国家科技重大专项(2008ZX10002-016) 作品数:19 被引量:83 H指数:6 相关作者: 周钢桥 贺福初 张红星 颜贤忠 廖小莉 更多>> 相关机构: 军事医学科学院 北京蛋白质组研究中心 北京大学 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 理学 自动化与计算机技术 更多>>
人microRNA相关的遗传变异与肿瘤 被引量:3 2011年 微RNA(microRNA,miRNA)是新发现的一类进化上高度保守的重要的转录后调控因子,通过调节基因的表达而参与调控细胞凋亡、增殖及分化等生理过程,同时与肿瘤等疾病的发生发展密切相关。近年来研究发现,miRNA、miRNA生物合成通路基因及miRNA的靶基因结合位点的遗传变异(例如单核苷酸多态性和拷贝数变异等)可影响miRNA调控功能的发挥,并产生显著的遗传学效应。文章主要综述了miRNA相关的遗传变异与肿瘤易感性和临床转归等的研究进展。 李佩尧 贺福初 周钢桥关键词:MICRORNA 单核苷酸多态性 拷贝数变异 肿瘤 Ⅱ型糖尿病肾病小鼠肾水提物代谢组学研究 被引量:6 2010年 应用基于核磁共振的代谢组学方法研究Ⅱ型糖尿病模型db/db小鼠已发展到糖尿病肾病时肾脏代谢表型的变化.结合偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA),结果显示,与正常组相比,模型组肾水提物中的乳酸和糖等代谢物的含量显著升高,而谷氨酸、乙酸、胆碱和甘氨酸的含量显著降低,缬氨酸、肌酐、尼克酰胺、苯丙氨酸和酪氨酸含量略有降低.实验结果表明糖尿病肾病动物模型db/db小鼠的代谢特征不同于正常小鼠.代谢组学分析方法作为辅助手段,为糖尿病肾病的发病机制提供了良好的数据支持. 毛璇 张冬娟 管又飞 颜贤忠关键词:DB/DB小鼠 代谢组学 Ⅱ型糖尿病肾病模型db/db小鼠血浆的代谢组学研究 被引量:13 2012年 目的采用基于核磁共振的代谢组学技术研究糖尿病肾病模型db/db小鼠血浆中小分子代谢物的变化。方法用核磁共振技术检测db/db小鼠(6只)和db/m小鼠(6只)血浆中的小分子代谢物,应用模式识别技术对积分数据进行正交偏最小二乘辨别(OPLS-DA)分析及相关性分析,利用MATLAB软件做相关系数图。结果统计分析结果显示,与对照组db/m小鼠相比,试验组db/db小鼠血浆中葡萄糖和氧化三甲胺(TMAO)的含量升高,多种氨基酸含量下降。结合代谢途径分析发现,糖尿病肾病小鼠体内存在氨基酸代谢异常和能量代谢异常,肾脏受到损伤。结论本文所采用的基于核磁共振的代谢组学技术能全面客观地反映糖尿病肾病小鼠血浆中的代谢物变化,潜在的代谢标志物分析及代谢途径探讨将为临床诊断及机制研究提供新思路。 孙立业 毛璇 张冬娟 孙博 管又飞 颜贤忠关键词:DB/DB小鼠 糖尿病肾病 代谢组学 HMGB1在肿瘤转移中的作用及其机制的研究进展 被引量:5 2012年 转移是肿瘤致死的一个重要因素,其发生需要多基因参与、多步骤调控,相关基因及其作用机制的发现对肿瘤转移的预防与治疗具有重要意义。高迁移率族蛋白B1(high mobility group box 1,HMGB1)是一种非组蛋白染色质结合蛋白,在DNA复制、修复、重组和基因转录中起重要作用,在细胞损伤和炎症发生时释放至胞外参与信号转导,调节细胞的生长和分化等。近年研究表明,HMGB1在多种肿瘤细胞和组织中高表达,增强肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移,促进肿瘤的发生、发展,提示HMGB1有可能成为治疗和预防肿瘤转移的靶标。