江苏省教育厅自然科学基金(05SJD240028)
- 作品数：8 被引量：35H指数：5
- 相关作者：孟学平申欣程汉良田美赵娜娜更多>>
- 相关机构：淮海工学院福建师范大学南京农业大学更多>>
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- 江苏连云港沿海蛤蜊科贝类18S-ITS1序列分析被引量：2
- 2009年
- 利用PCR技术扩增了江苏连云港海域3种贝类(西施舌、中国蛤蜊,四角蛤蜊)核糖体RNA基因18S-ITS1区域序列。用DNAStar和MEGA3.1软件分析序列的碱基组成、进行序列比对,构建系统发育树。结果显示,西施舌、中国蛤蜊、四角蛤蜊18S-ITS1部分序列长度分别为1052bp、1017bp、1013bp,ITS1部分序列长度分别为910bp、875bp、871bp,G+C含量为58.90%～60.23%;18S区序列保守,种间仅存一个碱基变异位点。序列分析显示,中国蛤蜊与四角蛤蜊的ITS1同源性为70.1%～71.1%。西施舌与中国蛤蜊、四角蛤蜊的同源性为44.7%～46.3%;18S-ITS1序列适于蛤蜊科种间特别是蛤蜊属内种间的分子系统发育分析。
- 孟学平陈建安申欣程汉良董志国阎斌伦田美
- 关键词：RRNA基因ITS1西施舌中国蛤蜊四角蛤蜊
- 双壳纲贝类18S rRNA基因序列变异及系统发生被引量：6
- 2011年
- 双壳纲贝类栖息于环境多变的海域,是一个形态学和生态学都具有多样性的类群,清晰而可靠的进化关系对于养殖与相关种类的管理具重要意义。然而,目前对双壳类宏观分子系统学研究的报道较少。研究用18S rRNA基因(18S)分析了双壳类3个亚纲贝类的系统发育关系。从GenBank下载帘蛤目、海螂目、贻贝目、胡桃蛤目、蚶目、珍珠贝目6个目94个种类的18S全/部分序列107个,通过ClustalX软件进行序列比对,用MEGA4.1软件和PHyML软件计算遗传距离,构建系统发育树,研究了双壳类18S变异规律及其在系统发生研究中的应用。结果显示18S有插入/缺失序列,存在长度多态性。序列比对显示有5段约30 70bp的保守区,4段约130 550bp的高变区。碱基组成平均为T:24.4%,C:23.6%,A:24.5%,G:27.5%。G+C含量为51.1%。在1796个比对位点中,变异位点占31.7%,简约信息位点占24.0%。目内科间遗传距离为0.003 0.043,目间遗传距离为0.026 0.093。NJ树和ML树显示贻贝目、珍珠贝目、胡桃蛤目、蚶目和海螂目的缝栖蛤科先分别聚为支持率很高(BPN=94 100)的单系支,后聚为一大支(BPN=100)。蛤蜊科与帘蛤目的其他科分离形成一置信度很高的单系支(BPN=93)。帘蛤科种类聚为置信度较低(BPN=60)的一支。海螂目、帘蛤目的种类没能完全聚到所属支系,彼此嵌套,缝栖蛤科的种类从海螂目中分离出来。18S资料揭示帘蛤目的蛤蜊科、海螂目的缝栖蛤科已经进化为独立的支系。
- 孟学平申欣程汉良赵娜娜
- 关键词：双壳纲RRNA基因
- 双壳纲贝类18S rRNA基因序列变异及系统发生分析5
- 纲(Bivalvia)为软体动物门的一个纲,全世界约有2 万种.我国有8 个目.生态及形态上极具多样性,在我国,双壳贝类分类工作已有几十年的历史,双壳类种类繁多,分类困难,目前,以形态学资料为依据的分类结果常出现分岐.
- 孟学平申欣程汉良田美
- 连云港沿海蛤蜊科贝类rRNA基因18S-ITS1序列分析
- 西施舌(Coelomactra antiquata)、中国蛤蜊(Mactra chinesis)和四角蛤蜊(Mactra veneriformis)属帘蛤目蛤蜊科贝类,前者属腔蛤蜊属,后两种属蛤蜊属。这三种贝类是连云港沿...
- 陈建安孟学平
- 关键词：人工养殖四角蛤蜊
- 文献传递
- 西施舌可食部分微量元素分析与评价被引量：6
- 2012年
- 分析西施舌可食部分不同部位微量元素含量,评价其营养价值和重金属污染情况。用硝酸-高氯酸消化法消解组织,用电感耦合等离子体发射光谱(inductively coupled plasma atomic emission spectrometry technique,ICP-AES)法测定黄海日照、东海漳州、北部湾越南某海区(毗邻广西北海)3个地区西施舌闭壳肌、外套膜、斧足、鳃、内脏团5个部位(组织/器官)的12种元素。比较Ag、As、Cd、Co、Cr、Cu、Fe、Mn、Pb、Se、Sn、Zn元素在不同地域和不同部位的分布和含量。结果显示:10种元素的加标回收率为78.3%～112.1%,相对标准偏差为0.16%～7.46%;西施舌富含Fe、Zn、Mn、Cu、Se等人体必需的微量元素,Ag和Sn元素含量低;多数元素在同域不同部位的含量存在显著差异(P<0.05),日照西施舌外套膜、内脏团Fe的含量显著(P<0.05)高于同域其他组织及漳州、越南西施舌所有组织;西施舌As、Cd的含量超过国家卫生限量标准,但Cd的含量低于世界卫生组织、澳大利亚、香港的限量标准。
- 孟学平郝珏梁猛申欣赵娜娜程汉良阎斌伦田美
- 关键词：西施舌微量元素可食部分
- 西施舌Cyt b基因核苷酸差异分析被引量：5
- 2010年
- 从线粒体DNA水平对我国沿海西施舌进行了遗传差异和系统发育研究,为其保护和可持续利用提供理论依据。对4个不同地理群体西施舌Cyt b基因片段进行了扩增、测序,利用MEGA4.1进行序列比对分析,以文蛤和中华文蛤为外类群,构建系统进化树。结果获得394 bp的Cyt b基因片段,其T、C、A、G含量分别为38.4%、16.9%、23.6%、21.1%,A+T含量明显高于G+C含量。在394 bp比对位点中,有318个保守碱基,76个变异位点。其中,70个简约信息位点。长乐与其他3个群体之间的遗传距离为0.194～0.209。氨基酸序列比对结果显示长乐群体与3个非长乐群体有7个位点的氨基酸差异,遗传距离为0.053。由此可见长乐群体是一个具有明显分子遗传特征的独立群体。
- 孟学平申欣张波程汉良田美郑雯雯
- 关键词：西施舌CYT
- 西施舌(软体动物,双壳纲)线粒体基因组分析
- 线粒体全基因组在揭示后生动物精确的演化关系中发挥着很重要的作用。目前在GenBank可检索到的软体动物线粒体基因组100多个,其中双壳类线粒体基因组44个(占33.3%),分布在5个目9个科中,帘蛤目的有鸟蛤科、截蛏科和...
