海南省自然科学基金(80431) 作品数:11 被引量:92 H指数:6 相关作者: 王静毅 武耀廷 冀小蕊 郑丽珊 黄秉智 更多>> 相关机构: 中国热带农业科学院 广东省农业科学院 中国农业科学院棉花研究所 更多>> 发文基金: 海南省自然科学基金 国家自然科学基金 农业部南亚热作财政专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 理学 更多>>
香蕉SSR反应体系的优化 被引量:4 2007年 以香蕉品种AAcv Rose为试材,研究了香蕉SSR技术中PCR反应体系的主要成分对SSR扩增结果的影响,并比较了聚丙烯酰胺凝胶及琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物多态性的差异。结果表明:在20μL的反应体系中,各成分的最适用量分别为TaqDNA酶0.5U/mL;Mg2+2.5mmol/L;引物0.4μmol/L;模板DNA20~40ng/μL;dNTPs0.1mmol/L。利用24个香蕉品种验证此反应体系,80g/L的非变性聚丙稀酰胺凝胶电泳检测结果显示,扩增产物在150~300bp之间,不同品种间DNA谱带具有多态性。聚丙稀酰胺凝胶电泳检测的DNA多态性高于琼脂糖。 郑丽珊 王静毅 冀小蕊 武耀廷关键词:香蕉 简单重复序列 棉花EST-SSRs在香蕉中的通用性 被引量:19 2008年 香蕉SSR分子标记开发和应用有限,通过对棉花SSR分子标记在香蕉中的通用性研究。用1343对棉花EST-SSR引物对贡蕉(AA)和野蕉(BB)两个材料进行转移扩增,得到226对有效扩增的引物。进一步用该226对引物对20个香蕉品种和4个野蕉材料扩增,得到了157对多态性引物。157对多态性引物共扩增到1188个条带,平均7.6个;引物的多态信息含量范围在0.58~0.91之间。依据获得的SSR数据,应用非加权类平均聚类方法,在相似系数0.60水平上,将24个品种分为两大类群,类群I是以A基因组为主的品种群,类群Ⅱ是以B基因组和A基因组与B基因组杂交的品种群,证明了棉花EST-SSR分子标记在香蕉中具有通用性。 郑丽珊 石玉真 王静毅 黄秉智 冀小蕊 张保才 袁有禄 武耀廷关键词:棉花 香蕉 聚类分析 香蕉A基因组品种间遗传关系的SSR检测 被引量:15 2007年 应用SSR技术,对32个香蕉A基因组类型品种(系)的遗传关系进行了检测。40对SSR引物在32个品种(系)中分别扩增带数在3~15个,平均每个SSR座位可检测2.99个多态性带;引物的多态信息量(PIC)在0.00~0.88,平均0.62。依据SSR数据计算的品种间遗传距离在0.00%~34.27%,平均12.45%,大多数品种间的遗传变异非常有限,但也存在着遗传差异突出的品种:FHIA25、Yangambi KM5、Pisang Jari Buaya、Rose和皇帝蕉。依据26%的遗传距离,除了FHIA25和Pisang Jari Buaya单独化成1组外,其它30个品种可以分为2组:品种间遗传差异相对较高的组I和品种间遗传差异相对较低的组Ⅱ。Williams与引进的洪都拉斯3号、M931之间,洪都拉斯1号和洪都拉斯2号之间,高脚青芽蕉和高脚顿地雷分别没有区分开来,这可能是同物异名,也可能是同一品种未能分辨的突变体。 冀小蕊 陈业渊 王静毅 郑丽珊 魏守兴 谢子四 武耀廷关键词:香蕉 A基因 SSR 北美海蓬子盐胁迫条件下抑制差减文库构建与分析 被引量:3 2007年 北美海蓬子(Salicornia Bigelovii Torr.)