国家自然科学基金(81073001)
- 作品数：5 被引量：94H指数：4
- 相关作者：姚辉杨培侯典云辛天怡刘美子更多>>
- 相关机构：中国医学科学院北京协和医学院河南科技大学北京协和医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 山茱萸药材及其混伪品的ITS/ITS2序列鉴定研究(英文)被引量：3
- 2013年
- 利用DNA条形码技术准确快速鉴定山茱萸药材及其混伪品。方法:提取山茱萸及其混伪品的基因组DNA,利用PCR技术扩增它们的ITS序列。所得序列经双向测序后用CodonCode Aligner V3.5.4软件进行拼接和质量评估,用MEGAV5.0计算种内、种间的遗传距离,构建NJ(邻接)树鉴定山茱萸药材及其混伪品。结果:山茱萸药材的ITS序列长度均为659bp,种内变异较小,平均K2P遗传距离为0.005,远小于其与混伪品的种间平均K2P遗传距离0.357。不同来源的山茱萸药材ITS2序列无变异,长度均为250bp,其与混伪品的种间平均K2P遗传距离为0.571。ITS/ITS2序列的NJ系统聚类树和BLAST比对结果均可明显区分山茱萸药材及其混伪品,表现出良好的单系性。结论:ITS/ITS2序列可准确有效鉴定山茱萸药材,为临床安全用药奠定了基础,也为其它药材的分子鉴定提供了新的思路。
- 侯典云宋经元姚辉韩建萍庞晓慧石林春王笑尘陈士林
- 关键词：山茱萸ITSITS2DNA条形码分子鉴定
- 多基原药材秦艽ITS2条形码鉴定研究
- DNA条形码技术的快速发展将促进我国中药材的质量控制和标准化建设,是国际生物分类和鉴定研究中引人注目的新方向,但目前为止该技术相关报道多采用中药材基原植物叶片进行鉴定研究,直接应用于中药材鉴定较少,业内广泛关注的采用DN...
- 罗焜马培姚辉辛天怡胡燕郑司浩黄林芳刘军宋经元
- 关键词：ITS2物种鉴定稳定性
- 文献传递
- 基于DNA序列的石斛属药用植物鉴定研究进展被引量：4
- 2015年
- 本文从核基因组、线粒体基因组和叶绿体基因组三方面,综述了目前常用DNA序列在石斛属药用植物的分子鉴定和物种分类研究中的进展。文献显示,目前用于石斛属物种分子鉴定研究的DNA序列主要有核ITS/ITS2、LEAFY,叶绿体rbc L、mat K、trn H-psb A、rpo B、rpo C1、trn L-F、rbl16、trnl intron和线粒体基因组nad1 intron2,这些DNA序列均对石斛属药用植物鉴定具有借鉴意义。笔者对叶绿体全基因组序列作为"超级条形码"在石斛属植物中应用的可行性进行了展望,以期为石斛属药用植物的鉴定研究提供参考。
- 周红马双姣杨培姚辉
- 关键词：石斛属DNA序列分子鉴定核基因组叶绿体基因组线粒体基因组
- 基于ITS2序列的北豆根药材及其混伪品分子鉴定研究
- 为准确、快速鉴定中药材北豆根及其混伪品,保证临床用药安全,考察ITS2序列对北豆根及其混伪品鉴定能力,本研究采用试剂盒法提取药材的基因组DNA,PCR扩增其核糖体DNA的内转录间隔区(internal transcrib...
- 杨培侯典云宋经元张辉陈士林姚辉
- 关键词：北豆根ITS2DNA条形码分子鉴定混伪品
- 文献传递
- 多基原药材秦艽ITS2条形码鉴定研究
- DNA条形码技术的快速发展将促进我国中药材的质量控制和标准化建设,是国际生物分类和鉴定研究中引人注目的新方向,但目前为止该技术相关报道多采用中药材基原植物叶片进行鉴定研究,直接应用于中药材鉴定较少,业内广泛关注的采用DN...
- 罗焜马培姚辉辛天怡胡燕郑司浩黄林芳刘军宋经元
- 关键词：ITS2物种鉴定稳定性
- 文献传递
- 基于ITS2序列的北豆根药材及其混伪品分子鉴定研究
- 为准确、快速鉴定中药材北豆根及其混伪品,保证临床用药安全,考察ITS2序列对北豆根及其混伪品鉴定能力,本研究采用试剂盒法提取药材的基因组DNA,PCR扩增其核糖体DNA的内转录间隔区(internal transcrib...
