国家自然科学基金(30700776)
- 作品数:3 被引量:6H指数:1
- 相关作者:王娟胡大一李新明徐文俊忻元峰更多>>
- 相关机构:同济大学附属东方医院同济大学同济大学附属同济医院更多>>
- 发文基金:上海市青年科技启明星计划国家自然科学基金上海市卫生局青年科研基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 先天性房间隔缺损相关GATA4基因新突变的筛查被引量:1
- 2010年
- 目的 筛查先天性房间隔缺损相关GATA4基因的新突变.方法 收集85例先天性房间隔缺损患者和200名健康者的临床资料及外周静脉血标本.应用聚合酶链反应扩增GATA4基因的全部外显子,采用双脱氧核苷链末端合成终止法对全部扩增片段进行测序.以BLAST程序将所测序列与GenBank中的已知序列进行比对,以识别基因突变.采用Clustal W软件分析突变氨基酸的保守性.结果 在其中3例先天性房间隔缺损患者的GATA4基因各识别出1个新的杂合错义突变,即第267、354和407位的密码子分别由GTG、ACC和CCA变为ATG、GCC和CAA,亦即c.799G〉A、c.1060A〉G和c.1220C〉A突变,相应地导致第267、354和407位的氨基酸分别由缬氨酸、苏氨酸和脯氨酸变为蛋氨酸、丙氨酸和谷氨酰胺,也称为p.V267M、p.T354A和p.P407Q突变.200名健康对照者均无上述突变.多物种GATA4序列比对显示,第267位的缬氨酸和第407位的脯氨酸在进化上完全保守.结论 在先天性房间隔缺损患者的GATA4基因识别出3个新的杂合错义突变,揭示了先天性房间隔缺损新的分子病因,有助于先天性房间隔缺损的早期防治.
- 王娟李新明忻元峰王丽洁徐文俊胡大一
- 关键词:心脏缺损先天性突变转录因子
- 先天性心脏病患者GATA4基因新突变的识别被引量:4
- 2010年
- 目的识别先天性心脏病(CHD)患者新的分子病因。方法收集120例特发性CHD患者的临床资料和血标本,以100名健康者为对照。应用聚合酶链反应扩增GATA4基因的全部外显子,采用双脱氧核苷链末端合成终止法对全部扩增片段进行测序。借助BLAST程序将所测序列与GenBank中的已知序列进行比对以识别基因突变,并用Clustal W软件分析突变氨基酸的保守性。结果3例CHD患者的GATA4基因各识别出1个新的杂合错义突变,即第90、95和329位的密码子分别由AGC、GAC和AAG变为AGA、GAG和AAT,导致第90、95和329位的氨基酸分别由丝氨酸、天冬氨酸和赖氨酸变为精氨酸、谷氨酸和天冬酰胺,即S90R、D95E和K329N突变。这些突变在正常对照者中均不存在,多物种GATA4序列比对显示第329位的赖氨酸在进化上高度保守。此外,还发现了1个不改变氨基酸的单核甘酸多态,即c.99G〉T多态,但这些多态在CHD患者和健康对照者间的频率分布差异无统计学意义(P〉0.05)。结论特发性CHD具有显著的遗传异质性,GATA4基因突变可能是部分特发性CHD患者的分子病因。
- 王娟胡大一李新明忻元峰周华王丽洁王乐民徐文俊
- 关键词:心脏缺损先天性基因转录因子
- 2个汉族肥厚型心肌病家系致病基因与TCAP基因的关系研究被引量:1
- 2008年
- 目的:确定候选基因TCAP与两个汉族家系家族性肥厚型心肌病(HCM)之间的连锁关系。方法:在排除13个已知家族性HCM致病基因与这两个汉族家系家族性HCM的连锁关系基础上,选择TCAP基因作为这两个汉族HCM家系的候选致病基因,在其所在的染色体区域选取4个微卫星标记(Marker)进行单倍型连锁分析。结果:D17S1814、D17S838、D17Sac091178和D17S1818这4个微卫星标记在重组率θ=0时,家系1的LOD值在-2.689754^-0.645666范围内,家系2的LOD值在-1.396476~0.416726之间;在重组率θ=0.1时,两个家系中最大的LOD值仅为0.272605。结论:TCAP基因与这两个汉族家系的HCM无连锁关系,TCAP基因不是这两个家系的致病基因,提示这两个汉族家系的致病基因可能是全新的未知致病基因。
- 向娟张代富王娟周华罗裕胡铂张宇辉何晓燕陈明李新明胡大一
- 关键词:微卫星重复