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新疆维吾尔自治区科技攻关项目(200415114-2)
作品数:
1
被引量:33
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袁辉
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2009
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新疆盐生植物车前PmNHX1基因的克隆及生物信息学分析
被引量:33
2009年
盐分对植物的伤害主要是Na+引起的,而Na+/H+逆向运输蛋白催化Na+/H+逆向跨膜运输,从而使质膜上Na+运出细胞和液泡膜中的Na+区隔化。这是植物尤其是盐生植物抵御盐胁迫的主要方式之一。根据不同植物编码液泡膜逆向运输蛋白基因的保守序列,设计简并引物,采用RT—PCR和RACE技术,首次从新疆盐生植物车前(Plantagomaritima)中克隆到Na+/H+逆向运输蛋白基因的cDNA全长2464bp,命名为PmNHXl(GenBank登录号:EU233808),该基因编码区长为l662bp,编码553个氨基酸,理论分子量为61.16kDa,等电点为7.22。数据分析结果显示,该蛋白质主要定位于液泡膜上,由12个序列保守的跨膜结构域组成,其中TM3跨膜结构域上存在“LFFIYLLPPI”一氨氯吡嗪咪结合域,并且该位点与Na+有竞争作用。PmNHX1逆向运输蛋白与其他植物逆向运输蛋白的氨基酸同源性为64%~80%。通过生物信息学方法对其理化性质和功能分析进行预测,这为进一步研究转耐盐基因PmNHX1及其功能鉴定奠定了基础。
张雨良
张智俊
杨峰山
Mahes Khulye
袁辉
罗淑萍
关键词:
基因克隆
生物信息学
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