- 杨培侯典云宋经元张辉陈士林姚辉
- 关键词：北豆根ITS2DNA条形码分子鉴定混伪品
- 川木通与其混伪品和近缘种的ITS2条形码分子鉴定被引量：7
- 2011年
- 目的分析川木通及其混伪品和近缘种的ITS2条形码序列,探讨川木通及其混伪品和近缘种鉴定的新方法。方法对样品进行DNA提取,PCR扩增ITS2片段并进行双向测序,Codo-nCode Aligner拼接序列,MEGA5分析川木通的种内遗传距离及与混伪品和近缘物种的种间遗传距离,预测ITS2二级结构,应用BLAST方法进行鉴定分析。结果川木通与混伪品的种间变异较大,ITS2二级结构的差异分析能够区分川木通与其主要混伪品开,用BLAST方法可将川木通与同属混伪品和近缘物种区分开。结论 ITS2条形码序列可用于区分中药川木通及其混伪品和近缘种,为中药材及其混伪品和近缘物种的分子鉴定提供依据。
- 刘美子李美妮姚辉刘萍
- 关键词：川木通分子鉴定混伪品DNA条形码
- 川木通与其混伪品和近缘种的ITS2条形码分子鉴定
- 目的分析川木通及其混伪品和近缘种的ITS2条形码序列,探讨川木通及其混伪品和近缘种鉴定的新方法。方法对样品进行DNA提取,PCR扩增ITS2片段并进行双向测序,CodonCode Aligner拼接序列,MEGA5分析川...
- 刘美子陈士林姚辉宋经元韩建萍刘萍
- 关键词：川木通分子鉴定混伪品DNA条形码
- 文献传递
- 应用ITS2条形码鉴定中药材地黄被引量：9
- 2013年
- 目的:应用ITS2条形码序列准确、快速鉴定中药材地黄及其同属密切相关种,以确保该药材的质量及临床用药安全。方法:PCR扩增产物测序后所得序列经质量分析和拼接,计算地黄及其同属物种的种内、种间K2P遗传距离,基于K2P模型构建NJ树,对地黄药材进行鉴定。结果:地黄药材ITS2序列长度为231 bp,种内变异较小,平均K2P遗传距离为0.000 4,地黄药材及其同属密切相关种的种间平均K2P遗传距离为0.031 2,种间最小K2P遗传距离大于地黄药材种内的最大K2P遗传距离。利用构建的NJ树可以明显鉴定中药材地黄。结论:ITS2作为条形码可以有效鉴定中药材地黄及其同属的密切相关种,为保障地黄药材的临床安全用药奠定了基础。
- 侯典云辛天怡杨培姚辉
- 关键词：地黄ITS2DNA条形码
- 多基原药材秦艽ITS2条形码鉴定研究被引量：75
- 2012年
- DNA条形码技术的快速发展将促进我国中药材的质量控制和标准化建设,是国际生物分类和鉴定研究中引人注目的新方向,但目前为止该技术相关报道多采用中药材基原植物叶片进行鉴定研究,直接应用于中药材鉴定较少,业内广泛关注的采用DNA条形码技术鉴定中药材过程涉及的①如何从根茎类中药材中提取DNA;②不同产地样本种内变异情况;③采用DNA条形码鉴定中药材时的稳定性和准确性等研究报道不足。在此背景下,本文选取多基原中药材秦艽作为研究对象,广泛收集其主产区不同基原和其常见混伪品及其近缘种共86个样品,改良传统DNA试剂盒提取方法,对比植物DNA条形码热点候选序列ITS(internal transcribedspacer),psbA-trnH,matK,rbcL和ITS2优劣,结果显示改良后的试剂盒法可使秦艽药材DNA全部提取成功,基于ITS2序列100%成功鉴定秦艽药材及其混伪品,同时基于本研究建立的鉴定流程成功将药店购买的秦艽药材样品鉴定到基原物种。
- 罗焜马培姚辉辛天怡胡燕郑司浩黄林芳刘军宋经元
- 关键词：ITS2物种鉴定稳定性
