其完整的cDNA编码190个氨基酸,通过同源性比较预测了VEGF基因的DNA序列全长约为16kb。VEGF基因编码的氨基酸序列与人、小鼠和恒河猴的同源性分别为78.82%、79.44%和96.34%。经生物信息学分析,预测VEGF蛋白理论分子量为22.33 kD,其等电点为7.89;大约在1-20,40-45,50-60,65-80,100-105位之间的氨基酸存在疏水性区域,用TMHMM2.0分析猪VEGF的跨膜结构发现此蛋白所有氨基酸都位于膜表面,证实了VEGF是一种表面蛋白。用signalP 3.0分析发现在1-27位氨基酸可能为信号肽(P=0.999),且可能在26和27位氨基酸之间发生切割(P=0.956)。对VEGF核苷酸序列和氨基酸序列、蛋白质结构和功能的分析,进一步证实本研究得到了VEGF基因mRNA的全序列,为VEGF基因与母猪繁殖性能的关联性研究提供依据。 陈来华 王立贤 王立刚 季跃光 颜华 张龙超关键词:VEGF基因 生物信息学分析 猪CETP基因表达变化及其对胆固醇合成的影响研究 被引量:4 2008年 研究胆固醇酯转运蛋白(CETP)基因在猪各个组织的表达特性以及在不同品种之间表达的差异。结果表明:所检测的15个组织中除下丘脑外,CETP基因在其余14个组织都有不同程度的表达,其中肝脏的表达量最高。统计分析显示,除了输卵管和心脏,胃和肺,肾脏和大脑之间CETP的表达差异不显著外,其余各组织之间差异显著(P<0.05)。同时利用实时荧光定量PCR对中国地方猪种和国外引进品种之间的表达分析发现,2个品种之间CETP的mRNA表达量存在显著差异(P<0.05),而其对应血清中HDL胆固醇和LDL胆固醇含量差异不显著(P>0.05)。 刘桂芬 王爱国 傅金恋关键词:实时荧光定量PCR CETP 北京黑猪RBP4基因与繁殖性状的关联分析 被引量:18 2008年 以北京黑猪为研究对象,选取视黄醇结合蛋白4(Retinol-binding proteins 4,RBP4)基因为繁殖性状的候选基因,其扩增产物经MspⅠ酶切后,在北京黑猪群体中发现AA、AB和BB 3种基因型,其A、B等位基因的频率、多态信息含量、杂合度分别为0.529 6、0.470 4、0.374 1和0.498 2,表明该位点处于中度多态。χ2适合性检验表明北京黑猪群体该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。用SAS 8.0软件最小二乘法拟合线性模型,将不同基因型与总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)和出生重(WB)进行了关联分析,结果表明:经产母猪各基因型间的TNB、NBA、WB差异均不显著(P>0.05)。初产母猪BB型比AA和AB型个体的TNB分别多1.04(P<0.05)和0.31头;BB和AB型比AA型个体的NBA分别多1.47(P<0.05)和1.35头。基因效应分析结果表明,初产母猪该位点的B等位基因对TNB、NBA和WB都表现为正效应,分别使各性状增加了0.282 0头、0.408 5头和0.000 9kg,即B等位基因可能为北京黑猪繁殖性能的有利等位基因。 罗仍卓么 王立贤 孙世铎关键词:北京黑猪 RBP4基因 多态性 繁殖性状 候选基因 Cloning and Sequence Analysis of Porcine IRGC Gene 2009年 [ Objective] This study was to analyze porcine IRGC gene, so as to lay the foundation of further revealing its function. [ Method] IRGC gene was cloned by using EST information together with sequencing, then aligned with the IRGC sequences of human, cattle, dog and orangutan for obtaining their similarities. [Result] Porcine IRGC cDNA obtained in the present study was 1 558 bp in length(GenBank accession number EU703776), which shared high similarity with human (86%), cattle (90%), dog (91%), orangutan (84%). Sequence analysis shows that porcine IRGC gene encodes 464 amino acid residues which share high homologies with the counterparts from human (90%), cattle (93%), dog (95%), orangutan (90%). [Condusion] Cloning and sequence analysis of porcine IRGC gene would be helpful for studying its functions. WU Hua-yu QIAO Mu LI Liang-hua GUO Wan-zheng PENG Xian-wen SUN Hua HUANG Jing-shu MEI Shu-qi关键词:PIG CLONE 观赏植物远缘杂交和多倍体育种研究进展 被引量:5 2009年 介绍了植物远缘杂交不亲和、远缘杂种不育的原因及克服方法,概括了远缘杂交及多倍化在观赏植物育种中取得的成就,指出远缘杂交和多倍体育种是目前观赏植物商业化育种的两大重要手段。 