国家重点基础研究发展计划(2002CB513206)
- 作品数：8 被引量：34H指数：3
- 相关作者：李明王文敬骆利敏芮勇宇崔步云更多>>
- 相关机构：南方医科大学南方医科大学南方医院中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生理学更多>>
- 布鲁氏菌PFGE分子分型的条件优化被引量：3
- 2008年
- [目的]将PFGE方法应用于布鲁氏菌分型研究,探索建立布鲁氏菌PFGE分型的最优化方法。[方法]在用PFGE方法进行布鲁氏菌基因分型的研究中,针对不同内切酶、酶切的浓度和时间、脉冲时间等影响PFGE分型结果的因素进行优化,利用优化后的条件对布鲁氏菌19株标准菌株进行分型研究。[结果]在布鲁氏菌的PFGE分型研究中,选择XbaI为内切酶、酶切浓度为96u/200μl、酶切时间为4h、脉冲时间为2～25s为PFGE电泳的优化条件,在分析的19株布鲁氏菌标准菌株中,6种布菌的PFGE图谱各不相同,但PFGE不能将种内不同生物型布菌完全区分开来。[结论]PFGE方法可用于布鲁氏菌的基因分型的研究,是对传统分型方法一种较好的补充。
- 骆利敏夏虎余宙耀李灼亮程涛李明
- 关键词：布鲁氏菌分子分型
- 中国布鲁杆菌插入序列基因多态性的研究被引量：4
- 2006年
- 目的分析国内83株布鲁杆菌基因组的插入序列(IS)IS711的遗传多态性。方法提取布鲁杆菌DNA,经内切酶EcoRI酶切、琼脂糖凝胶电泳、Southern转印后,与地高辛标记的IS711探针杂交,以酶免疫试验检测信号,比较布鲁杆菌各株的IS711指纹图谱。结果不同布鲁杆菌菌株在IS711探针杂交图谱上有明显的多态性,根据杂交的条带数及片段大小的差异,83株布鲁杆菌分属15个IS型。以IS10型分布最为广泛,其次是IS3型,其他型别则较分散,有的IS型只存在于某个菌株。结论布鲁杆菌插入序列IS711在基因分布上存在多态性。
- 骆利敏李明芮勇宇王文敬李妍李莉
- 关键词：多态性
- 布鲁菌脉冲场凝胶电泳图谱分型方法建立被引量：3
- 2008年
- 目的建立我国95株布鲁菌的染色体DNA脉冲场凝胶电泳图谱，进行布鲁菌的分子遗传学分类鉴定。方法选择我国不同地区、不同时限分离的布鲁菌100株（包括19株标准布鲁菌株），应用SeaKem Gold琼脂糖胶块纯化布鲁菌完整的染色体DNA，限制性内切酶XbaI消化后，进行脉冲场凝胶电泳分离（PFGE）。结果XbaI酶切布鲁菌基因组DNA后，可产生20～500kbp范围的15～25条酶切片段．并可以在PFGE凝胶上被很好的区分开。PFGE可在种的水平上区分布菌各种标准株，76株中国分离株可被分为39种PFGE类型，并聚为4大类。PFGE与传统分型方法比较，2者的一致性达63％。结论脉冲场凝胶电泳图谱可对布鲁菌进行遗传学分类鉴定，在布鲁菌的分子流行病学研究中具有重要意义。
- 骆利敏夏虎余宙耀李灼亮刘树人李明
- 关键词：布鲁菌脉冲场凝胶电泳
- 布鲁菌脉冲场凝胶电泳图谱分型研究被引量：10
- 2005年
- 骆利敏崔步云芮勇宇王文敬李明赵鸿雁李妍
- 关键词：脉冲场布鲁菌标准菌株
- 鼠疫耶尔森菌LcrV抗原B细胞表位的预测被引量：3
- 2006年
