山东省医药卫生科技发展计划重点项目(2007HZ090)
- 作品数：7 被引量：81H指数：5
- 相关作者：李岩徐爱强王海岩陶泽新樊庆莹更多>>
- 相关机构：山东省疾病预防控制中心山东大学中国疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：山东省医药卫生科技发展计划重点项目国家科技重大专项山东省科技发展计划项目更多>>
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- 无菌性脑膜炎暴发中柯萨奇B3病毒的基因特征分析被引量：5
- 2009年
- 目的明确2008年山东省临沂市郯城县无菌性脑膜炎暴发的病原，对分离到的柯萨奇B3病毒的基因特征、遗传变异规律及进化来源进行分析。方法采集暴发病例的粪便、脑脊液标本，应用RD、Hep-2细胞进行病毒分离；阳性分离物分别采用中和试验、逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）和核苷酸序列测定方法进行定型，最后与GenBank中检索到的其他CVB3毒株进行同源性分析，并构建VP1完整编码区亲缘进化树研究其遗传进化规律。结果共采集22份粪便和120份脑脊液标本，分离到病毒35株，经鉴定34株为CVB3，1株为ECH030。34株CVB3分离株VPI区部分序列（381bp）核苷酸同源性为90.5％-100％，氨基酸同源性为98.4％-100％；与Nancy原型株的核苷酸同源性为79.5％-81.6％，氨基酸同源性为98.4％-99.2％。012／2008TC／SD／CHN和177／2008TC／SD／CHN与安徽2008年分离的Fuyang19株同源性最高，核苷酸同源性分别为98.2％和91.0％，氨基酸同源性分别为99.2％和98.9％；进化树分析显示，中国大陆分离株独处一支，且呈单源性发生关系。结论此次脑膜炎暴发的病原是CVB3。它与其他的中国分离株同源性高，与国外分离到的CVB3具有不同的基因特征。
- 樊庆莹周晓琳杨赫陶泽新李岩刘桂芳刘尧宋立志张丽王海岩徐爱强
- 关键词：脑膜炎无菌性基因
- 手足口病患儿柯萨奇病毒A10型山东地方株VP1区基因特征分析被引量：21
- 2010年
- 目的了解手足口病（HFMD）患儿标本中分离到的柯萨奇病毒A10型（Coxsackie virus A10，CVA10）山东地方株VP1区基因特征。方法采集2008年至2009年部分HFMD病例临床标本，细胞培养方法分离病毒，提取病毒核酸，RT—PCR扩增病毒VPl区序列，生物信息学方法鉴定其基因型别。选择代表性CVA10毒株，与GenBank中检索到的其他CVAl0毒株进行核苷酸和氨基酸同源性分析，并以VP1部分序列构建亲缘进化树。结果从山东省HFMD患儿的760份临床标本中分离出330株病毒，其中有17株分子定型鉴定为CVA10-CVA10山东地方株彼此间核苷酸和氨基酸的同源性分别在82．3％～100．0％和94．2％～100．0％，与CVAl0原型株（Kowalik株）核苷酸和氨基酸的同源性为75．6％～76．8％和90．2％～93．2％。亲缘进化树显示，CVA10山东地方株分别属于两个不同的基因亚型。结论CVA10也是引起HFMD的病原体之一，山东省存在CVA10两种基因亚型的共循环。
- 杨赫陶泽新王海岩李岩樊庆莹冯艺李忠王显军徐爱强
- 关键词：手足口病
- 肠道病毒A组山东地方株的基因型分布被引量：18
- 2009年
- 为研究肠道病毒A组山东地方株的基因型及分子进化特征,本研究采集1998-2008年急性弛缓性麻痹（AFP）患者及2008年和2009年手足口病（HFMD）患者粪便标本,进行肠道病毒分离。来自HFMD病例的阳性病毒分离物进行肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A16型（CVA16）特异性逆转录-聚合酶链反应鉴定,随即选取部分阳性分离株进行VP1完整编码区核苷酸序列测定和分析。EV71和CVA16特异性引物阴性者以及来自AFP病例的阳性病毒分离物采用A组肠道病毒特异性引物进行VP1完整编码区核苷酸序列测定。所获得序列与其他A组各基因型代表株进行比较并构建系统发生树。共获得293株肠道病毒A组山东地方株,分别属于CVA4、CVA5、CVA10、CVA14、CVA16、EV71、EV76、EV90共8个基因型。各基因型内山东地方分离株跟原型株相比基因序列同源性较低,系统发生学分析显示肠道病毒A组山东地方株各血清型中与原型株亲缘关系较远,提示山东省存在不同基因特征的A组肠道病毒传播。
- 陶泽新李岩王海岩宋立志刘桂芳刘尧林小娟冯蕾杨赫樊庆莹徐爱强
- 关键词：肠道病毒急性弛缓性麻痹分子流行病学分析
- 人类肠道病毒B组73、75和97型山东地方株的鉴定及其基因特征分析被引量：3