现就HMGB1在肿瘤转移中的作用及其机制的研究进展作一综述。 陈艳美 贺福初 林成招关键词:高迁移率族蛋白B1 肿瘤 RAN基因多态性与广西人群乙型肝炎病毒相关肝细胞癌的遗传关联研究 被引量:1 2012年 目的探讨肿瘤相关基因RAN多态性与广西人群乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌(HCC)遗传易感性的相关性。方法选取位于RAN启动子区rs7132224和3'非翻译区rs14035两个单核苷酸多态性(SNP)为遗传标记;采用SNPstream对340例HBV相关的HCC和361例对照个体进行基因分型;Logistic回归分析计算OR和95%CI。结果①rs7132224、rs14035和HBV相关HCC遗传易感性相关性评价结果分别为OR=1.43,95%CI=1.04~1.98,P=0.02;OR=1.43,95%CI=0.57~4.11,P=0.40;②对人群进行性别、年龄、吸烟、饮酒状态、一级生物学亲属HCC家族史分层分析,发现rs7132224、rs14035和各亚人群HBV HCC发生均无明显相关性。结论 rs7132224和HBV相关HCC遗传易感性显著相关,而rs14035与HBV相关HCC遗传易感性无显著相关性。rs7132224、rs14035与性别、年龄、饮酒状态、吸烟状态、一级生物学亲属HCC家族史在HBV相关HCC发生风险中无交互作用。 孟金凤 李佩尧 张红星 虞立霞 蔡觅 王志富 夏夏 崔英 谢伟敏 周钢桥关键词:RAN 乙型肝炎病毒 单核苷酸多态性 遗传易感性 CyclinD1在肝细胞癌中的表达及与肝细胞癌患者预后的关系 被引量:11 2012年 目的探讨CyclinD1在肝细胞癌中的表达及与肝细胞癌患者预后的关系。方法取133例肝细胞癌患者的癌组织(HCCs)及癌旁组织(PTLTs)病理切片,用免疫组化染色技术分析CyclinD1的表达,统计分析CyclinD1表达强度与肝细胞癌患者临床病理因素之间的关系,并以Kaplan-Meier生存曲线及Log-rank法检测不同CyclinD1表达组的生存差异。最后以单因素及多因素Cox回归模型分析影响肝细胞癌患者预后的独立危险因素。结果免疫组化染色结果发现51例肝癌患者的癌组织中CyclinD1表达阳性,表达率为38.3%(51/133),而在癌旁组织中仅有4例CyclinD1表达阳性,表达率为3%(4/133),肝癌组织中Cy-clinD1表达率显著高于癌旁组织(P=0.01)。Mann-WhitneyU检验发现肝癌组织中CyclinD1的高表达与AFP水平(P=0.006)之间呈正相关,且有统计学意义。而CyclinD1表达与性别(P=0.394)、年龄(P=0.232)、肿瘤大小(P=0.842)、肿瘤数目(P=0.479)、包膜(P=0.085)、脉管侵犯(P=0.331)、淋巴结转移(P=0.168)和Edmondson-Steiner病理分级(P=0.521)不相关;Kaplan-Meier生存曲线发现CyclinD1表达强度与患者生存相关,即表达强者预后差(P=0.001);单因素及多因素Cox回归分析发现肿瘤数目、脉管侵犯、CyclinD1表达是影响HCC患者预后的独立危险因素(P值分别为0.003,0.010和0.017)。结论 CyclinD1在肝细胞癌中表达升高,其表达与肝细胞癌患者预后呈负相关,并且是肝细胞肝癌预后的独立危险因素。 李启炯 宋军民 陆敏 陆敏 刘芳芳关键词:预后 CYCLIND1 DNA修复基因ERCC1在原发性肝细胞癌组织中的表达及临床意义 被引量:1 2012年 目的:探讨切除修复交叉互补基因1(ERCC1)在原发性肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达情况及临床意义。