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国家重点基础研究发展计划(2005CB523004)

作品数:2 被引量:2H指数:1
相关作者:王升跃雷富民寇铮李天宪周艳红更多>>
相关机构:华中科技大学中国科学院更多>>
发文基金:国家教育部博士点基金国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇农业科学

主题

  • 2篇禽流感
  • 2篇禽流感病
  • 2篇禽流感病毒
  • 2篇流感
  • 2篇聚类
  • 2篇H5N1
  • 2篇病毒
  • 1篇小波
  • 1篇小波包
  • 1篇小波包分解
  • 1篇PATTER...
  • 1篇A型禽流感病...
  • 1篇MOLECU...

机构

  • 1篇华中科技大学
  • 1篇中国科学院

作者

  • 1篇周艳红
  • 1篇李天宪
  • 1篇寇铮
  • 1篇雷富民
  • 1篇王升跃

传媒

  • 1篇科学通报
  • 1篇Scienc...

年份

  • 2篇2008
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
Molecular patterns of avian influenza A viruses
2008年
Avian influenza A viruses could get across the species barrier and be fatal to humans. Highly patho-genic avian influenza H5N1 virus was an example. The mechanism of interspecies transmission is not clear as yet. In this research,the protein sequences of 237 influenza A viruses with different subtypes were transformed into pseudo-signals. The energy features were extracted by the method of wavelet packet decomposition and used for virus classification by the method of hierarchical clustering. The clustering results showed that five patterns existed in avian influenza A viruses,which associated with the phenotype of interspecies transmission,and that avian viruses with patterns C and E could across species barrier and those with patterns A,B and D might not have the abilities. The results could be used to construct an early warning system to predict the transmissibility of avian influenza A viruses to humans.
KOU ZhengLEI FuMinWANG ShengYueZHOU YanHongLI TianXian
关键词:禽流感病毒H5N1聚类
A型禽流感病毒的分子模式被引量:2
2008年
A型禽流感病毒能跨越宿主屏障,引起人死亡.高致病性禽流感H5N1亚型病毒就是一个特例.跨宿主传播的分子机理目前仍不清楚.将不同亚型的237株流感病毒的内部蛋白序列转化为伪信号,采用小波包分解的方法提取能量特征.依据每株病毒的能量特征值,进行层次聚类.聚类结果显示,5种分子模式存在A型禽流感病毒中,并与跨宿主传播的表型相关联.分析结果同时显示,模式为C和E的病毒可以跨越宿主屏障,而模式为A,B和D的病毒缺乏此种能力.结果表明,可以用来构建一个早期预警系统,用来预测A型禽流感跨越宿主传播的可能性.
寇铮雷富民王升跃周艳红李天宪
关键词:H5N1小波包分解聚类
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