- 2010年
- 本研究对3例急性弛缓性麻痹患者标本的阳性病毒分离物进行了分子生物学定型。按照文献报道的方法,用扩增人类肠道病毒(Human Enterovirus,HEV)VP1完整编码区通用引物008-013、011-012进行逆转录-聚合酶链反应,反应产物纯化后进行序列测定。所得序列通过BLAST程序进行基因定型,显示3株病毒分别为HEV B组中新型病毒HEV73、HEV75和HEV97。将获得的序列与GenBank数据库中已有的各型病毒株VP1基因序列进行同源性分析并构建系统发生树,结果显示与各自的原型株相比有较大的变异,提示本次发现的HEV B组73、75、97型山东地方株与各型原型株相比具有不同的基因特征,这是在国内首次发现HEV97。
- 陶泽新王海岩徐爱强宋立志李岩刘桂芳刘尧樊庆莹
- 关键词：急性弛缓性麻痹分子进化基因特征
- 柯萨奇B5病毒引起山东省一起无菌陛脑膜炎暴发的鉴定及其亲缘进化分析被引量：16
- 2010年
- 目的鉴定引起2005年山东省兖州市一起无菌性脑膜炎暴发的病原体，并对分离的柯萨奇B5病毒（CVB5）进行基因特征分析。方法从充州市无菌性脑膜炎暴发期间部分住院患者中采集78份粪便标本和58份脑脊液标本进行病毒分离和血清型鉴定；同时对其阳性分离物采用反转录一聚合酶链反应进行分子定型，对其中的CVB5进行全长VP1区核苷酸序列测定和亲缘进化分析。结果78份粪便标本和58份脑脊液标本的病毒分离率分别为38．5％（30／78）和48．3％（28／58）。58株阳性分离物的血清型鉴定和分子定型结果显示，其中54株为CVB5，2株为ECH024，CVB3和CVA9各1株。病原学结果显示引起此次无菌性脑膜炎暴发的病原体主要为CVB5。同源性分析显示，CVB5分离株与2002年浙江分离株（Zhejiang／12／02株）在核苷酸水平上同源性最近，为97．5％，97．8％；与CVB5原型株（Faulkner株）相比核苷酸同源性为78．3％～78．6％。VP1区亲缘进化树显示CVB5可以分为A、B、C、D4个基因型，引起本次暴发的CVB5属于基因型D。结论CVB5是引起兖州市无菌性脑膜炎暴发的病原体。优势基因型的变迁可能是造成无菌性脑膜炎反复暴发的因素之一。
- 王海岩李岩徐爱强张勇陶泽新刘桂芳刘尧宋立志张丽颜丙玉纪峰许文波
- 关键词：无菌性脑膜炎
- 肠道病毒B组山东地方株的基因型分布被引量：26
- 2010年
- 为明确源自急性弛缓性麻痹（AFP）病例的HEV-B组病毒山东地方株的基因型分布,探讨其优势基因型的变迁与疾病暴发之间的关系,本研究对山东省1994年~2008年AFP监测系统分离到的HEV-B组病毒进行了VP1区核酸扩增和序列测定。序列测定结果显示HEV-B山东地方株共包括29种基因型,其中CVA 1种（CVA9）,CVB 5种（CVB1~5）,ECHO 20种以及新型肠道病毒EV73、75、97。其中ECHO11、CVB3、ECHO6、ECHO14、ECHO25是AFP监测系统中最常分离到的B组病毒。同源性比较显示,相同血清型HEV-B山东地方株型内核苷酸同源性最小75.4%,最大99.6%,与原型株核苷酸同源性最小73.8%,最大85.2%,但氨基酸变异不大。研究表明,不同基因型病毒具有不同的时间循环模式,相同基因型毒株内部根据其遗传距离的远近又可划分为不同的基因亚型,从而帮助确定HEV的传播途径和传播范围。
- 王海岩刘昆陶泽新李岩刘桂芳刘尧冯蕾樊庆莹杨赫宋立志徐爱强
- 关键词：肠道病毒无菌性脑膜炎基因型
- 肠道病毒C组山东地方株的基因型分布
- 2010年
- C组肠道病毒（Human enterovirus C,HEV-C）共包括18个血清型,通过使用现有的组合血清进行中和试验的方法难以鉴定它们的型别。为探讨HEV-C山东地方株的基因型分布及分子进化特征,本研究对1994年~2008年急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）监测系统中分离到的未定型的毒株,采用HEV-C VP1完整编码区的特异性引物,进行逆转录-聚合酶链反应（Reverse transcriptase-polymerase chain reaction,RT-PCR）,产物进行序列测定后,通过NCBI服务器中BLAST程序进行型别鉴定,并与其他HEV-C各基因型代表株进行比较并构建系统发生树。共获得12株HEV-C山东地方株,分别属于4个基因型：CA20、CA21,CA24和EV96。各基因型内山东地方分离株跟原型株相比基因序列同源性较低,系统发生学分析显示HEV-C山东地方株各血清型与原型株亲缘关系较远,提示山东省存在不同基因特征的HEV-C传播。
- 李岩刘尧王海岩陶泽新宋立志刘桂芳冯蕾冯艺林小娟杨赫樊庆莹徐爱强
- 关键词：肠道病毒急性弛缓性麻痹分子流行病学分析
