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北京市自然科学基金(5032009)

作品数:10 被引量:58H指数:4
相关作者:赵茂林徐粤宇赵宝存葛荣朝周玉雷更多>>
相关机构:北京市农林科学院农业生物技术研究中心首都师范大学河北师范大学更多>>
发文基金:北京市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 8篇生物学
  • 4篇农业科学

主题

  • 8篇赖草
  • 8篇多枝赖草
  • 3篇染色体
  • 2篇荧光
  • 2篇荧光原位杂交
  • 2篇原位
  • 2篇原位杂交
  • 2篇基因组文库
  • 2篇TAC
  • 2篇M
  • 2篇LEYMUS
  • 1篇电子克隆
  • 1篇序列标签
  • 1篇羊茅
  • 1篇异附加系
  • 1篇诱变
  • 1篇愈伤
  • 1篇愈伤组织
  • 1篇杂交
  • 1篇双色荧光原位...

机构

  • 7篇北京市农林科...
  • 5篇首都师范大学
  • 3篇河北师范大学
  • 2篇湖南工程学院
  • 2篇甘肃农业大学
  • 2篇北京市土肥工...
  • 1篇南京农业大学
  • 1篇河南科技学院
  • 1篇仲恺农业技术...
  • 1篇北京农业生物...
  • 1篇北京农林科学...

作者

  • 9篇赵茂林
  • 4篇徐粤宇
  • 3篇周玉雷
  • 3篇葛荣朝
  • 3篇赵宝存
  • 3篇张艳
  • 2篇王志平
  • 2篇孙淼
  • 1篇张敬原
  • 1篇郭光艳
  • 1篇曹致中
  • 1篇秘彩莉
  • 1篇黄占景
  • 1篇沈银柱
  • 1篇史仁玖
  • 1篇宋琳琳
  • 1篇杨清
  • 1篇王克武

传媒

  • 2篇华北农学报
  • 1篇中国科学(C...
  • 1篇中国草地
  • 1篇河北师范大学...
  • 1篇生物技术通报
  • 1篇中国农业科学
  • 1篇西北植物学报
  • 1篇草业科学
  • 1篇Scienc...

