国家重点基础研究发展计划(2010CB530201)
- 作品数：8 被引量：64H指数：5
- 相关作者：崔步云左双燕唐琨田国忠姜海更多>>
- 相关机构：中南大学苏州大学内蒙古农业大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家科技重大专项国家杰出青年科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 黑龙江省旅游区蜱伯氏疏螺旋体和斑点热群立克次体复合感染的动态调查被引量：4
- 2012年
- 目的了解黑龙江省旅游区蜱伯氏疏螺旋体和斑点热群立克次体复合感染的动态变化。方法运用PCR方法检测2010年捕获蜱中两种病原感染状况并测序进行序列分析。结果在威虎山和镜泊湖景区采集点捕获蜱标本共849只。两地优势蜱种分别为全沟硬蜱和嗜群血蜱，其中伯氏疏螺旋体和斑点热群立克次体感染率分别为26．15％、10．05％和0．00％、13．33％，提示全沟硬蜱复合感染。两地优势蜱种活动高峰分别出现在7月和6月上旬，蜱携带病原率因时间差异而不同。序列分析显示旅游区伯氏疏螺旋体有3种基因型，除B．garinii型、B．afzelii型外，首次在东北地区发现B．valaisiana-likegroup型。对斑点热群立克次体序列分析表明，所得两序列分别与Rickettsiasp．HL-93和Rickettsiasp．H820，其同源性为100％。结论两旅游区蜱中存在伯氏疏螺旋体和斑点热群立克次体复合感染，且携带的基因类型存在多样性；动态调查显示蜱种、蜱密度的分布以及蜱携带病原状况因生境、时间和人群的不同而有差异。
- 唐琨左双燕李颖郑元春霍秋波于季红张圆倪雪冰姚囡囡谭红专
- 关键词：伯氏疏螺旋体斑点热群立克次体
- 16SrDNA序列分析在鉴定布鲁氏菌中的应用被引量：12
- 2013年
- 【目的】建立布鲁氏菌的16S rDNA序列分析方法,评价该方法鉴定布鲁氏菌的特异性和实用性。【方法】用PCR扩增布鲁氏菌的16S rDNA片段,将扩增的产物纯化后测序,从GenBank下载与布鲁氏菌易发生血清学交叉反应的细菌的16S rDNA序列。使用DNAMAN软件进16S rDNA序列相似性分析。【结果】在布鲁氏菌中16S rDNA核苷酸序列相似性达到了99.74%,而与其他有血清型交叉反应的菌株相比较,16S rDNA序列间有显著差异。【结论】16S rDNA序列分析是一种快速、简便、特异的鉴定布鲁氏菌的方法之一。
- 汤旭姜海赵鸿雁朴冬日田国忠张秋香崔步云王桂琴
- 关键词：布鲁氏菌RDNA
- 2010-2011无年形我体国的东感北染林情区况蜱调中查嗜吞噬细胞被引量：7
- 2012年
- 目的调查我国东北林区蜱标本中嗜吞噬细胞无形体的感染情况。方法2010-2011年在东北林区采集蜱标本,用聚合酶链反应方法扩增gltA基因片段,分析东北林区蜱中无形体的感染情况,代表阳性片段联用长片段16S rRNA进行扩增测序确认;并将所得序列与GenBank中已注册的序列进行比对分析。结果共检测蜱2293只,其中2010年1161只,阳性率4.91%,2011年1132只,阳性率4.24%,2年的感染率差异无统计学意义(χ2=0.373,P=0.830;χ2=1.789,P=0.409)。全沟硬蜱阳性率4.86%(91/1872),长角血蜱为3.41%(14/411),森林革蜱为0(0/10),3个蜱种的感染率差异无统计学意义(P>0.05)。测得的gltA序列中,NE-gltA-1与Hc346株(GenBank:GU935788)最相似,仅差2 bp,相似性99%;NE-gltA-2与MDJ-Ip92株(HQ396224)序列一致,相似性100%。与2个序列相似性最远的是ZJ-HGA-72株(DQ458811),相差53 bp,相似性84%。测得的16S rRNA序列与我国从东北鼠源分离株China-C-T(tGQ412339)最接近,相似性为99%,与Florida株(AF309867)相似性最远,相似性97%。结论我国东北林区蜱中普遍存在嗜吞噬细胞无形体的感染,全沟硬蜱和长角血蜱可能为无形体的媒介宿主。
