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广西大学科研基金(XBZ110385)

作品数:1 被引量:5H指数:1
相关作者:焦晓真桑洪玉邱永福胡德辉李容柏更多>>
相关机构:广西民族大学广西大学更多>>
发文基金:广西大学科研基金更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇引物
  • 1篇引物筛选
  • 1篇微卫星
  • 1篇SSR
  • 1篇EST

机构

  • 1篇广西大学
  • 1篇广西民族大学

作者

  • 1篇李容柏
  • 1篇胡德辉
  • 1篇邱永福
  • 1篇桑洪玉
  • 1篇焦晓真

传媒

  • 1篇南方农业学报

年份

  • 1篇2013
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
叶蝉EST资源的微卫星信息分析被引量:5
2013年
【目的】分析叶蝉EST序列信息,为其分子标记体系建立、遗传图谱构建及相关致害基因挖掘奠定基础。【方法】利用生物信息学技术对NCBI数据库中的4种叶蝉亚种EST序列进行SSR基序分析与统计,并对筛选出的SSR基序区段进行引物设计,开发出SSR标记。【结果】11044条叶蝉EST序列的总长为5866kb。按照引物筛选设定的参数,筛选获得1946条含有SSR基序的EST序列,占总EST序列的17.6%;其中包含2230个SSR基序并全部获得相应的SSR引物,平均间距为2.63kb。在2~5个核苷酸重复中,3个核苷酸重复为优势基序,占总基序的77.3%,尤以AAT类最丰富,占3个核苷酸重复总数的40.7%;双核苷酸重复中,AG类所占的比例最大,为39.1%。【结论】从叶蝉EST序列中筛选获得2230个SSR引物,以3个核苷酸重复基序所占比重最大。
胡德辉焦晓真桑洪玉邱永福李容柏
关键词:ESTSSR引物筛选
共1页<1>
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