方法:应用免疫组织化学方法检测226例HCC癌组织、65例HCC癌旁组织和17例非癌肝组织中ERCC1的表达情况,并分析其与HCC临床病理因素和预后的关系结果:肝癌组织中ERCC1阳性率为44.2%(100/226),显著高于癌旁组织及非癌正常肝组织中的阳性率(分别为16.9%和5.9%,P<0.05)。有门静脉癌栓组的ERCC1阳性率为66.7%,无癌栓组为42.3%,差异具有统计学意义(P<0.05);但ERCC1阳性表达与性别等其他临床病理特征均无关(P均>0.05)。接受根治术的184例患者中,ERCC1阳性率随着中位复发转移时间(TTR/M)的延长而显著降低(x^2=9.630,P=0.047);ERCCI阳性组TTR/M为10.3个月,而阴性表达组为20.3个月,差异具有统计学意义(P<0.05)。多因素生存分析显示,术前谷草转氨酶>2.5倍正常值、病灶最大径>5 cm和ERCCl阳性表达是HCC患者术后复发转移风险增加的独立危险因素。结论:肝癌组织中ERCCl阳性率显著高于癌旁肝组织及非癌肝组织,其阳性表达与门静脉癌栓形成及术后复发、转移风险增高显著相关。 谢伟敏 房亮 梁安民 陆永奎 周文献 王洪学 胡晓桦 廖小莉 李瑗 张春燕 周钢桥 张红星 黎乐群关键词:肝细胞癌 ERCC1 复发转移 蛋白质组学中质谱数据标准研究进展 被引量:3 2011年 质谱分析是蛋白质组学的一项支撑技术。质谱数据处理过程具有多策略、多处理步骤、多种处理软件的特点,数据处理过程中数据格式不统一的问题给数据交换和整合带来了一定的困难,也给质谱分析平台和质谱数据库的建设带来了挑战。研究质谱数据分析中的质谱数据标准,不仅可以系统地梳理归纳目前分析方法中需要使用的全部数据信息,而且有利于质谱数据分析平台的建设。本文介绍了近几年制定的一些质谱数据标准,总结这些标准各自的特点、不足及应用情况,并展望质谱数据标准可能的发展方向。 马海滨 张纪阳 刘辉 孙汉昌 谢红卫中国人群肝癌的易感基因研究 被引量:7 2011年 以单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)为遗传标记的遗传关联研究是近年来鉴定复杂疾病易感基因的主要策略之一.尤其是新近发展成熟的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS),已被公认是行之有效的系统搜寻重大疾病易感基因的研究方法.军事医学科学院与国内同行合作开展的HBV相关肝癌GWAS结果表明,1p36.22的UBE4B-KIF1B-PGD区域是一个全新的肝癌易感基因区域,证明了遗传易感性在肝癌发生发展中的病因学意义.肝癌易感基因的发现,不仅为深入阐明肝癌的发生机制开辟了新的研究方向,而且为肝癌的风险预测和早期预警研究提供了理论依据;同时,也为后续开发新型的治疗药物奠定了基础. 周钢桥 贺福初 张红星关键词:肝癌 易感基因 全基因组关联研究 单核苷酸多态性 代谢组学技术在疾病研究中的应用进展 被引量:7 2012年 代谢组学是后基因时代发展起来的一门新的组学技术,是系统生物学的重要组成部分。它应用现代的分析技术和数据处理方法对生命体内的小分子代谢物进行全面研究,揭示机体生命活动代谢的本质。与基因组学、转录组学、蛋白质组学不同,代谢组学研究的是生物事件的终点,可以与生物事件建立直接关系。现就代谢组学在疾病诊断、治疗监测、病理研究及器官移植等领域中的应用予以综述。 孙立业 颜贤忠关键词:代谢组学 核磁共振 质谱 疾病研究