国家自然科学基金(81272255)
- 作品数:3 被引量:18H指数:3
- 相关作者:龚朝建曾朝阳熊炜李桂源黄宏斌更多>>
- 相关机构:中南大学中南大学湘雅二医院国防科技大学更多>>
- 发文基金:中央高校基本科研业务费专项资金湖南省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- lncRNAs参与基因表达调控机制的研究进展被引量:7
- 2014年
- 长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一组内源性、长度超过200 nt、缺少特异完整的开放阅读框(open reading frame,ORF)、无或很少有蛋白编码功能的RNAs分子。近年来的研究发现,lncRNAs与许多重要的生物学过程相关,如基因组印记、细胞分化、免疫反应等。lncRNAs在表观遗传水平、转录水平和转录后水平等多个层面调节基因的表达,通过介导染色质重塑和组蛋白修饰、干扰转录、调节选择性剪接模式、生成小RNAs、调节蛋白质活性、改变蛋白质定位等方式,参与机体生长、发育、衰老及死亡等重要生命活动的调控。关于lncRNAs参与基因表达调控的机制有待进一步研究,这将有助于深入理解疾病的发病机制,为寻找疾病分子标记物、药物靶点提供新的方向。
- 杨倩黄宏斌龚朝建熊炜曾朝阳李桂源
- 关键词:表观遗传调控转录调控转录后调控
- 一个肝癌相关长链非编码RNA的克隆及序列分析被引量:5
- 2014年
- 最近我们利用新一代测序(next generation sequencing,NGS)技术对肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者活检标本及正常对照肝组织样品进行高通量RNA测序(RNA-sequencing,RNA-Seq),在肝癌样品中染色体11q13.1区域检测到几个相邻的RNA-Seq信号峰,而在正常对照组织中没有检测到,且该染色体区域目前尚无已知基因登录,提示这几个RNA-Seq峰可能代表一个或多个未知的新基因.以此为线索,证实这几个RNA-Seq峰来自同一个新基因,并克隆了该基因全长序列,在克隆该基因全长序列时,发现该基因编码的RNA存在多种剪接形式,最长的转录本为3 562 bp.将该基因编码的12条代表性RNA转录本序列递交到美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的GenBank数据库中,GenBank ID号分别为KC136297~KC136308.该基因编码的RNA没有发现明显的开放阅读框(open reading fragment,ORF),提示该基因可能编码长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA).为了探讨该lncRNA基因可能的转录调控机制,我们用生物信息学方法预测了该lncRNA基因潜在启动子区域,发现在其转录起始位点上游-719^-469 bp处有一个潜在的启动子,其中包含7个Sp1、1个STAT5和1个EGR1转录因子结合位点.该lncRNA在肝细胞癌发生发展过程中的作用机制值得进一步深入研究.
- 唐珂魏芳孛昊黄宏斌张文玲龚朝建李夏雨宋亚莉廖前进彭淑平向娟娟周鸣马健李小玲熊炜李勇曾朝阳李桂源
- 关键词:长链非编码RNA肝细胞癌基因克隆生物信息学
- MicroRNAs与非可控性炎症相关肿瘤被引量:6
- 2013年
- 非可控性炎症与肿瘤之间存在密切的联系,约25%的人类肿瘤是由于非可控性炎症所引起,在几乎所有的肿瘤微环境中存在炎症细胞浸润,炎症细胞及分子影响着肿瘤发生、发展的每一步。MicroRNAs(miRNAs)通过调控一些关键基因及其信号通路,参与了非可控性炎症相关肿瘤起始和进展过程的调控。深入研究miRNAs作用的分子机制,可能为肿瘤的预防、早期诊断及治疗提供新的策略。
- 龚朝建张姗姗唐珂李夏雨向波向娟娟周鸣马健曾朝阳熊炜李桂源
- 关键词:MICRORNAS肿瘤