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国家自然科学基金(81241100)

作品数：5 被引量：12H指数：3
相关作者：仇小强谭超刘顺曾小云谭盛葵更多>>
相关机构：广西医科大学桂林医学院广西壮族自治区疾病预防控制中心更多>>
发文基金：国家自然科学基金桂林市科学研究与技术开发项目广西壮族自治区科学研究与技术开发计划更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

文献类型

  • 5篇中文期刊文章

领域

  • 5篇医药卫生

主题

  • 3篇多态
  • 3篇多态性
  • 3篇细胞
  • 3篇基因
  • 3篇肝细胞
  • 2篇转录
  • 2篇转录因子
  • 2篇细胞癌
  • 2篇基因多态性
  • 2篇肝细胞癌
  • 2篇标志物
  • 2篇叉头
  • 2篇叉头转录因子
  • 2篇叉头转录因子...
  • 2篇大数据
  • 1篇单核
  • 1篇单核苷酸
  • 1篇单核苷酸多态
  • 1篇单核苷酸多态...
  • 1篇遗传易感

机构

  • 5篇广西医科大学
  • 3篇桂林医学院
  • 1篇广西壮族自治...

作者

  • 5篇仇小强
  • 3篇曾小云
  • 3篇刘顺
  • 3篇谭超
  • 2篇潘冬香
  • 2篇谭盛葵
  • 2篇陈谦
  • 1篇杨丹
  • 1篇黄慧
  • 1篇柏桦
  • 1篇刘柳
  • 1篇郭雪峰
  • 1篇黄雄

传媒

  • 3篇中华疾病控制...
  • 1篇中国癌症杂志
  • 1篇中华流行病学...

