国家自然科技资源平台项目(2004DKA30460)
- 作品数：8 被引量：36H指数：3
- 相关作者：邢秀梅杨福合涂剑锋李一清杨颖更多>>
- 相关机构：中国农业科学院特产研究所中国农业科学江苏科技大学更多>>
- 发文基金：国家自然科技资源平台项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于线粒体控制区全序列的鹿亚科系统发育分析被引量：8
- 2012年
- 测定13种鹿亚科动物线粒体DNA控制区全序列,并结合从GenBank获得的12种鹿亚科动物同源序列进行分析,进一步研究鹿亚科物种的分类和系统进化。结果显示,25种鹿亚科动物线粒体控制区序列全长为914～1 072bp,个体间序列差异为0.1%～12.2%,4个属间差异为8.0%～12.2%。构建的系统发育树结果表明,马鹿分为2个不同类群,麋鹿属的麋鹿、斑鹿属的豚鹿以及黇鹿属的黇鹿与鹿属的分化处于属间差异,支持将其并入鹿属的观点,坡鹿为鹿属中最原始的种。
- 涂剑锋邢秀梅刘琳玲鲁晓萍杨福合
- 关键词：线粒体DNA控制区系统发育
- 中国鹿亚科动物mtDNA控制区序列差异及其遗传分化被引量：3
- 2012年
- [目的]探讨中国鹿亚科动物的遗传分化。[方法]通过PCR直接测序的方法获得我国鹿亚科物种线粒体DNA控制区(D-loop)全序列,结合GenBank检索到的鹿亚科其他动物同源序列,用生物软件进行统计分析。[结果]我国鹿亚科动物D-loop区序列全长在921～1 072 bp,碱基T、A、C、G的平均含量分别为32.1%、30.2%、22.7%及15.0%,各物种间的遗传距离范围在0.062～0.106之间,处于属间差异。系统进化树结果表明梅花鹿、马鹿和白唇鹿亲缘关系较近,它们与水鹿构成一组进化枝,坡鹿与麋鹿构成一组进化枝,豚鹿单独构成一个进化枝。[结论]该研究支持麋鹿和豚鹿并入鹿属的观点,我国的鹿亚科动物的分化时间约为155～260万年。
- 涂剑锋邢秀梅徐佳萍杨颖杨福合
- 关键词：控制区遗传分化
- 中国鹿亚科动物mtDNA控制区序列差异及其遗传分化(英文)被引量：1
- 2011年
- [目的]探讨中国鹿亚科动物的遗传分化。[方法]通过PCR直接测序的方法获得我国鹿亚科物种线粒体DNA控制区(D-loop)全序列,结合GenBank检索到的鹿亚科其它动物同源序列,用生物软件进行统计分析。[结果]我国鹿亚科动物D-loop区序列全长在921～1072bp,碱基T、A、C、G的平均含量分别为32.1%、30.2%、22.7%及15.0%,各物种间的遗传距离范围在0.062～0.106,处于属间差异。系统进化树结果表明梅花鹿、马鹿和白唇鹿亲缘关系较近,它们与水鹿构成一组进化枝,坡鹿与麋鹿构成一组进化枝,豚鹿单独构成一个进化枝。[结论]支持麋鹿和豚鹿并入鹿属的观点,我国的鹿亚科动物的分化时间约为155～260万年。
- 涂剑锋邢秀梅徐佳萍杨颖杨福合
- 关键词：控制区遗传分化
- 基于线粒体控制区全序列的鹿亚科系统发育分析
- 测定了13种鹿亚科动物线粒体DNA控制区全序列,并结合从GenBank获得的12种鹿亚科动物同源序列进行分析。结果显示:25种鹿亚科动物线粒体控制区序列全长在914 072之间,个体间序列差异范围在0.1%2.2%,4个...