- 李颖左双燕唐琨浦冠勤
- 关键词：16SRRNA基因
- 黑龙江林区野鼠伯氏疏螺旋体核酸检测与序列分析
- 2012年
- 伯氏疏螺旋体共有13个基因种，国内分离到的菌株包括5个基因种，本研究对黑龙江地区啮齿动物中伯氏疏螺旋体进行分子流行病学调查和分析。
- 左双燕唐琨李颖于季红张圆倪雪冰郑元春霍秋波宋玉东曾小敏
- 关键词：伯氏疏螺旋体
- 多重荧光定量PCR方法鉴定布鲁氏菌属及牛羊种布鲁氏菌研究被引量：28
- 2012年
- 目的利用多重实时荧光PCR技术,建立快速鉴定布鲁氏菌的方法。方法根据布鲁氏菌特异性基因BCSP31,AlkB/IS711和BMEI1162/IS711的部分片段作为靶基因,分别设计探针引物,将扩增产物连接到PUCm18-T载体上,制备标准品及标准曲线,确定此方法的灵敏度。利用布鲁氏菌的其他生物型菌株和同源性较近的致病菌(汉赛巴尔通体、霍乱弧菌、土拉弗朗西斯菌、大肠杆菌O157∶H7、大肠杆菌O∶16、小肠结肠炎耶尔森菌O∶9、沙门氏菌N群血清型、嗜麦芽假单胞菌)验证所建立方法的特异性。通过布鲁氏菌标准菌株建立方法,优化体系后扩增97株地方株进行验证。结果应用多重Taq-Man荧光PCR技术检测布鲁氏菌结果显示,布鲁氏菌属、牛种布鲁氏菌和羊种布鲁氏菌有各自的荧光信号,而与其同源性较高的致病菌均未见荧光信号;由标准曲线可知该方法的单重和多重荧光PCR最低检测下限均约为102copy/μL(13～24fg/μL),是常规PCR灵敏度的100倍。结论建立的方法有灵敏度高、快速易操作等优点,可用于布鲁氏菌快速鉴定,并同时确定是否为牛种或羊种布鲁氏菌。
- 刘志国刘志国罗成旺张利姜海赵鸿雁朴东日田国忠
- 关键词：布鲁氏菌荧光定量聚合酶链式反应
- 布鲁氏菌疫苗株与标准株的比较被引量：2
- 2014年
- 布鲁氏菌鉴定需要标准株作为对照，标准株具有高致病性。本研究对牛、羊、猪种生物Ⅰ型的标准株（544A、16M、1330S）与疫苗株（S19、M5、S2）进行比较，探索疫苗株作为对照菌株用于鉴定的可能性。
- 王娜肖培田国忠姜海朴东日赵鸿雁孙岩赵娜呼和巴特尔崔步云
- 关键词：布鲁氏菌标准株疫苗株
- 贝叶斯判别分析在布氏杆菌常见种别鉴定中的应用被引量：6
- 2013年
- 目的建立布氏杆菌常见种别的Bayes判别模型,为布氏杆菌种别的鉴定提供依据。方法以多位点可变数目串联重复序列分析方法所选择的基因组上16个具有多态性串联重复序列位点为判别指标,应用逐步判别分析方法筛选关键序列位点并构建布氏杆菌常见种别的Bayes判别模型。结果待选的16个多态性串联重复序列位点全部进入判别函数,建立的模型自身验证的准确率为98.21%,交互验证的准确率为97.75%。结论建立的Bayes判别模型判断布氏杆菌的常见种别正确率很高,是布氏杆菌常见种别判断的有效方法。
- 肖培崔步云
- 关键词：布氏杆菌
- 黑龙江林区野鼠中斑点热群立克次体的核酸检测与序列分析被引量：7
- 2013年
- 目的：了解黑龙江林区野鼠中斑点热群立克次体的感染情况。方法：运用聚合酶链反应方法对黑龙江地区采集的啮齿动物标本扩增斑点热群立克次体外膜蛋白A（OmpA）基因。阳性标本送测序并应用Mega5．0软件进行序列分析。结果：共检测鼠标本514份，斑点热群立克次体的阳性率为9．3％（95％CI：7．1％～12．2％），牡丹江、绥芬河、同江和东宁四个地区斑点热群立克次体的阳性率分别为12．4％（39／314），5．3％（3／57），2．0％（1／51），5．4％（5／92），地区间阳性率差异有统计学意义（P=O．023）。感染斑点热群立克次体的有仓鼠、大仓鼠、大林姬鼠、褐家鼠、黑线姬鼠、红背鼠平、鼠句黯、棕背鼠平、东方田鼠、明纹花松鼠10种，鼠种间阳性率差异有统计学意义（P=O．002）；棕背肝的阳性率最高，为22．1％（21／95）。测序结果显示鼠感染的斑点热群立克次体基因型是黑龙江立克次体基因型和一种新的未定种基因型。结论：黑龙江地区存在鼠感染黑龙江立克次体，同时可能存在未定种的新的斑点热群立克次体。
- 左双燕唐琨郑元春霍秋波宋玉东曾小敏
- 关键词：斑点热群立克次体