是一种耐盐性极强的真盐生植物,在200mmol/L的Na+浓度下生长,其高度和含汁量是5mmol/LNa+浓度下生长的2倍和2.5倍。为了研究北美海蓬子耐盐的机理和分离耐盐新基因,我们构建了在盐胁迫条件下北美海蓬子基因表达差异的SSH文库。以北美海蓬子种子播种于0mmol/LNaCl MS液体培养基上幼苗(0号材料)的总RNA为Driver,200mmol/LNaCl诱导24h幼苗(2号材料)的总RNA为Tester,运用SMART PCR cDNA合成技术分别合成全长cDNA。将两种cDNA群体进行抑制差减杂交,用T/A法分别构建了盐胁迫相关基因的正向差减文库(205个克隆子)和反向差减文库(235个克隆子)。通过PCR和反式NorthernDot-Blot消除假阳性和重复克隆子,得到在盐胁迫下特异表达的阳性克隆85个。对测序结果正常的81个克隆进行BLASTn分析,其中有70个cDNA序列与已经报道的其它物种的核酸序列具有较高的同源性;另外11个cDNA序列未找到有较高相似性的已知序列。81个cDNA序列中没有与北美海蓬子中已报道的核酸序列有较高的相似性,因此,所有81个克隆序列都是北美海蓬子中的新基因。 李吉涛 龙建琪 叶妙水 张桂和 郭建春关键词:盐胁迫 求粗糙集正域POS_c(D)的表上作业法 被引量:3 2005年 给出了一种非常简洁的求POSC(D)的表上作业方法,此法不仅无须分别求出U IND(C)和U IND(D),而且省略了U IND(C)和U IND(D)之间的比较及求交的程序;最后,应用这一方法研究了评价和预测问题中各因素的合理赋权问题,对中国区域生态水平评价问题进行了权重挖掘,按照所得权重给出了新的评价结果. 张诚一 李固新 张玉俊关键词:粗糙集 信息表 正域 表上作业法 长梗蕉SSR标记的研究 被引量:5 2007年 以云南野蕉(Musa.bilbisiana Colla)为实验材料,应用选择性扩增微卫星(SAM)法分离、克隆50个DNA序列,其中20个非重复,可用。一共20个序列用于特异引物的设计,再从20个序列的23个基因座设计出23对特异引物。研究表明:所采用的开发SSR标记的方法不仅简便、效率高且成本低。此外,5′锚定引物的简并性,引物与设计的特异引物配对后,部分引物对在进行检测时扩增得到的条带不清晰且稳定性较低。 郑丽珊 王静毅 冀小蕊 徐碧玉 武耀廷关键词:香蕉 SSR标记 云南热带地区野生香蕉资源考察及分布现状分析 被引量:13 2007年 通过对云南热带地区的野生香蕉考察发现:在滇东南主要分布着小果野蕉(MusaacuminataColla)、阿宽蕉(M.itinerans Cheesman)、河口指天蕉(M.paracoccinea AZ.Liu et DZ.Li)、指天蕉(M.coccinea Andrews);滇南主要分布着小果野蕉、野蕉(M.balbisiana Colla)、阿宽蕉、阿希蕉(M.rubra Wallich ex Kurz)、指天蕉;滇西南主要分布着小果野蕉、野蕉、阿宽蕉、阿希蕉、指天蕉、血红蕉(M.sanguinea Hooker)、粉芭蕉(M.nagensium D.Prain)。滇西南可能是我国野生香蕉遗传多样性最丰富的地区。滇南光照充足、温度高、雨水多的生态环境,容易使野生香蕉形成大群落。建议对阿宽蕉进行原生境保护,其它野生种进行异生境保护,将主要栽培香蕉的两个野生祖先种小果野蕉和野蕉列为濒危植物进行重点保护。 