段超 张启翔关键词:远缘杂交 多倍体 猪肺表面活性蛋白A在急性肺损伤中的变化及其意义 被引量:4 2010年 【目的】通过对猪血清和支气管肺泡灌洗液(BALF)中肺表面活性蛋白A(SP-A)含量的变化及其与反映肺损伤程度的指标-肺含水量变化的关系的研究,探讨猪SP-A在急性肺损伤(ALI)和兽医临床上诊治猪呼吸系统疾病(PRD)中的意义。【方法】选择50±1日龄的18头健康大白猪建立包含对照组(NS组)和油酸组(OA组)的油酸-急性肺损伤模型;取1、3和6h时相点,分别用ELISA技术检测血清中SP-A含量、用Westernblotting技术检测BALF中SP-A含量;血清中SP-A含量、BALF中SP-A含量与肺含水量两两变量间的相关性用Kendall相关分析法进行分析。【结果】与NS组相比,OA组的肺含水量在1、6h时相点均显著增加(P<0.05),在3h时相点极显著增加(P<0.01);在OA组中,3h时相点肺含水量高于1h时相点、6h时相点肺含水量低于3h时相点,但差异均不显著;推断在OA组3个时相点中,1h时相点处于肺损伤前期,3h时相点肺损伤较严重,6h时相点位于肺损伤的缓解期。与NS组相比,在OA组的肺损伤前期,血清中SP-A含量极显著增加(P<0.01),在OA组的肺损伤较严重时期和肺损伤缓解期,血清中SP-A含量高于NS组,但是与NS组差异均不显著;而OA组中,肺损伤较严重时期血清中SP-A含量比肺损伤前期极显著降低(P<0.01),肺损伤缓解期血清中SP-A含量比肺损伤较严重时期显著降低(P<0.05)。在肺损伤不同时期,OA组BALF中SP-A含量都极显著低于NS组(P<0.01);在OA组中,肺损伤较严重时期与肺损伤前期相比,BALF中SP-A含量极显著降低(P<0.01),肺损伤缓解期与肺损伤较严重时期相比,BALF中SP-A含量极显著增加(P<0.01)。相关分析显示:血清中SP-A含量与肺含水量之间呈极显著正相关关系(r=0.50327,P<0.01),BALF中SP-A含量与肺含水量之间呈极显著负相关关系(r=-0.72499,P<0.0001)。【结论】由于SP-A的表达具有非肺组织特异性,所以把猪血清中SP-A含量作为反映肺损伤程度的指标还有待进一步的研 乔莉娟 王立贤 王立刚 颜华 张龙超关键词:肺损伤 支气管肺泡灌洗液 ELISA WESTERN BLOTTING 猪多潜能性维持因子5基因遗传多态性及其与繁殖性状的关联分析 被引量:5 2011年 旨在研究猪多潜能性维持因子5(Dppa5)基因的遗传多态性及其与母猪繁殖性状的遗传效应。通过基因池测序的方法寻找该基因的突变位点,并采用PCR-RFLP进行基因型检测,最后将其与大白猪和北京黑猪的繁殖性状进行关联分析。结果表明:(1)在猪Dppa5基因外显子上存在2个错义突变位点(g.363T>C和g.844G>T)。(2)2个位点在大白猪和北京黑猪上均表现出多态性。(3)2个位点对经产母猪的仔猪初生窝质量的影响显著,对总产仔数和产活仔数的影响不显著。结合已有的研究结果分析,可将该基因作为影响母猪繁殖性状的候选基因之一做进一步研究。 李稳 李勇 张龙超 王立刚 颜华 王立贤关键词:繁殖性状 候选基因 猪肺表面活性蛋白A的DNA全序列克隆与生物信息学分析 被引量:2 2008年 猪肺表面活性蛋白A(Porcine surfactant proteinA,SP-A)是猪肺泡表面活性蛋白中含量最多、最先被发现具有炎症免疫调节功能的表面活性蛋白。本研究利用比较基因组学方法,设计了6对引物进行PCR扩增,克隆测序后进行拼接,获得了长为4037bp猪SP-A基因的全序列(gi:DQ985806)。经生物信息学分析,此序列包含了猪SP-A基因启动子区,含有1个747bp的完整开放阅读框,编码248个氨基酸;预测猪SP-A蛋白理论分子量约为26.37ku,蛋白的等电点为5.20;在1~20位氨基酸可能是信号肽序列;在大约1~20、120~135、145~160位氨基酸存在疏水性区域;跨膜结构分析表明此蛋白所有氨基酸都位于膜表面;并且发现猪SP-A蛋白同人SP-A蛋白一样也含有保守的碳水化合物识别区、胶原样区域和茎区。本结果为进一步对SP-A与猪呼吸道疾病相关性的研究奠定了基础。 乔莉娟 王立贤 苏振环 颜华关键词:生物信息学分析 FSHβ亚基基因与繁殖性能及胎盘性状的关联分析 被引量:7 2010年 以117头大白猪为研究对象,以FSHβ亚基基因为候选基因,采用PCR产物直接电泳方法检测FSHβ亚基基因位点的多态性,检出3种基因型,分别为AA、AB和BB基因型。将基因座不同基因型与总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)、初生体质量(BW)和胎盘性状(PT)进行关联分析。结果表明:FSHβ亚基基因在该位点上,就初产母猪而言,AA和AB基因型比BB型个体的TNB分别多3.25和2.37头(P<0.05),AA和AB基因型比BB型个体的NBA分别多3.31和2.49头(P<0.05)。就经产母猪而言,AA和AB基因型比BB型个体的TNB分别多2.71和1.60头(P<0.05),AA和AB基因型比BB型个体的NBA分别多2.95和1.74头(P<0.05)。AA基因型比AB和BB型个体的胎盘效率(PE)分别高16.28%和23.09%(P<0.05)。总体而言,FSHβ亚基基因在该位点的A等位基因对TNB、NBA和PE均表现为正效应。 陈来华 王立贤 季跃光 颜华 程笃学 张龙超 王立刚 李勇关键词:FSHΒ亚基基因 多态性 繁殖性状 胎盘效率 猪FP基因cDNA全序列克隆及染色体定位 <正>引言猪的繁殖性状是一个非常重要的经济性状,育种学家在猪繁殖性状的研究方面已经取得了很大的成就,但我们有必要在分子水平上继续探索影响猪繁殖性状的未知基因,这对于全面而深入的揭示高繁殖机理,提 李勇 王立贤 赵书红 王立刚 程笃学 乔莉娟 颜华 张龙超关键词:繁殖性状 基因定位 文献传递