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基于药效团的三维数据库搜索被引量：3: 2003年; 用表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂的药效团作为提问结构在三维数据库中进行了搜索.从得到的命中结构中挑选了12个化合物用柔性受体模型方法对其活性进行了预测,发现有2个化合物具有一定的预测活性.这2个化合物可能具有酪氨酸激酶抑制剂的活性,可能作为先导化合物进行结构优化.; 彭涛周家驹; 关键词：药效团酪氨酸激酶抑制剂表皮生长因子受体药物设计生物活性

三维化学结构在Internet上的表达被引量：2: 2000年; 在开发基于 Internet的中药信息检索系统时 ,为了解决三维 (3D)化学结构在 Internet上的传输和显示问题 ,利用分子模型和描述 3D世界的虚拟现实模型语言等技术开发了一个可以把化学的 MOL 2或 ML 2格式文件转换为球棍型、空间充满型、线型、棍型等 4种虚拟现实模型语言格式文件的软件 .介绍了制作此软件的方法 ,并给出了一个具体的应用实例 .结果表明 ,用此软件产生的分子模型适合 3D化学结构在 Internet上的表达 .; 何敏周家驹; 关键词：INTERNET

几种改进的CoMFA方法比较研究血小板活化因子拮抗剂被引量：17: 2003年; 由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的叠合规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q^2的影响很大,因此相继提出了几种改进的CoMFA方法.为了优化CoMFA结果,应用传统的CoMFA方法和交叉验证的R^2引导的区域选择法(q^2-GRS)、全取向搜索法(AOS)、全空间搜索法(APS)以及比较分子相似性指数(CoMSIA)等四种改进的CoMFA方法,对18个pinusolide类衍生物这类新发现的血小板活化因子(PAF)拮抗剂进行了比较研究.结果表明四种改进的CoMFA方法得到的q^2值均比传统CoMFA的高.q^2-GRS方法得到的q^2值有所提高,但综合结果并不理想,AOS与APS得到的q^2较为理想,而在CoMSIA中,q^2几乎不受空间取向或空间位置的影响.同时我们引入基于样本的偏最小二乘法(SAMPLS)取代原AOS/APS程序中的传统PLS进行统计分析,明显提高了其运行速度.最后,根据q^2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型设计了几个预测活性更高的pinusolide类似物.; 聂晶董喜成潘家祜; 关键词：血小板活化因子拮抗剂药物设计

基于Web的中药化学数据库(英文)被引量：8: 2004年; 为了研究中药以及通过WWW 来交流中药的相关信息,开发了中药化学数据库和基于Web 的检索程序。本文简单介绍了中药化学数据库.说明了在开发程序中所使用的各种技术,包括ASP、VRML 和JavaScript。另外还给出了一些应用实例。; 彭涛周家驹; 关键词：WEB ASP VRML JAVASCRIPT

化学结构中互变键、交替键和芳香键的自动识别被引量：1: 2002年; 化学结构计算机处理中最常遇到的困难是互变现象、交替键和芳香键的处理 .尽管解决这些问题的方法早有报道 ,但它们都有仅考虑计算机处理的方便 ,而很少注意其化学应用的不足 .本工作在环系识别算法的基础上 ,设计了新的识别算法 ,使得识别的整体性能更好 ,形成了拥有自主知识产权的软件 .简要介绍了这些算法。; 姚建华李丰罗时玮袁身刚陈海峰李强郑崇直; 关键词：化学结构自动识别

酪氨酸激酶抑制剂的三维定量构效关系研究被引量：2: 2003年; 利用柔性原子受体模型(FLARM)方法对一系列的异黄酮和喹诺酮衍生物表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂进行了三维定量构效关系研究,得到了合理的构效关系模型.FLARM方法的计算结果还给出了虚拟的受体模型,该模型说明了抑制剂与受体之间可能的相互作用.由该虚拟受体模型得到的受体-配体相互作用与Novartis药效团模型比较类似.; 彭涛裴剑锋周家驹; 关键词：三维定量构效关系

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国家重点基础研究发展计划(G1998051115)