刘伟良 陈友 王静毅 武耀廷关键词:热带地区 海南岛野生香蕉居群分布与居群内植物组成 被引量:11 2007年 野生香蕉有生长势和抗寒能力等优良特性,是香蕉遗传改良的重要种质来源。如何更好地利用和保护野生香蕉的遗传多样性,是目前急需研究解决的问题。本文调查研究了海南省野生香蕉的居群分布与居群内植物组成。海南岛野生香蕉(Musaitinerans)主要分布在北纬18°45′ ̄19°19′,东经109°22′ ̄109°56′之间,年均降水量1800mm等值线以内的中部山区及其东部的丘陵地带,根据地形地貌、气候特征、植被类型和空间距离等因素,划分为黎母岭、阜龙乡、南高岭、鹦哥岭、百花岭、阿佗岭、大本山和吊罗山等八个分布区域。根据野生香蕉生物学特性的调查,认为海南岛这种大面积分布的野生香蕉为阿宽蕉(Musaitinerans),基因型为AB型。阜龙乡野生香蕉居群内主要植物28种,其中乔本植物4种、灌木植物5种、草本植物8种、藤本植物4种和蕨类植物7种,野生香蕉为明显的单优群落,但也存在植物间的共生性和生长的竞争性。人工压力和生态胁迫是造成野生香蕉遗传资源流失的主要因素,周围自然环境的恶化,也破坏了野生香蕉居群内各动植物的协同进化,建议从维护原生境来保护野生香蕉种质资源,并建立完善的保护体系和野外监测体系。 刘伟良 王静毅 黎明 陈友 武耀廷关键词:居群 北美海蓬子Na^+/H^+逆向运输蛋白基因的克隆及拟南芥转化分析 被引量:11 2007年 Na+/H+逆向运输蛋白在植物耐盐性方面起着极为重要的作用。根据在不同植物中功能相同的同源基因保守序列设计引物,通过RT-PCR方法从真盐生植物北美海蓬子(Salicornia Bigelovii Torr.)中克隆出包括有1683bp的完整编码区在内的2591bp(GenBank登陆号为DQ157454)的Na+/H+逆向运输蛋白基因(SbNHX1)cDNA序列。将该基因编码区序列构建到植物表达载体pVKH-35S-pA上,并通过农杆菌介导转化到模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)中,得到T3代转入单基因种子。200mmol/L的NaCl胁迫培养结果显示,转基因拟南芥在200mmol/L的NaCl胁迫条件下生长状况好于野生型植株,植物表现有一定的耐盐性。 肖前谷 叶妙水 钟克亚 胡新文 郭建春关键词:北美海蓬子 转基因拟南芥 耐盐性 棉花SSR分子标记在香蕉中通用性的研究 被引量:17 2007年 香蕉栽培品种是由尖叶蕉(Musa acuminata Colla,记为A基因组)和长梗蕉(Musa bilbisiana Colla,记为B基因组)这两个原始野生蕉种内或种间杂交后代进化而成的。目前,香蕉SSR分子标记开发的数量和应用研究非常有限,需要开展其它物种SSR分子标记在香蕉中的通用性研究。棉花(Gossypium spp.)是重要的经济作物,已经从基因组和EST开发了大量SSR分子标记。本研究应用1595对棉花SSR引物首先对A基因组的代表品种贡蕉和B基因组的代表品种野蕉进行转移扩增,得到183对有效扩增的引物。然后以20个香蕉栽培品种和4个野蕉品种对183对有效扩增的引物进行多态性筛选,最后得到111对多态性引物,共扩增到797个等位基因,平均每对引物的等位基因数为7.2。引物多态信息含量(PIC)在0.61~0.91之间。应用非加权类平均聚类方法,在相似系数0.61处将24个品种分为两大类群,类群I是以A基因组为主的品种群,类群Ⅱ是以B基因组和A基因组与B基因组杂交的品种群。 郑丽珊 袁有禄 王静毅 冀小蕊 黄秉智 武耀廷关键词:香蕉 棉花 基因组 SSR标记