湖南省教育厅重点项目(06A054)
- 作品数：4 被引量：21H指数：3
- 相关作者：佘朝文蒋向辉许栋张青桦赵旺更多>>
- 相关机构：怀化学院怀化市生物育种与加工技术实验室更多>>
- 发文基金：湖南省教育厅重点项目民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 杉木总RNA 3种提取方法的比较研究被引量：4
- 2009年
- 通过3种杉木总RNA提取方法的比较试验,找到了一种适用于杉木总RNA提取的新方法。用该方法提取杉木幼茎总RNA具有正常的光谱吸收,D260nm/D280nm比值为1.90～2.03,D260nm/D230nm比值为2.84～4.04,经琼脂糖电泳后,28S和18SRNA条带清晰,提取的RNA可用于RT-PCR、Northern杂交、cDNA文库的构建,同时该方法还适用于青蒿总RNA的提取。
- 蒋向辉佘朝文郝博飞张礼华
- 关键词：杉木总RNA
- 杉木CCoAOMT基因部分cDNA克隆与序列分析被引量：7
- 2009年
- 利用CODEHOP设计CCoAOMT基因的简并引物,通过RT-PCR的方法,从杉木茎段中克隆到1个长度为614 bp的PCR产物,产物经pMD18-T载体克隆转化至DH5α大肠杆菌中,序列通过同源性比对后显示该片段与其它植物的CCoAOMT基因具有较高的同源性.利用生物信息学方法分析发现,该序列在112－651 bp片段上有一个开放性阅读框,该序列编码的是一个酸性蛋白,亲水性较弱,疏水性较强;信号肽序列为第23位至第45位,二级结构以α-螺旋（40.62%）与不规则盘绕（45.31%）为主,没有发现β转角区域.
- 蒋向辉佘朝文许栋张青桦赵旺
- 关键词：生物技术杉木CDNA克隆
- CODEHOP在线简并引物设计与杉木4CL基因片段克隆被引量：9
- 2009年
- 利用CODEHOP设计4CL酶的简并引物,利用设计的3对简并引物进行RT—PCR,从杉木幼茎中克隆到2个长度分别为502 bp和536 bp的PCR产物,产物经pMD18—T载体克隆转化至DH5α大肠杆菌中,序列通过Blastx检索与Genbank进行同源性比对后,发现2片段都与其它植物的4—CL基因具有较高的氨基酸序列同源性。研究表明,该程序设计的简并引物可信性强,阳性率高。该基因的成功克隆将为研究杉木木质素的合成提供科学依据。
- 佘朝文蒋向辉许栋张青桦赵旺
- 关键词：CODEHOP克隆
- 杉木CAD基因生物信息学分析被引量：2
- 2009年
- 杉木CAD片段为信息探针,利用序列拼接方法获得了738bp的cDNA序列.利用MEGA4.0软件对不同进化层次的代表植物相应CAD基因进行比对,构建系统进化树.利用生物信息学方法分析了杉木CAD基因的结构与功能,其中包括核苷酸序列的组成、ORF识别、CpG岛、限制性酶切位点分析、卷曲螺旋、亲水性、糖基位点及二级结构.结果表明:杉木与铁杉的CAD基因具有99.00%的同源性;该序列在88～737bp片段上有一个开放性阅读框,该序列编码的是一个碱性蛋白,亲水性较强,疏水性较弱,信号肽序列为第1位～第11位,二级结构以α-螺旋(27.50%)与不规则盘绕(41.50%)为主,延伸链(22.50%)也是该蛋白的重要结构元件,β转角区域仅为8.50%.
- 佘朝文许栋张青桦蒋向辉
- 关键词：杉木生物信息学
