湖南省自然科学基金(04JJ40021)
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
- 相关作者：郑济芳龙黎南贺庆芝朱睦元刘俊更多>>
- 相关机构：南华大学浙江大学更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学基金博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生更多>>
- 中华鳖孵化一周胚胎的肾脏/尿生殖嵴混合组织的cDNA文库构建与特征(英文)被引量：3
- 2005年
- 为克隆到与胚胎发育有关的新基因,以孵化一周的中华鳖(Trionyxsinensis)胚胎的肾脏及尿生殖嵴混合组织为原始材料,采用SMART和长距离PCR技术,构建了一个中华鳖cDNA表达文库。分析结果表明,该未扩增的cDNA文库大约含有4.134×105个克隆。任意挑取了192个克隆,提取质粒后用SfiⅠ酶切鉴定表明没有插入片段的克隆为9个,插入了cDNA片段的克隆为183个,插入的cDNA片段大小范围为0.4-3.8kb。其中,插入片段在0.4-1.0kb之间的克隆为19个,在1.1-2.0kb之间的克隆为53个,在2.1-3.0kb之间的克隆为92个,大于3.1kb的克隆为19个。另外,任意挑选45个克隆,提取质粒后,从5′端进行测序,Blast分析表明,除了21个序列在GenBank中找不到同源序列外,其余24个序列在GenBank中均被证实有各自相应的同源序列,这些序列代表6种类型的基因核糖体蛋白基因、代谢酶基因、组织特异性表达的基因、转录因子基因、受体蛋白基因及其它基因。该发育阶段特异性cDNA文库可以进一步用于中华鳖胚胎发育过程中相关基因的鉴定分离、结构功能分析、以及表达调控机制等研究。
- 郑济芳朱睦元
- 关键词：CDNA文库爬行动物
- 红鲫Sox4基因保守区的克隆与序列分析
- 2007年
- 目的为进一步全面理解鱼类Sox基因的复制与进化,从红鲫基因组DNA中克隆Sox基因HMG盒保守区。方法参照Sox基因HMG盒保守区的氨基酸序列设计一对兼并引物,以红鲫基因组DNA为模板进行PCR扩增,并对扩增产物进行亚克隆和测序。结果获得2个序列(序列Ⅰ和序列Ⅱ)。同源性比较显示,序列Ⅰ和序列Ⅱ编码的氨基酸序列均与小鼠Sox4的同源性最高,分别为88.9%和90.7%;氨基酸序列排序比较,序列Ⅰ和序列Ⅱ也都与人Sox4的同源性最高。结果表明,红鲫序列Ⅰ和序列Ⅱ均是小鼠、人Sox4基因的直向同源基因,分别命名为RcSox4-1和RcSox4-2。结论Sox4基因在红鲫进化过程中发生了基因复制,Sox4基因复制可能发生在红鲫、斑马鱼及草鱼分化之前。
- 龙黎南贺庆芝刘运莲杨露青殷杰郑济芳
- 关键词：红鲫SOX基因基因复制进化
- 红鲫Sox1和Sox11b基因保守区的克隆与表达分析
- 2008年
- 目的进一步理解鱼类Sox基因的进化和表达方式。方法采用兼并引物PCR,从红鲫基因组DNA中克隆、测序和分析Sox基因。采用RT-PCR,研究Sox基因在红鲫13种不同组织中的表达。结果克隆和测序了红鲫Sox1-1、Sox1-2、Sox1-3、Sox11b1-1、Sox11b1-2和Sox11b2基因的HMG盒区序列。Sox1-1、Sox1-2和Sox1-3编码相同的氨基酸,在肝、脾、肾、心脏和脑组织中均有不同程度表达,在脑组织中检测到大量的转录物。Sox11b1-1和Sox11b1-2编码相同的氨基酸,系统发生树显示,红鲫Sox11b1和Sox11b2基因与斑马鱼Sox11b基因聚在一起,而远离斑马鱼Sox11a基因。在下丘脑和小脑中检测到Sox11b1-1和Sox11b1-2基因转录物,而没有检测到Sox11b2基因转录物。结论Sox1和Sox11b基因在进化过程中发生了复制。Sox1基因可能在神经系统中起着重要的作用。Sox11b1-1、Sox11b1-2和Sox11b2有相似而不同的表达方式。
- 郑济芳龙黎南刘俊贺庆芝秦志峰
- 关键词：红鲫SOX基因克隆进化