年份

  • 1篇2010
  • 3篇2008
  • 3篇2007
  • 1篇2006
  • 2篇2005
10 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
多枝赖草基因组可转化人工染色体(TAC)文库的构建和鉴定被引量:6
2008年
为了克隆和转化多枝赖草(Leymus multicaulis)的耐黄矮病、耐蚜虫、耐干旱、耐盐碱等抗逆性基因,利用脉冲电泳分离纯化2Mb以上核DNA,酶切后回收10~200kb DNA片段按大小分5组与TAC载体连接后电转化导入细菌DH10B,在卡那霉素和蔗糖选择压下均有阳性克隆.用两种TAC载体pYLTAC17和pYLTAC747H/sacB分别构建了文库Ⅰ和Ⅱ,约16.5和23.6万个克隆,估计覆盖3~5倍多枝赖草基因组大小.文库以混合克隆形式保存在12×2块深孔96孔板中,每孔1.2mL菌液中含300~600个克隆,40多万个克隆转存到3块384孔板,留24个孔存叶绿体和线粒体DNA探针菌液,可用于后续文库鉴定.此外,从文库Ⅰ和Ⅱ分别挑取2501和2890个单克隆存于14块384孔板中.17块384孔板都用GeneTACTMG3复制了2份,点高密度杂交膜6张,以多枝赖草谷胱甘肽还原酶基因5′RACE-GR和3'RACE-GR为探针初步筛选到19个阳性克隆.两文库为多枝赖草抗性基因的克隆、物理图谱的构建、功能验证等基因组有关研究奠定了基础。
徐粤宇周玉雷宋琳琳张艳赵茂林
关键词:基因组文库
多枝赖草、高羊茅的组织培养和愈伤组织诱变被引量:4
2007年
以多枝赖草、高羊茅的种子为材料,在诱导培养基上进行暗培养,产生愈伤组织.愈伤组织经多次继代培养后仍可保持分化潜力.在分化培养基上进行光照培养后,可以分化出丛生状幼苗,并大量生根,形成再生植株.用EMS溶液对2种愈伤组织进行诱变处理,结果表明:不同体积分数的EMS对愈伤组织的致死率不同,随着体积分数的提高,致死率逐步升高.经统计,初步确定EMS溶液对多枝赖草、高羊茅愈伤组织的半致死体积分数分别为6 mL/L和8 mL/L.
葛荣朝赵宝存秘彩莉郭光艳赵茂林
关键词:多枝赖草高羊茅愈伤组织EMS诱变
多枝赖草高分子量核DNA的有效制备被引量:4
2007年
以多枝赖草Leymus multicaulis黄化苗幼嫩叶片为材料,在液氮中研磨成粉末,加入冰冷的细胞核抽提缓冲液,经一系列钢制细胞筛过滤,离心分离细胞核,相差显微镜镜检后,用低熔点琼脂糖包埋,蛋白酶K原位裂解,经脉冲场电泳分离,用1%低熔点琼脂糖回收获得了较纯净的分子量大于2 Mb的核DNA,Southern杂交显示没有叶绿体和线粒体DNA的污染。利用该方法制备的高分子量核DNA,可用于后续可转化人工染色体(TAC)文库的构建和基因组分析。
周玉雷徐粤宇赵茂林曹致中王志平
关键词:多枝赖草脉冲场电泳
一个耐盐小麦-多枝赖草二体异附加系外源染色体的鉴定被引量:20
2006年
目的对附加系Line15进行耐盐性验证,并了解其外源多枝赖草染色体的遗传背景。方法利用含0.4%(w/w)NaCl的人工模拟盐池进行耐盐性鉴定,并对Line15根尖细胞、花粉母细胞的染色体数目进行检测,进而利用荧光原位杂交和微卫星标记技术对其遗传物质进行进一步鉴定。结果小麦-多枝赖草杂交后代Line15为一个具有较高耐盐特性的材料,其染色体组成为2n=44=22II,属于一个小麦-多枝赖草二体异附加系。根据SSR检测结果表明,Line15附加的一对多枝赖草染色体与小麦的第2部分同源群长臂、第3部分同源群着丝粒和第7部分同源群短臂密切相关。结论对小麦-多枝赖草二体异附加系Line15进行了生理、细胞和分子水平的系统检测,较全面地揭示了Line15耐盐性的具体来源。
葛荣朝张敬原赵宝存黄占景沈银柱赵茂林
关键词:小麦多枝赖草二体异附加系荧光原位杂交微卫星标记
多枝赖草的组织培养
2005年
以多枝赖草种子为材料,在MS+3mg/L2,4-D+0.5mg/L激动素+3%蔗糖+0.5%琼脂培养基上暗培养,产生愈伤组织。愈伤组织经多次继代培养后仍可保持分化潜力。在1/2MS+0.5mg/L6-BA+0.5mg/LIBA+3%蔗糖+0.5%琼脂培养基上光照培养后分化出丛生状绿芽,并大量生根,形成再生植株。
葛荣朝胡得全张前林赵宝存赵茂林
关键词:多枝赖草种胚
Construction and characterization of the transformation-competent artificial chromosome (TAC) libraries of Leymus multicaulis被引量:1
2008年
Transformation-competent artificial chromosome system is able to clone and transfer genes efficiently in plants.In order to clone genes highly tolerant to barley yellow dwarf virus(BYDV),Aphids,drought and salt from Leymus multicaulis,the two TAC genomic libraries I and II were constructed in vector pYLTAC17 and pYLTAC747H/sacB,which contain about 165000 and 236000 recombinant clones sepa-rately.The genome coverage of the two libraries was totally estimated to be about 3―5 haploid genome equivalents,as size selection of genomic DNA fragments was approximately from 9 to 300 kb.Clones of the genomic libraries were collected as bulked pools each