上海市自然科学基金(06ZR14010)
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 相关作者：张云智卢洪洲周晓方陈珊珊程训佳更多>>
- 相关机构：复旦大学复旦大学上海医学院复旦大学附属公共卫生临床中心更多>>
- 发文基金：上海市自然科学基金国家自然科学基金上海市卫生局科研基金更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 人类免疫缺陷病毒-1 Vif蛋白的表达及生物学功能被引量：1
- 2008年
- 目的分析上海HIV-1分离株病毒感染因子（Vif）蛋白编码基因突变特点，构建HIV-1 vif基因原核表达质粒，并了解其免疫原性。方法采用RTPCR法扩增23例上海HIV-1分离株vif基因并测序，与HIV-1国际标准毒株比较；将vif编码基因克隆人原核表达载体pET32b（＋），构建pET32b（＋）-HIv-1／Vif重组质粒；将该质粒转化人细胞BL21D3（Star）表达，并纯化HIV-1 Vif蛋白，制备Vif蛋白鼠多克隆抗体，并以ELISA检测Vif蛋白及其鼠多克隆抗体的免疫原性。统计学处理采用t检验。结果上海HIV-1分离株vif基因与国际标准毒株相比较，核苷酸突变率为（0.179±0.006）％，并具有多处相似的变异位点，上海HIV-1分离株Vif蛋白第151-240位氨基酸相对保守；成功构建HIV-1 vif基因原核表达质粒pET32b（＋）-HIV-1／Vif，表达并纯化Vif蛋白，制备了Vif多克隆抗体；重组HIV-1 Vif蛋白与HIV感染者及健康人血清反应比较，差异无统计学意义（P〉0.05）；鼠多克隆抗体与重组Vif蛋白反应与健康对照组血清比较差异有统计学意义（t=178．61，P〈0．01）。结论上海HIV-1分离株vif基因与HIV-1国际标准毒株比较存在较高突变，成功地构建了HIV-1 vif基因原核表达载体pET32b（＋）-HIV-1／Vif，制备了Vif多克隆抗体。
- 张云智靳虹卢洪洲程训佳潘孝彰
- 关键词：HIV-1基因产物VIF多克隆抗体
- 一种考虑集中约束的平面布图规划算法被引量：1
- 2010年
- 在超大规模集成电路(VLSI)物理设计中,将更多约束实现放在更高的设计阶段考虑可以有效的加速设计收敛,减少设计时间.文中针对宏模块平面布图规划中约束的实现方法进行了分析和研究,基于B*-tree表示方法提出一种考虑集中约束(clustering constraints)的平面布图规划算法,针对布图规划中集中约束的实现取得了较好效果.
- 王琳凯赵长虹陈珊珊周晓方
- 关键词：布图规划
- 艾滋病患者APOBEC3G基因的克隆和真核表达
- 2008年
- 目的建立艾滋病(AIDS)患者载脂蛋白BmRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G(APOBEC3G)的真核表达体系。方法采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术从AIDS患者外周血单个核细胞(PBMC)中获取APOBEC3G基因编码区,将其克隆到pMD18-T载体上,测序验证正确后再将其转接入真核表达载体pEGFP-N1中,然后将重组质粒pEGFP-N1-A3G转染HEK293T细胞,分别用RT-PCR法和蛋白印迹法(Western印迹法)验证APOBEC3G在mRNA和蛋白水平的表达。结果从AIDS患者体内克隆的APOBEC3G基因编码区长度为1154bp,测序结果与GenBank中APOBEC3G参考序列(NM021822)比对发现存在2处差异,分别位于mRNA第588位和746位碱基处。重组质粒pEGFP-N1-A3G转染HEK293T细胞,在荧光显微镜下观察到融合蛋白A3G-EGFP的表达,RT-PCR法和Westernblot法分别验证了蛋白在mRNA和蛋白水平的表达。结论成功构建了AIDS患者APOBEC3G蛋白的真核表达体系,为进一步研究APOBEC3G在HIV-1感染中的作用奠定了基础。
- 王珍燕江雪艳张云智卢洪洲
- 关键词：APOBEC3G真核表达艾滋病
