广东省医学科学技术研究基金(A2007272)
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
- 相关作者：陶爱林邹泽红李胜涛刘昌文张建国更多>>
- 相关机构：广州医学院第二附属医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省医学科学技术研究基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- MHC-Ⅱ类抗原表位预测软件的对比评价被引量：3
- 2010年
- 比较不同MHC-Ⅱ类抗原表位预测软件的优缺点,为后续应用提供依据。在众多HLA-Ⅱ类抗原表位中,选取HLA-DR的6个表位(DRB1*0101,0301,0401,0701,1101和1501)为代表,选取MHCBN数据库中的309条已知抗原表位的肽链为待测肽链。使用近年来常用的7个表位预测软件,根据不同软件的临界值确定入选结果数据,比较各软件所得结果与已有的实验结果之间的差距以确定其优劣。综合7个软件预测结果进行评价,得出NetMHCⅡ和NetMHCⅡpan所得结果准确率最高。可以用NetMHCⅡpan及NetMHCⅡ进行MHC-Ⅱ类分子抗原表位预测。不同软件HLA的各个亚型的预测所得指标不一致,提示综合运用不同软件对多肽表位进行预测十分必要。
- 李胜涛刘昌文邹泽红陶爱林
- 关键词：表位预测
- 豚鼠听力衰退模型的AFLP分子标记筛选被引量：1
- 2008年
- 目的获取扩增片段长度多态性(AFLP)标记,揭示老年性耳聋的发病机制。方法腹腔注射D-半乳糖致衰老豚鼠模型,另加噪音刺激建立豚鼠听力衰退模型,并列模型组和生理盐水对照组中的听力值极端表型个体进行AFLP标记的筛选,并在空白对照组中验证。结果14对选择性扩增引物仅扩增到1个能将两类极端表型绝然区别开来的多态性条带,其预测表型的准确度在83%以上。结论AFLP筛选技术具有较高的功效,所得的标记较以往线粒体标记的有效性高。
- 陶爱林毛敏张建国赖荷严小玲邹泽红陈德宜全
- 关键词：听力衰退
