广西壮族自治区科学研究与技术开发计划(1123007-3)
- 作品数：3 被引量：40H指数：3
- 相关作者：郭旋刘欢黄伟坚刘芳卢冰霞更多>>
- 相关机构：广西大学玉林市动物疫病预防控制中心更多>>
- 发文基金：广西壮族自治区科学研究与技术开发计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 广西仔猪腹泻病毒病原流行病学调查被引量：30
- 2013年
- 【目的】了解引起广西仔猪腹泻的主要病毒病原及其分子流行病学特点，为其防控提供理论依据。【方法】采用RT-PCR对2011年至2012年7月从广西11个城市的养猪场采集的232份病料进行猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）、猪轮状病毒（PoRV）检测和流行病学调查；对部分PEDV阳性病料的M基因进行克隆，并与国内部分省（市）及国外的一些M基因序列进行比对和遗传进化分析。【结果】广西11个城市采集的232份病料中PEDV、PoRV的阳性率分别为37.50%和0.03%，而TGEV均为阴性。对部分PEDV阳性病料进行M基因扩增，获得14条M基因，其核苷酸同源性及推导氨基酸序列同源性分别为97.4%~100.0%和96.0%~100.0%。将扩增获得的14条PEDV M基因与GenBank上发表的40条国内外PEDV M基因进行比对分析，发现有13条同位于一大支上（G1），其中9条与我国2011年分离获得的广东、四川、江苏参考株及泰国2008年分离获得的5条参考株、韩国2007年分离获得的两条参考株同位于G1-1上，4条与我国2011年分离获得的江西、江苏、广东、福建毒株及江苏2004年分离株JS-2004-2 同位于G1-2上。另外一条PEDV M基因（NNA-11）却与其余13条相距较远，位于G2上。【结论】从2011年至今致使广西仔猪腹泻的病毒主要是PEDV，各市均有不同程度感染，且感染全年存在；大部分广西流行毒株与2011年以来我国广东、福建、江苏、江西四省流行毒株的亲缘性较高，与2007年以来泰国、韩国的流行毒株亲缘关系也非常密切，但与我国2006年前分离获得的北方毒株、经典疫苗株、韩国疫苗株相距较远。
- 郭旋陈静刘欢侯韶毅龙凤李莹莹曾娟兰家暖刘芳黄伟坚
- 关键词：仔猪腹泻病猪流行性腹泻病毒猪传染性胃肠炎病毒猪轮状病毒M基因
- 猪星状病毒ORF2基因的克隆及序列分析被引量：5
- 2012年
- 参考GenBank上发表的猪星状病毒亚基因组序列,设计1对引物,对猪星状病毒广西流行株衣壳蛋白ORF2基因进行扩增,最终克隆得到PAstV/NNJG7株的衣壳蛋白完整序列。序列分析发现,其ORF2全长2 358bp,编码786个氨基酸;与猪星状病毒Ⅰ型参考株核苷酸同源性最高,为77.3%～79.4%;在ORF1b和ORF2连接处有一段高度保守的序列,在ORF2 3′端有一段长83bp非翻译序列及一个含43bp高度保守的茎环样基序。本试验不仅丰富了猪星状病毒衣壳蛋白基因序列,也为基因疫苗和诊断试剂盒的研制提供材料及理论依据。
- 兰家暖刘磊郭旋刘欢卢冰霞张民秀廖承球黄伟坚
- 关键词：ORF2基因基因克隆
- 广西猪瘟病毒E2基因克隆及序列分析被引量：5
- 2012年
- 【目的】了解广西猪瘟病毒(CSFV)流行毒株的变异规律及其与疫苗株的基因差异,为正确选择猪瘟疫苗和防制广西猪瘟提供参考依据。【方法】以广西本地的阳性猪瘟病料为研究对象,应用RT-PCR扩增CSFV的E2基因,经克隆、测序后用DNASTAR软件对其序列进行比对分析,并绘制遗传进化树。【结果】从41份疑似猪瘟病料中共扩增出4个阳性样品的E2基因(1140bp),经序列比对分析发现,扩增获得的4株CSFV毒株(GXGG1、GXLC1、GXLC2和GXNN1)与兔化弱毒株(HCLV)、Shimen强毒株的核苷酸同源性为82.1%～82.3%和82.9%～83.4%、其推导氨基酸同源性为88.4%～89.2%和88.9%～90.0%,4株毒株间的E2基因核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为90.8%～99.6%和94.2%～99.5%,且均属于基因群Ⅱ;E2基因推导的氨基酸表明,E2蛋白空间结构及抗原结构的氨基酸位点693Cys、737Cys、792Cys、818Cys、828Cys、856Cys、833Pro、834Thr、837Arg均未发生变异,但其单抗识别位点G713E、N729D、K734R发生变异。【结论】近年来广西CSFV流行毒株的变异未出现较大差异,与HCLV株、Shimen强毒株亲缘关系较远,但与Paderborn株、GXWZ02株亲缘关系较近。
- 陆增荣张民秀肖雄王艺刘芳刘欢卢冰霞刘磊郭旋黎木兰黄福标黄伟坚
- 关键词：猪瘟病毒E2基因同源性
