陕西省科技攻关计划(2006K02-G11)
- 作品数:2 被引量:4H指数:2
- 相关作者:王学艳王晶钰温肖会刘红彦邓小敏更多>>
- 相关机构:西北农林科技大学四川省兽药监察所更多>>
- 发文基金:陕西省科技攻关计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 鸡新城疫病毒分离株F基因的分子特性分析被引量:3
- 2008年
- 【目的】对新城疫病毒(NDV)分离毒株进行分子特征分析,了解免疫鸡群发生新城疫的原因。【方法】用非免疫鸡胚从病鸡肺脏中分离新城疫病毒;参考GenBank上发表的NDV的F基因序列设计引物,应用RT-PCR方法对新城疫病毒分离株进行扩增,并构建克隆载体,对阳性质粒测序后进行F基因核苷酸及推导氨基酸序列分析。【结果】从发病鸡群中分离到6株NDV,分离毒株间的F基因核苷酸和F蛋白氨基酸同源性分别在99.6%-99.9%和99.1%-99.8%;分离毒株与参考毒株的F基因核苷酸和F蛋白氨基酸序列同源性分别在83.2%-87.3%和90.2%-93.8%;分离毒株F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为^112R-R-Q-K-R-F^117,符合强毒株的分子特征;6个分离株均属NDV基因Ⅶ型。【结论】NDV分离株的F基因已经发生明显变异,与La Sota、Clone-30、V4等常用疫苗株在遗传进化上的亲缘关系较远,这可能是免疫鸡群发生新城疫的重要原因之一。
- 王学艳王晶钰刘红彦邓小敏温肖会姜向阳罗艳
- 关键词:新城疫病毒F基因RT-PCR分子特性分析
- H9N2禽流感病毒陕西分离株HA基因的遗传变异分析被引量:2
- 2009年
- 【目的】对H9N2禽流感病毒HA基因全序列进行分析,了解H9N2禽流感分离毒株HA基因的遗传变异情况。【方法】根据GenBank已发表的H9N2毒株的基因序列,设计了2对H9N2禽流感病毒HA基因特异性引物,运用RT-PCR方法对XL、LF和WN分离株进行了扩增,然后将PCR产物送出进行测序,用DNAstar 5.0软件对测序结果进行了分析。【结果】XL、LF和WN 3株H9N2分离株间HA基因的核苷酸同源性为99.7%-99.9%,推导氨基酸的同源性为99.1%-99.6%;分离株与参考毒株HA基因核苷酸的同源性为96.2%-99.0%,推导氨基酸的同源性为96.2%-98.6%。通过对3个H9N2分离株间HA基因核苷酸序列的比较,发现共有5个位点的核苷酸发生突变,其中4个位点核苷酸的改变导致相应的氨基酸发生突变。HA蛋白的7个受体结合位点比较保守,但是其在551-553位缺失了潜在的糖基化位点。【结论】3株H9N2分离株裂解位点氨基酸序列完全符合低致病性禽流感的特征RSSR↓G,但是LF裂解位点附近333位脯氨酸(Pro)突变为组氨酸(His),即非极性氨基酸向极性带正电氨基酸(碱性氨基酸)转变,裂解位点的变化可能是H9N2禽流感病毒生物学特性改变的分子基础。
- 温肖会王晶钰王学艳熊浩山刘红彦
- 关键词:禽流感病毒H9N2HA基因遗传变异分析