福建省自然科学基金(2011J01126) 作品数:6 被引量:15 H指数:2 相关作者: 张拥军 王金章 黄萌 翁育伟 陈炜 更多>> 相关机构: 福建医科大学 福建省疾病预防控制中心 福建省实验动物质量检测中心 更多>> 发文基金: 福建省自然科学基金 福建省卫生厅青年科研基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
实时荧光RT-PCR检测凝血块中乙脑病毒RNA 被引量:2 2011年 目的探索建立灵敏便捷的乙脑病毒核酸检测方法,为临床疑似乙脑病例提供可靠辅助诊断依据。方法采用基于SYBR Green I染料的实时荧光RT-PCR方法,对一系列乙脑病毒检测引物进行综合评价,并应用于部分临床确诊或疑似乙脑病例血清和凝血块中病毒核酸检测。结果根据9对引物检测连续稀释病毒RNA的扩增曲线和融解曲线,筛选出1对灵敏度和特异性较好的引物。该体系分别检测15份乙脑病毒IgM阳性和15份IgM阴性患者的血清和凝血块中提取的核酸,血清样品全部为阴性,而凝血块样品发现7份核酸阳性。结论从患者凝血块中提取核酸样品,可以用于JEV感染的实验室诊断。在我们建立的乙脑病毒核酸实时荧光PCR检测体系中,首次发现凝血块样品比血清样品灵敏度更高,说明凝血块用于病毒性脑炎实验室诊断具有重要价值。 张拥军 王金章 朱莉莉 陈端 陈炜关键词:实时荧光PCR 乙型脑炎病毒 凝血块 2012年1株南美洲输入登革1型病毒的基因组特征(英文) 被引量:1 2013年 目的分析2012年1株从南美洲输入登革1型病毒的基因组特征,探索登革病毒的传播规律。方法测定DF1203毒株的全长基因组序列,分析该毒株与97株南美洲登革1型毒株的遗传联系,同时比较该毒株与全球最相似毒株的遗传联系。结果 DF1203毒株的基因组全长10 735个核苷酸,编码区全长10 179个核苷酸。种系发生分析显示,该毒株与南美洲登革1型毒株存在一定差异,BLAST分析表明DF1203与东南亚毒株存在密切遗传联系,尤其与近年柬埔寨毒株在种系发生树上处于同一分支。结论虽然DF1203的患者来自南美洲苏里南,毒株遗传背景分析却显示与东南亚毒株存在亲密遗传关系。由此表明连续有效的登革病毒监测,尤其是检测分离株的部分或全部基因组序列,对于研究登革病毒传播路径、遗传进化,具有重要意义。 张拥军 王金章 黄萌 吴生根 翁育伟关键词:登革病毒 基因组序列 慢性疲劳综合征与XMRV关系之争 2012年 慢性疲劳综合征(CFS)的病原学一直没有明确的结论。2009年美国一家实验室在《科学》杂志发表论文,宣称在CFS患者样品中检测到一种逆转录病毒XMRV。而随后对其它CFS人群相关样品的一系列调查却不支持该结论。经过全球科学家近两年的重新调查,证明该实验室所用细胞系、PCR试剂可能存在污染,2011年底《科学》杂志撤销了这篇论文。这次事件说明,病原生物学研究中要警惕实验室污染,需要严谨地提出新的病原体与疾病的关系。 张拥军关键词:慢性疲劳综合征 病原生物学 登革病毒的基因组分析及中国登革毒株的来源(英文) 被引量:11 2012年 目的分析登革病毒的基因组序列,了解目前世界范围存在的各种登革病毒基因型,探索部分中国毒株的可能来源。方法分析GenBank数据库中有完整基因组序列的登革病毒序列,利用NCBI服务器对基因组编码区序列进行在线比对,按最小进化法用MEGA5.0软件绘制种系发生树。结果分析了全球范围四种血清型共3000余株登革病毒的基因组序列,分别将各血清型毒株划分为4-6个基因型。通过对各基因型毒株背景的分析,证明基因型分布与毒株的地理来源存在一定联系。39株中国毒株中,多数能够通过种系发生树确定其来源。结论全球登革病毒的基因型分布具有地区特异性,中国登革毒株的传播来源存在多样性。 张拥军 周朝晖 黄萌 王金章 陈炜关键词:登革病毒 基因组 下一代基因测序技术在新发再发传染病研究中的应用 2012年 近十年来,下一代测序技术逐渐成熟并在多个研究领域得到广泛应用。此文简要介绍了目前一些常见的下一代测序技术平台的原理及特征,尤其是在近几年几起新发再发传染病疫情暴发中,如何尽快实现对病原体进行定位及溯源。 张拥军 翁育伟 郑奎城 严延生关键词:新发传染病 基因测序 多重套式RT-PCR检测患者凝血块中登革病毒RNA(英文) 被引量:3 2012年 目的建立简便、灵敏、适合于全部血清型登革病毒核酸检测的多重套式RT-PCR体系,检测临床样品中登革病毒RNA,作为实验室辅助诊断的依据。方法利用登革病毒标准株核酸,建立多重RT-PCR检测方法。提取患者凝血块总RNA,分别用一步法RT-PCR及多重套式RT-PCR检测。结果通过对检测体系进行优化,多重RT-PCR能够同时检测4种血清型登革病毒核酸。采用多重套式RT-PCR方法,从8例登革热患者凝血块中有4例检测到病毒RNA,而其它核酸检测方法仅检出1例阳性。结论多重套式RT-PCR的方法能够从临床凝血块样品中检测到登革病毒核酸,并同时进行血清学分型,简化了登革病毒核酸检测步骤,有利于对临床样品开展病毒核酸检测。 张拥军 黄萌 翁育伟 郑友限 王金章关键词:登革病毒 核酸检测