中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2010007)
- 作品数:1 被引量:7H指数:1
- 相关作者:董纯明陈亮邵宗泽廖悦婷更多>>
- 相关机构:国家海洋局第三海洋研究所厦门大学更多>>
- 发文基金:海洋公益性行业科研专项中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域:环境科学与工程更多>>
- 一株深海热液环境来源的PAHs降解菌TVG9-Ⅶ的系统发育与降解基因被引量:7
- 2011年
- 【目的】对一株深海热液环境来源的多环芳烃(PAHs)降解菌进行系统发育分析并对其降解特性和降解机制进行研究。【方法】对16S rRNA基因进行扩增和测序,进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析;利用GC-MS测定其对PAHs的降解率;通过构建基因组Fosmid文库,克隆PAHs降解基因簇;并利用RT-PCR和qPCR研究关键降解酶基因在不同PAHs诱导下的表达情况。【结果】从西南太平洋劳盆地热液沉积物中分离到一株PAHs降解菌株TVG9-Ⅶ,系统发育分析结果表明,该菌株属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium),与该属的Novosphingobium indicum H25T系统发育关系最为密切,它们的16S rRNA基因序列相似性高达99.7%。该菌株在21 d内对菲、荧蒽和芘的降解率分别为95.2%,57.3%和69.6%。从Fosmid文库中筛选得到一个负责PAHs降解的上游基因簇,包含了PAHs起始降解双加氧酶大小亚基(pheA1a/b)基因和一个脱氢酶基因;RT-PCR和qPCR实验表明,双加氧酶大亚基基因pheA1a在菲的诱导下上调表达4.2倍,而在萘及高环荧蒽和芘的诱导下无上调。【结论】菌株TVG9-Ⅶ是Novosphingobium属深海热液来源的PAHs降解菌,具有良好的降解特性,特别是对高环PAHs的降解效果较好。
- 董纯明陈亮廖悦婷邵宗泽
- 关键词:深海热液区多环芳烃双加氧酶