年份

  • 2篇2017
  • 1篇2015
  • 1篇2014
  • 1篇2013
共 5 条 记 录，以下是 1-5
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排序方式：
叉形头转录因子O亚型相关基因位点多态性与肝细胞癌关系被引量：4
2014年
目的探讨叉形头转录因子O亚家族（forkhead box-containing protein O subfamily,FOXO）基因多态性与肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）遗传易感性的关系。方法采用以医院为基础的病例对照研究方法,选取1 049例HCC患者作为病例组,1 052例无肿瘤患者作为对照组,对照组按年龄、性别、民族与病例组频数匹配。采用高通量TaqMan MGB实时荧光定量聚合酶链式反应（real-time fluorescent guantitative polymerase chain reaction,RT-PCR）技术对FOXO1的rs17592236位点、FOXO3的rs4946936位点和FOXO4的rs4503258位点进行基因分型。应用Logistic回归模型分析上述位点单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与HCC发病风险的关系,并研究基因多态性与环境因素的交互作用。结果 rs17592236、rs4946936和rs4503258位点基因型在病例组和对照组中分布差异均无统计学意义（均有P〉0.05）。多因素Logistic回归分析发现,rs17592236位点CT/TT基因型可能降低HCC发病风险[P=0.010,OR（95%CI）=0.699（0.526~0.927）]。分层分析结果显示rs17592236位点SNP与HCC发病风险存在统计学关联。交互作用分析显示,rs17592236、rs4946936、rs4503258位点多态性与吸烟、饮酒、HBV感染、肝癌家族史4种环境因素均存在交互作用,rs17592236与rs4503258位点SNPs之间存在基因-基因交互作用[P=0.003,OR（95%CI）=0.755（0.628~0.908）]。结论携带FOXO1的rs17592236位点突变等位基因T可能降低HCC发病风险。rs17592236、rs4946936、rs4503258与环境危险因素的交互作用可能与HCC发生有关。
谭超仇小强谭盛葵曾小云刘顺李岸花
关键词：叉头转录因子类疾病遗传易感性
FOXO基因多态性与肝细胞癌临床病理特征的关系被引量：3
2015年
目的 探讨叉头转录因子O亚族（forkhead transcription factors box class O,FOXO）单核苷酸多态性与肝细胞癌临床病理特征的关系。方法 采用TaqMan-MGB高通量实时荧光定量聚合酶链式反应法对FOXO基因的3个多态性位点进行基因分型,运用χ2检验和多因素Logistic回归模型分析FOXO基因3个多态性位点与肝细胞癌临床病理特征的关系。结果 携带rs4946936位点T等位基因的个体发生脉管侵犯的风险下降（P=0.038,OR=0.773,95%CI：0.606～0.986）,携带rs4503258位点T等位基因的个体发生肝硬化的风险降低（P=0.034,OR=0.767,95%CI：0.600～0.980）,携带rs17592236位点T等位基因的个体出现癌栓的风险增加（P=0.031,OR=1.244,95%CI：1.020～1.517）。结论 FOXO基因多态性与肝癌脉管侵犯、癌栓和肝硬化的发病风险相关,对肝癌的发展和生存的早期预测有重要参考价值。
李岸花谭超刘顺曾小云谭盛葵潘冬香郭雪峰杨丹覃若云刘柳黄雄仇小强
关键词：叉头转录因子类
XPC和XRCC1基因多态性与肝细胞癌根治术后预后的关联研究
2013年
背景与目的:近几年的文献表明,XPC、XRCC1基因多态性与多种肿瘤预后生存相关,但其与肝癌预后关联研究的文献报道较少。本研究旨在探讨XPC939和XRCC1-399位点单核苷酸多态性与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)根治术后患者预后的关系。方法:收集2007年2月—2008年10月广西医科大学第一附属医院行肝癌根治性切除术,且经病理诊断为HCC的广西新发病例临床特征,血液DNA和预后生存资料,对其中143例有完整随访资料病例进行分析。采用TaqMan-MGB实时荧光定量聚合酶链式反应(real-timequantitative polymerase chain reaction,RT-PCR)技术对XPC939、XRCC1-399多态位点进行基因分型。应用Kaplan-Meier法进行生存分析,组间比较用Log-rank检验,多因素分析采用Cox模型分析。结果:总的1、2、3年生存率分别为81.8%、76.2%和67.1%,中位无进展生存时间为27个月。生存分析显示,携带XPC939 C等位基因基因型AC+CC患者中位无进展生存时间(32个月)长于携带XPC939 A等位基因(AA)基因型患者(16个月),差异有统计学意义(χ2=4.320,P<0.05)。按肿瘤直径大小分层分析显示,携带XRCC1-399 GG基因型患者的总体生存率高于携带XRCC1-399 GA+AA基因型患者,差异有统计学意义(χ2=4.105,P<0.05)。多因素Cox回归分析未发现XRCC1-399基因与HCC根治术后患者预后独立相关。结论:在行HCC根治术后的患者预后中,XPC939和XRCC1-399基因多态性与临床特征无关,XPC939基因多态性与无进展生存期相关,XRCC1-399基因多态性可能对HCC根治术后患者远期预后有一定影响。
潘冬香仇小强曾小云刘顺柏桦谭超黄慧
关键词：肝细胞癌单核苷酸多态性
基于大数据的肝癌血管侵袭标志物分析被引量：3
2017年
目的 通过对GEO（Gene Expression Omnibus）与TCGA（The Cancer Genome Atlas）数据库分析，挖掘肝癌血管侵袭相关的microRNA，并分析其预后和可能机制。方法 利用GEO数据库获得肝癌血管侵袭microRNA芯片数据（GSE67140），对5种侵袭能力不同的细胞系（SNU423、SNU449、HepG2、Hep3B、SNU398）表达谱进行差异分析，并在81份血管侵袭阳性组织样本与91份血管侵袭阴性组织样本中验证差异分析结果。结合TCGA数据库中362例肝癌病例数据分析其预后，并对microRNA所调控的基因进行GO与KEGG分析。结果 hsa-mir-1180、hsa-mir-149、hsa-mir-744、hsa-mir-940在侵袭能力强的肝癌细胞和有血管侵袭的肝癌组织中表达上调（logFC〉 1，P〈 0.05）。生存分析显示，hsa-mir-1180（HR=1.623，95%CI：1.114～2.365，P=0.012）、hsa-mir-149（HR=2.400，95%CI：1.639～3.514，P〈 0.001）、hsa-mir-744（HR=1.679，95%CI：1.161～2.427，P=0.006）、hsa-mir-940（HR=1.704，95%CI：1.188～2.443，P=0.004）是肝癌病例预后独立危险因素，高表达与患者生存期缩短显著相关（P〈 0.05）。GO与KEGG分析其机制可能与免疫反应、细胞黏附、紧密连接等信号通路有关。结论 通过对TCGA与GEO数据库的挖掘，初步发现hsa-mir-1180、hsa-mir-149、hsa-mir-744、hsa-mir-940对肝癌的预后有影响，可作为肝癌预后的生物标志物。
陈谦仇小强
关键词：肝癌标志物MICRORNA大数据
基于大数据对宫颈癌缺氧生物标志物的分析被引量：3
2017年
目的在GEO(gene expression omnibus)和TCGA(the cancer genome atlas)数据库中挖掘宫颈癌缺氧标志物并对其预后进行生存分析。方法利用GEO数据库中宫颈癌表达谱(GSE75034)缺氧组织和非缺氧组织中的数据进行差异性分析,再运用基因功能分析(gene ontology,GO)与通路富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)筛选出相关的通路和相关功能的基因,结合TCGA数据库中宫颈癌的数据对其预后运用KaplanMeier与Log-rank检验方法进行生存分析。结果显示有337个基因表达存在差异,缺氧组织中上调的基因有184个,下调的有153个。GO分析显示这些基因与免疫反应、炎症反应、细胞增殖、血管形成等有关;KEGG分析显示主要富集在TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路等。生存分析显示富集在HIF-1通路上的PAI-1、BCL-2、HK-2与宫颈癌病人预后相关,其中PAI-1、HK-2是预后的危险因素(均有P<0.05),高表达组与患者生存期缩短相关,BCL-2是保护因素(X^2=6.508,P=0.011),高表达组与患者生存期延长相关。结论 PAI-1、BCL-2、HK-2可以作为宫颈癌缺氧生物标志物,与宫颈癌病人的预后相关,为后续的研究提供新思路。
陈谦仇小强
关键词：宫颈肿瘤缺氧数据库
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