- 涂剑锋邢秀梅刘琳玲鲁晓萍杨福合
- 关键词：线粒体DNA控制区系统发育
- 文献传递
- 基于线粒体控制区序列分析我国马鹿亚种的系统进化关系被引量：1
- 2010年
- 测定了6个马鹿亚种和左家型马鹿线粒体控制区全序列,并结合GenBank中四川和西藏马鹿亚种序列进行分析。结果显示：马鹿亚种的控制区序列长度在916～995bp之间,碱基A＋T含量明显高于G＋C,发现117个多态位点和长为37~39 bp重复单元,平均核苷酸多样度为0.0478,这些表明我国马鹿亚种间控制区遗传多样性较为丰富。通过邻接法和最大似然法构建马鹿系统进化树,其结果表明：我国马鹿亚种明显分为两个进化枝,亚种间的进化关系与其地理位置密切相关。
- 涂剑锋杨福合邢秀梅查代明李一清
- 关键词：马鹿线粒体控制区系统进化
- 马鹿线粒体DNA序列多态性分析被引量：18
- 2006年
- 采用聚合酶链式反应(PCR)技术对40只马鹿mtDNA细胞色素b序列进行扩增,对所得PCR产物测序,测得405 bp的核甘酸片段序列,统计分析了6个品种或类型间的遗传关系,通过遗传关系建立了系统发育树。结果表明:天山马鹿和东北马鹿的亲缘关系较近,塔里木马鹿同天山马鹿、阿尔泰马鹿、甘肃马鹿、东北马鹿、左家马鹿的亲缘关系较远,塔里木马鹿和天山马鹿的亲缘关系最远。将6个马鹿品种(或类型)重新划分为4大类群:东北马鹿和左家马鹿为一类,天山马鹿和阿尔泰马鹿为一类,塔里木马鹿为一类,甘肃马鹿为一类。
- 邢秀梅杨福合苏伟林李一清
- 关键词：马鹿MTDNA
- 绿头鸭线粒体DNA控制区全序列测定及分析被引量：1
- 2009年
- 用PCR产物直接测序法,获得5只绿头鸭线粒体DNA控制区(D-loop)全序列。序列分析显示:绿头鸭D-loop区全长为1051bp,碱基A、G、T、C含量分别为27.97%、15.51%、25.21%、31.30%,A+T含量大于C+G;共检测到11个多态位点,其中转换10个,颠换1个,没有发现插入和缺失,核苷酸多样度为0.0046。结合GenBank已公布河鸭属鸭类D-loop区序列,基于邻接法和最小进化法构建河鸭属鸭类系统进化树。结果表明,绿头鸭、斑嘴鸭及家鸭三者关系密切,它们共同构成进化枝A,推测在家鸭的形成过程中,绿头鸭和斑嘴鸭都作出了贡献;其它河鸭类聚为进化枝B。
- 涂剑锋司方方邢秀梅杨福合
- 关键词：绿头鸭D-LOOP区
- 绿头鸭线粒体ND2基因全序列测定及其研究被引量：4
- 2009年
- [目的]分析绿头鸭的系统进化关系。[方法]用PCR产物直接测序的方法,测得4只绿头鸭线粒体ND2基因全序列,结合Gen-Bank中已公布河鸭属野鸭ND2基因全序列,基于N-J法和MP法构建河鸭属野鸭系统进化树。[结果]4只绿头鸭ND2基因序列完全一致,其全长为1 041 bp,碱基A、G、T、C含量分别为28.91%、13.35%、20.75%和36.98%,A+T含量约等于C+G;绿头鸭ND2基因序列与斑嘴鸭完全相同,与其他野鸭的同源性较高。系统进化树结果表明,绿头鸭与斑嘴鸭关系密切,两者共享一个单倍型,它们与棕颈鸭、针尾鸭及绿翅鸭同属于进化枝A。[结论]家鸭可能由绿头鸭和斑嘴鸭驯化而来。
- 涂剑锋司方方邢秀梅杨福合
- 关键词：绿头鸭系统进化树