containing 500 clones or so,stored in twelve 96-deep-well plates and then were gridding in triplicate onto a high-density colony hybridization filter with a 3×3 pattern using a GeneTAC?G3 arraying robot after being transferred manually into three 384-well plates.Meanwhile 2501 and 2890 clones of Library in pYLTAC17 and in pYLTAC747H/sacB were stored individually in fourteen 384-well plates and then were automatically gridding in duplicate onto a high-density colony hybridization filter with a 6×6 pattern after a replication of plates.Nineteen positive clones were detected by using the probe glutahione reductase gene of L.multicaulis.TAC libraries constructed here can be used to isolate genomic clones containing target genes,and to carry out genome walking for positional cloning.Once the target TAC clones were isolated,they could be immediately transferred into plant genomes with the Agrobacterium system.
XU YueYu 1,2,3,ZHOU YuLei 4,5 ,SONG LinLin 6 ,ZHANG Yan 3 &ZHAO MaoLin 1 1 Beijing Agro-Biotechnology Research Center,Beijing Academy of Agriculture and Forestry Science,Beijing 100097,China
关键词:LEYMUS
多枝赖草谷胱甘肽还原酶cDNA片段的克隆与分析被引量:1
2005年
从盐胁迫处理的多枝赖草(Leymusmulticaulis)新鲜叶片中提取分离出RNA,然后根据报道的多种植物谷胱甘肽还原酶氨基酸序列上两个保守区设计简并引物。RT-PCR获得了1条大小约400bp的条带,回收该条带并进行TA克隆,蓝白斑筛选,得到阳性克隆。经过质粒大小比较和PCR验证,进行序列测定和分析,发现该序列属于GR基因片段,其Genbank注册号为AY781786,编码的氨基酸序列与Oryzasativa、Zeamays、Arabidopsisthaliana和Nicotianatabacum的GR相应区段的氨基酸序列一致性分别为91%、89%、86%和83%。蛋白质序列分析发现该序列含有一个吡啶二硫酸核苷酸氧化还原酶(pyridinenucleotide-disulphideoxidoreductase)保守结构域。进化树分析表明,该多枝赖草cDNA片段编码的氨基酸序列在进化上与水稻和玉米较近。
史仁玖赵茂林杨清
关键词:多枝赖草谷胱甘肽还原酶
多枝赖草基因组Mb级DNA制备和酶切方法的优化被引量:4
2007年
Mb级DNA的制备和酶切是构建YAC,PAC,BAC,BIBAC和TAC文库与大尺度物理图谱的基础。以浓度0.4%(m/m)NaCl人工模拟盐池中生长的多枝赖草再生叶为材料提取细胞核,经钢丝细胞筛过滤,多次回收滤渣和离心上清中的细胞核,相差显微镜调浓度达108个/mL后,经LMP包埋,蛋白酶K降解核蛋白,脉冲电泳纯化回收后,在LMP胶块中2 Mb以上DNA的浓度约为250 ng/μL。在胶中经Hind III部分酶切再用脉冲电泳回收不同大小范围的DNA,电洗脱浓缩除盐后浓度约为25 ng/μL。用此方法得到的核DNA不但无细胞器DNA等的污染,而且浓度高,可直接用于各种人工染色体文库的构建。
徐粤宇周玉雷赵茂林王志平王克武张艳
关键词:多枝赖草基因组文库酶切
载有抗逆性基因的多枝赖草染色体连锁群的特定TAC克隆的鉴定被引量:1
2008年
分别以耐黄矮病耐蚜虫小赖麦附加系Line24、耐盐耐旱小赖麦附加系Line15、耐盐小赖麦易位附加系Line14为材料,以它们各自所附加的含有相应抗逆基因的多枝赖草染色体(简称为抗逆染色体)的6个特定SSR分子标记为探针,通过两轮菌落杂交法筛选多枝赖草基因组可转化人工染色体(TAC)文库,最终得到经过验证的阳性克隆77个,它们分别对应于3个(易位)附加系中所附加抗逆染色体(臂)连锁群的6个特定SSR标记,每一标记所对应的TAC克隆数目变化在5-19个,平均约13个。进一步从来自Line24的抗逆染色体连锁群的同一个探针筛选到的阳性克隆中抽查2个TAC克隆15J18和09I02,通过双色荧光原位杂交技术(Double-color FISH)进行初步定位,直观地证明了文库筛选结果的准确性。为各条抗逆染色体的识别鉴定和相关抗逆基因的精细定位奠定了基础。
张艳赵茂林孙淼徐粤宇
关键词:多枝赖草抗逆性双色荧光原位杂交
利用表达序列标签电子克隆cDNA全序列的策略被引量:19
2010年
基因组计划的进展及表达序列标签数据的迅速扩增使得电子克隆方法孕育而生,为进行基因克隆开辟了一条新的路径。介绍了表达序列标签和电子克隆的原理及过程,重点分析电子克隆过程中遇到的问题及解决方法,展望其在新基因功能研究中的作用。
孙淼赵茂林
关键词:表达序列标签电子克隆聚类
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