- 目的预测鼠疫耶尔森菌LcrV抗原的B细胞表位,为抗LcrV单克隆抗体的制备提供理论依据,探索适合我国鼠疫耶尔森菌蛋白B细胞表位组研究的可行方案。方法采用EMBOSS网络平台以及DNAStar Protean软件分析LcrV蛋白的二级结构、可塑性、亲水性和抗原性指数等参数,进行B细胞表位的预测和分析。结果LcrV蛋白的B细胞表位可能位于第16～24、26～31、45～50、175～181、208～213和280～289位等氨基酸区域内或附近,其中16～24、26～31、175～181、208～213等4个短肽都与文献报道相吻合。结论预测得到的表位为后续抗LcrV抗原单克隆抗体的制备奠定了理论基础,为进一步表位分析和鉴定提供了参考依据;预测结果的准确性高,有助于利用表位预测法建立鼠疫菌蛋白B细胞表位研究的平台。
- 王文敬李明董文其
- 关键词：耶尔森菌鼠疫表位B淋巴细胞
- 中国布鲁氏菌核糖体的基因多态性被引量：2
- 2006年
- 目的分析国内99株布鲁氏菌的遗传多态性,为其分型和诊断奠定基础。方法提取布鲁氏菌DNA,经内切酶Eco RI酶切、琼脂糖凝胶电泳、Southern转印后,与地高辛标记的16 srRNA核糖体基因探针杂交,以酶免疫试验检测信号,比较布鲁氏菌各标准株和野生株的16 srRNA核糖体指纹图谱。结果不同布鲁氏菌菌株在16 s rRNA探针杂交图谱上有明显的多态性,根据杂交的条带数及片段的大小差异,99株布鲁氏菌分属17个RT型(ribotype,RT型)。以RT15型为优势型,其他型别则较分散,有的RT型只存在于某个菌株。结论我国布鲁氏菌在遗传分化及克隆群的分布上存在多态性,提示国内布鲁氏菌在流行上具有复杂性。
- 骆利敏李明王文敬芮勇宇陈瑶
- 关键词：布鲁氏菌基因多态性探针杂交
- 脉冲场电泳分析布鲁菌标准菌株被引量：10
- 2006年
- 目的探索一种布鲁菌分型的快速、准确、可靠的分子生物学方法。方法建立脉冲场凝胶电泳(PF-GE)的分子生物学分型方法,比较染色体限制性内切酶图谱,确定菌株的亲缘关系。结果在分析的19株布鲁菌标准菌株中,6种布鲁菌的PFGE图谱各不相同,但猪种菌和犬种菌的PFGE图谱只有1条带不同。羊种菌和猪种菌内各生物型均可在各自种内被区别,但牛种菌各生物型被区分为3类。从系统发生的观点来看,羊、牛、猪种菌是从共同祖先进化来的,犬种菌可认为是猪种菌的主要株或是刚从该种布鲁菌进化而来的株。沙林鼠种菌与牛种菌关系密切,而绵羊附睾种菌与猪种5型菌遗传距离也较近。结论PFGE方法可用于布鲁菌的基因分型的研究,是对传统分型方法一种较好的补充。
- 骆利敏崔步云赵鸿雁芮勇宇李明
- 关键词：脉冲场凝胶电泳布鲁菌分子生物学分型
- 鼠疫耶尔森氏菌F1抗原的表位预测被引量：3
- 2008年
- 目的预测F1抗原的B细胞表位,为抗F1单克隆抗体的制备提供理论依据,探索适合我国鼠疫耶尔森菌（Yersinia pestis）蛋白B细胞表位研究的可行性方案。方法采用EMBOSS网络平台以及DNAStar Protean软件分析F1蛋白的二级结构、可塑性、亲水性和抗原性指数等参数,进行B细胞表位的预测。结果F1蛋白的B细胞表位可能位于第106-132和141-155等区域内。结论预测结果为后续抗F1单克隆抗体的制备奠定一定理论基础,表位预测法有利于我国鼠疫菌B细胞表位研究平台的建立。
- 王文敬董文其李明
- 关键词：F1抗原鼠疫耶尔森菌B细胞表位