- 孟学平申欣赵娜娜程汉良阎斌伦郝珏梁猛董志国
- 关键词：西施舌双壳纲基因排列
- 文献传递
- 西施舌5个地理群体ITS1序列变异及系统发生分析被引量：12
- 2010年
- 利用核糖体rRNA基因第一内转录间隔区(ITS1)序列,对我国山东日照(RZ)、江苏连云港(LYG)和启东(QD)、福建长乐(CL)、广西北海(BH)沿海西施舌5个野生群体的遗传结构进行了分析。经PCR扩增、克隆、非克隆测序,获得长度为816—843bp的ITS1核苷酸序列,其平均G+C含量(60.8%)显著高于A+T含量。在西施舌5个群体93个个体118个序列中共检测到153个变异位点,多态位点比例为18.3%,其中,简约信息位点为63个,共有63种基因型。群体间遗传距离在0.74%—3.38%之间,群体内遗传距离为0.72%—1.06%之间。CL群体与其他4个群体间的遗传距离明显高(3.17%—3.38%)。AMOVA分析结果显示长乐群体有明显的遗传分化(FST=0.670—0.702,P(0.001)。以中国蛤蜊为外群构建的NJ树和ML树显示CL群体聚为一支,非长乐群体互相重叠聚为另一支,研究结果显示,长乐群体已经形成了具有明显遗传结构的地理种群。
- 孟学平高如承申欣王帅程汉良董志国阎斌伦
- 关键词：西施舌ITS1
- 连云港海域螺类软体部分重金属和微量元素分析被引量：6
- 2012年
- 分析评价连云港海产螺类可食部分微量元素及重金属含量的安全性。用硝酸-高氯酸消化法消解组织,用电感耦合等离子体原子发射光谱法测定元素含量。结果显示:9种螺类及同种螺不同组织中Pb、Cd、Sn、As、Mn、Fe、Ni、Ag、Se、Cr、Co、Zn和Cu 13种元素含量存在差异。被测试螺中含有Fe、Cu、Zn、Co、Mn、Cr、Se和Sn等人体必需微量元素;重金属元素As、Cd和Pb的残留量指数(I)较高,且在不同螺的不同组织中的含量存在显著差异。As在9种螺类中均超标。管角螺足肌As、内脏团Cd的含量最高;Pb在托氏虫昌螺1(I=6.5)和2(I=5.5)、扁玉螺足肌(I=2.1)和管角螺内脏团(I=1.22)含量超标,其余样品低于国家食品卫生标准或I值小于1。除扁玉螺足肌组织外(I=1.21),扁玉螺内脏团和其余8种螺Cr的I值均小于1。
- 孟学平申欣王妍梁猛郝珏赵娜娜田美
- 关键词：螺类微量元素重金属
- 西施舌群体遗传结构及分化的RAPD分析被引量：5
- 2011年
- 采用55个随机引物对西施舌(Coelomactra antiquata)5个群体,即长乐(CL)、启东(QD)、连云港(LYG)、胶南(JN)和北海(BH)群体进行RAPD扩增。用PopGen(Version1.32)软件进行遗传多样性分析。结果共筛选出12个重复性好的引物,得到88条清晰稳定的条带,扩增片段在100 bp～3 000 bp之间,其中引物S299扩增的600 bp片段为长乐群体特有。多态位点比例为62.07%～78.26%(JN、LYG、BH、QD、CL群体分别为78.26%、77.05%、72.58%、70.05%、62.07%),Shannon指数为0.210 5～0.312 3。群体间遗传距离为0.068 3～0.223 9,其中长乐群体与其余4个群体间的遗传距离为0.182 7～0.223 9,4个非长乐群体的遗传距离为0.068 3～0.136 7。群体间遗传分化系数(Fst)为0.313 01(P<0.05),表明在整个遗传变异中群体间占31.30%。CL群体与QD,BH,JN,LYG群体间的遗传分化系数(Gst)分别为0.364 9,0.344 8,0.325 0,0.309 0;而非长乐群体之间的遗传分化系数为0.148 2～0.240 3;以上数据显示长乐群体遗传分化最大。聚类结果显示,启东和胶南群体首先聚为一支,然后与北海群体聚在一起,再和连云港群体相聚;而长乐群体则单独形成一支。
- 孟学平王帅高如承申欣程汉良田美
- 关键词：RAPD
